神羽曆509年，木葉聖皇、麒麟聖皇、海皇妖心、紫金聖皇在聖靈山約戰炎魔神烈焰並在決戰中重傷烈焰。這場決鬥對於已經頻臨毀滅的妖靈大陸而言可謂意義重大，它讓無數陷入絕望中的妖靈重新看到了希望。
第二年，即神羽曆510年，木葉聖皇和麒麟聖皇召集海皇妖心、紫金聖皇、天淵龍皇、神羽妖皇、裂天獸皇、千幻蟲皇、青冥蟲皇、逆鱗蛟皇、聖花妖皇、九頭蛇皇、金牛皇、朱鳥皇、青龍皇、天狐妖皇等近百位妖皇，以及上古神獸一脈的麒麟族、朱鳥族、青龍族、青冥族、天狐族等神獸族，還有古精靈族中的聖火、怒風、紫金、雪影、奔雷、星魂等古靈族共同對抗炎族。
這一場大戰幾乎所有妖靈大陸上的妖靈，各大種族和勢力全部參與了進來，戰鬥持續了半年有餘，炎族最終敗退，雖然沒有全殲炎族，但卻成功將炎族趕回了地底世界。而這一場戰鬥也成為了妖靈大陸有史以來最為慘烈的妖魔大戰。
戰爭總是殘酷的，妖魔大戰尤其殘酷，沒有經曆過的妖靈永遠無法體會。戰後統計的結果讓無數妖靈忍不住黯然淚落。整個妖靈大陸千萬年來沉澱的底蘊幾乎消失殆盡，數十位參戰的妖皇最終幸存下來的隻有木葉聖皇、麒麟聖皇和紫金聖皇三大妖皇，即便擁有半神修為的海皇妖心也沒能幸免，上古神獸族中朱鳥族、青龍族、青冥族宣告滅族，而麒麟族也隻剩下麒麟聖皇一人，古精靈族中聖火、怒風、雪影三族殘存，其他古靈族同樣損失慘重，幾近滅族。
在這場妖魔大戰中，由各類妖靈組成的妖俠工會起到了舉足輕重的作用，妖魔大戰之後，眾多妖俠工會自覺的分散到大陸中各個角落繼續清除那些殘留在地麵上的炎魔，在這種情況下，滿目蒼夷的妖靈大陸再次開始了重建。
神羽曆515年，妖靈大陸基本上算是穩定了下來，為了紀念在炎魔入侵中戰死的眾多妖靈，特別是在同炎族最後一戰中死去的妖皇們，木葉聖皇決定在聖靈山上建立妖靈大陸上最為神聖的妖神殿。
妖神殿自古以來便存在，分散於妖靈大陸各地，最早的妖神殿隻是為了紀念上古妖神太，後來妖神殿成為了妖靈們緬懷祖先和祭祀的神殿。炎魔入侵中，除了位於海域深處的妖神殿外，陸地上各處妖神殿慘遭破壞。
木葉聖皇重建妖神殿的決定第一時間便得到了眾妖靈的擁護，無數妖靈紛紛向聖靈山聚集，不求回報，甘心情願的為建設妖神殿添磚加瓦。
然而聖靈山上的妖神殿同各地妖神殿不同，這裏曾是神羽帝國的帝都所在地，更是通向地下熔岩世界的入口，它建立的另一的意義正是為了防止炎魔一族卷土重來。妖魔大戰中，炎魔神烈焰雖然遭到重創，但卻並未死去，隻是被眾多妖皇合力封印了。
新的妖神殿由木葉聖皇擔任殿主，協同麒麟聖皇和紫金聖皇共同鎮守，而這裏也成為了妖靈大陸所有妖皇的最終歸宿。木葉聖皇曾頒布妖靈大陸最為神聖的妖神殿殿令：凡大陸新晉升的妖皇必須無條件的進入妖神殿中服役百年，否則全大陸妖靈將不承認其妖皇之位。
千百年來，沒有妖皇敢違背這條殿令，所有妖皇也皆以能夠進入妖神殿而感到自豪，甚至很多進入妖神殿的妖皇誓言終其一生絕不離開妖神殿。
聖靈山上的妖神殿其意義的重要性不言而喻，沒有誰希望炎魔一族再次出現，為了區別於此處的妖神殿，後來各大種族中重建的妖神殿皆改名為妖神塔。而聖靈山上的妖神殿也就成了全大陸唯一的妖神殿。