對藥是方劑中，常常同時並用的兩味藥或三味藥，如紅花與桃仁、乳香與沒藥等。長期實踐中發現，某兩味藥物配伍，可以增強治療效果，因此常把它們並用，有些形成了固定的方劑。例如黃柏與蒼術配伍名二妙丸，香附與良薑配伍名良附丸等。
在對藥的配伍中，有些對藥兩者的氣味功能基本相同，如防風與秦艽、三棱與莪術等。有些對藥兩者的氣味功用不同，如幹薑與五味子、吳萸與黃連等。
對兩藥性味功能基本相同的對藥，應善於識別兩藥的特性。例如防風與秦艽，辛溫祛風勝濕的作用相同，但各有所長。防風偏於入氣分，秦艽偏於入營血，兩者配伍，取長補短，氣血兼顧。對兩藥性味功能不同的對藥，應善於發現兩藥的統一性。例如升麻與厚樸，兩者一升一降，功用不同，但兩者合用才能宣通氣機，共解中焦痞塞。反之有升無降，或有降無升，都不能達到宣通氣機的目的。
熟悉對藥中兩者的特性和統一性，才能合理使用對藥，以增強療效，或減少副作用。如果了解每組對藥的配伍意義，盲目濫用對藥，或輕率撮合，常可影響整個方劑的作用。例如桂枝與芍藥是一組對藥，但在麻黃湯中隻宜配伍桂枝，而不宜配伍桂枝與芍藥這組對藥。因為麻黃湯的功用是辛溫解表發汗，解除外束的風寒，如果加入酸寒的芍藥，酸味抑製辛散，寒性抑製溫熱，易致發汗不暢，餘邪留連為患。
一、兩藥性味功用基本相同的對藥
防風配秦艽：同為風中潤藥。前者走氣分，行一身之表，解表祛風除濕；後者走營分，行營血經絡，疏肌達表祛風濕。合用兼顧氣血，祛在表之風寒濕。
蕪活配獨活：性同#苦溫，為解散肌表風寒濕邪之藥。羌活入足太陽經，理遊風；獨活入足少陰經，理伏風，兩者表一裏。前者能直上巔頂，橫行肢臂，主身體上部風寒濕；後者通行胸腹腰膝，主身體下部風寒濕。合用祛風勝濕通痹。
銀花配連翹：同為輕浮解散之品。前者芳香，性上達，能透熱上行；後者苦寒，性外達，透熱達於肌表，合用辛涼解表。
藿香配佩蘭：氣味均芳香，前者解表醒脾辟穢，後者和胃化濕辟穢，合用解暑濕穢濁不正之氣。
紫蘇配香附：味同辛香，均入血分理氣。紫蘇長於琉表，解散外寒，香附長於行裏氣，消滯散壅，合用治外感兼內傷，胸隔滿悶。
防風配荊芥：辛溫散風之性相同。防風入氣分，疏風勝濕；荊芥入血分，疏風散邪。合用氣血兼顧，疏風解表，見荊防敗毒散。防風與荊芥各有專司，治產後血暈的華佗愈風散用荊芥，不能用防風，因荊芥入血分；治衛虛感冒的玉屏風散用防風，不當用荊芥，因防風走衛分。
麻黃配細辛：前者入足太陽氣分，解表發汗；後者入足少陰血分，溫經蠲飲。合用解表散寒蠲飲，多用於肺寒痰咳。如小青龍湯。
桑葉配菊花：辛涼之性相同。前者入肝達肺，長於散風；後者入肺達肝，偏於清熱。合用疏風清熱宣肺治風溫初起之咳嗽。如桑菊飲。
生薑配半夏：名小半夏湯見《金匱要略》，前者行水散寒止嘔，後者化痰降逆止嘔，合用治痰飲嘔吐。
陳皮配半夏：同為化痰藥。前者理氣化痰，偏於濕痰；後者燥濕化痰，偏於寒痰。合用化寒濕之痰，見二陳湯。
蒼術配厚樸：苦溫化濕之性相同，前者能發散風濕，燥濕走表；後者能破氣降逆，行氣走裏。合用除濕散滿，治濕阻脾胃，胸腹滿悶。
砂仁配蔻仁：性同苦溫，均入脾胃，芳香理氣。而前者兼能入腎，長於止嘔降逆；後者專入脾胃，長於暖中止痛。合用暖中和胃疏脾。
良薑配香附：名良附丸（見《良方集腋》）。前者入脾胃，行氣分，除寒平嘔；後者兼入肝，行血分，理氣開鬱。合用理氣散寒，治胃脘痛、脅痛。
陳皮配青皮：前者性較緩，入脾肺，行脾理氣，偏於中上焦，燥濕化痰；後者性較猛，入肝膽，疏肝破氣，偏於中下焦，破氣散結。合用肝脾兼顧，疏肝理脾，燥濕化痰。
附子配肉桂：兩藥均辛甘大熱，溫陽逐寒。附子通行十二經，功能回陽；肉桂入肝腎二經，直達下焦，善引火歸原。合用壯命門之火。亡陽汗多不宜用肉桂。
小茴配萌蘆巴：均能散寒治疝。小茴長於散新寒卒疾，葫蘆巴長於治沉寒痼疾。合用散下焦寒濕，治寒疝和小腹寒痛。蓽撥配良薑：性同辛溫，溫中散寒。前者偏於治腸胃寒痛，並治水飲；後者偏於治胃脘寒痛，並能消滯。合用治胃腸寒痛。
人參配黃芪：甘溫之性相同，均為補氣要藥。人參補氣兼能養陰，氣虛欲下脫者，用之為宜；黃芪補氣兼能扶陽，氣虛欲外脫者，用之為宜。前者長於止瀉，後者長於固衛斂汗。合用功資脾肺，氣純味厚，大補中氣，見十全大補丸。
白術配蒼術：溫燥之性相同。前者甘溫，補脾燥濕，長於補脾；後者辛溫，燥濕健脾，偏於燥濕，合用健脾燥濕。見李東垣之升陽除濕防風湯。