天地初開，玄黃世界一片混亂，各個種族林立，其中屬龍、鳳、麒麟最為強盛。龍本是盤古血脈所化，霸占整片海域；鳳凰為盤古毛發所化，居住於不死火山；而麒麟則是指甲所化，住在不周山一帶。三族得天獨厚且生而有大能，故此相互不服，為爭奪氣運經常爆發戰爭。
龍族有噴雲吐霧，施雲布雨的法力，且肉體強橫；而鳳凰則能口吐不死火，焚盡世間一切，亦能浴火重生，甚是不凡；三族之中能力最弱的當屬麒麟，但麒麟數量龐大，能騰雲駕霧。因此龍族與鳳族聯合將麒麟幾乎消滅殆盡，但戰爭並沒有因此停止，原來三族由來已久的戰爭是由一位天外來的魔神所挑唆，這位魔神以殺正道，誓必殺盡世間萬物。龍鳳經曆戰爭之後隻剩下極少數老弱，龍族居四海數十萬米以下的深淵不出，鳳則剩餘更少，隻少數有鳳凰血脈的飛禽殘留。但這位魔神並沒有滿足，更加瘋狂地四處殺掠，整個洪荒沒有一處安生之地。
一日，一位來自玉京山的大能，號稱洪元大仙，遊曆山水，觀蒼生受苦，於是心生不忍，遂號召諸多隱士大能共同抵抗這魔神。與這魔神決戰於不周山，最終合眾仙之力將這位魔神擊敗。而這魔神的兩件法器也為洪元所得，其中十二品黑蓮被打碎散落於洪荒各地，而誅仙四劍和魔神的屍身則被洪元煉成了誅仙劍圖。
自此，洪荒再無大的戰爭，但妖族依舊是一盤散沙，各個種族爭鬥也是不斷。三族大戰之後，太陽不斷變大，愈漸發熱，各個大神都想窺其究竟，各顯神通，終不得其果。
一日，太陽終於膨脹到了一個極限，從本體上脫落下來兩隻金烏，兩隻金烏體型龐大，渾身透著金光，散發著太陽真火。金烏生而有大能，一位名叫帝俊，另一位喚作太一；分別持有本命神器河圖洛書和混沌鍾，混沌鍾後來也被稱為東皇鍾（因東皇太一而得名）。兩兄弟憑借著自己的本事很快一統妖族，更是霸占了天空，甚至利用本命法寶創造了威力巨大的周天星鬥大陣，自此妖族天庭誕生。帝俊號天帝，太一號東皇，共同執掌妖族天庭。
從此妖族天庭統一玄黃世界（少數大能除外），在這兩位之下乃是妖師，妖師是鯤鵬。鯤鵬自龍、鳳、麒麟三族鼎力時便一直蟄伏北海，待到三族滅絕以後才大放異彩，其輩分之高，甚於洪荒各妖族，被尊奉為萬妖之師，更是協助帝俊和太一建立妖族天庭。鯤鵬麾下有無數大軍，其中上古凶獸不計其數。”混沌、饕鬄、檮杌、窮奇為上古獸皇級；應龍、白澤、九嬰、鬼車、陸吾、夔牛、畢方、九鳳、九尾狐、朱厭為獸王級；九頭獅子、三頭虯蛟、蠱雕、白虎、螣蛇、商羊、金蟾、山蛛、猙、犼、兕則是族長級。各個獸皇，獸王，族長麾下妖兵更是不計其數，妖族在此輝煌一時。
話說人間界，此時十二祖巫力量強橫，且祖巫好戰，共工與祝融大戰於不周山，共工更是撞斷了不周山，霎時間天塌地陷，天火降臨，天河倒灌，而共工與祝融雙雙隕落。十二祖巫隻剩十位，帝江、句芒、蓐收、燭九陰、強良、奢比屍、天吳、弇茲、玄冥、後土。另一時間，東皇十子遊曆洪荒大地，生靈塗炭。東皇責罰過輕，誇父不滿，遂逐日，東皇之子殺誇父。大巫大羿震怒，傾部落之力打造神箭，射殺了九隻金烏，自己則被眾多妖神合力殺死。從此，雙方結下了不解之仇。
十位祖巫帶領眾族人殺向妖族天庭，玄冥修為最強，與東皇同歸於盡。此一戰，巫妖俱隕，殘留剩餘，有的歸隱，有的歸附玄門。兩族由此勢弱，從此失去了爭霸洪荒的實力。