“三校一中心”的體係，是福田區委黨校為適應福田區深入體製改革和加快福田區的發展，培養分企、事業單位骨幹人才而推出的辦學新格局，其既要負責全區黨員幹部和公務員的培訓、輪訓，又要承擔黨校電大的學曆教育以及原人事局、財政局、勞動局、教育局屬下的培訓中心的各項培訓工作，工作極其錯綜複雜。
以培養黨員領導幹部和理論幹部為首要任務，努力培訓提高黨政企幹部隊伍素質，輪訓和培訓黨員領導幹部，培養黨的理論隊伍，是黨校的首要任務。根據時代發展以改革的需要，陳自元帶領黨校的教職員工們緊緊圍繞在改革開放和現代化建設條件下“建設一個什麼樣的黨、怎樣建設黨”這個根本問題，以江澤民同誌“三個代表”重要思想為指導，大力加強全區黨員幹部和理論骨幹的輪訓培訓力度，為福田區建設好一支不僅有知識、懂業務、勝任本職工作，而且忠誠於馬克思主義、堅持走有中國特色社會主義道路、會治黨治政的高素質領導幹部隊伍。
為此根據福田區新時期的需要，陳自元與黨校領導班子的商量後決定，把黨校教學目標定位在學習理論、增強黨性、更新知識、提高能力上。在加快、深化教學改革，提高教學質量上狠下功夫，在實踐中不斷探索適應黨校教育的特點和方法，形成了以學習鄧小平理論為中心，以研究現實熱點問題為重點，以加強黨性鍛煉、提高黨性修養為主線，以教學方式、方法的創新為保障，以改善教學手段為重要條件的比較適合福田區實際和發展要求的教學運行體係：一、緊扣時代脈搏，適時更新和充實教學內容。精心設計體現“毛澤東思想、鄧小平理論以及三個代表重要思相”的培訓核心，並圍繞國企改革、改製開設專題講座；增設“WTO與中國經濟”、“抓著泛珠三角，大力建設國際化大都市”等專題。二、適應發展要求，不斷更新教學方法。采取“內外結合，兩線運行”的形式，大力倡導研討式、答疑式、開放式、互動式教學，形成教學新格局。1.將本校教師重在研究和解決基礎理論問題與外聘實際工作者探討具體實際問題相結合2.把學習理論與解決現實經濟社會發展中的熱點和難點問題相結合。3.把課堂學習與社會考察相結合。通過考察，聯係特區實際，提出精神境界創新、目標定位創新、服務質量創新、用人機製創新等一係列新觀念。三、強化黨性教育，確保培訓質量。選準選好黨性教育的內容。對學員進行科學世界觀、人生觀、價值觀的教育；堅持用廉政勤政與艱苦創業優良作風教育學員，采取多種形式開展黨性教育。
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