這是一個不一樣的世界，一個寶可夢與人類和睦相處的世界。
在很久很久以前有一位寶可夢阿爾·宙斯，後來被人們所稱之為創世神，他來到這個世上，創造了很多的神奇寶貝，而且為了維護這個世界的和平還特地製造了能與自己力量匹敵的寶可夢，分別是掌握時間的帝牙盧卡以及控製空間的帕路基犽……亞克諾姆、由克希和艾姆利多，分別代表共存於現代的人類和神奇寶貝之中的意誌、知識與感情。它們潛入了被稱為立誌湖，睿智湖，心齊湖的湖泊底部，因此被稱為“湖之眾神”。還有一些連阿爾·宙斯自己都不知道的寶可夢存在。帝牙盧卡和帕路基犽兩位代表就聽從阿爾·宙斯的命令一直默默的做好自己的工作(維持時間與空間的秩序)。就這樣人類與寶可夢和平地過著幸福的生活，而且人們為了感謝創世神特地在神密而又隱秘的山上打造了神殿（後來隨著時代的發展也被人們叫做槍之柱）。
有一天，天上突然降落了大量的隕石，隕石與大氣層摩擦而產生火花而又飛快的降落，就這樣大地上變得塗炭生靈，就在這時阿爾·宙斯看到這一幕不禁歎氣，為了保護人們，他從異空間穿梭過來以自己的力量製造了保護屏障，不過天上的隕石越來越多這樣下去根本撐不了多久，於是他用了所有的力量，力量化作了十八塊屬性顏色各不相同的石板，說是石板不過其材質看起來更想是寶石一般散發著璀璨的光芒，這十八塊像寶石一般的石板圍繞在創世神的周圍，他迅速的飛翔了天空，借助十八塊石板的力量終於化解了這場危機，但阿爾·宙斯也由於消耗了自己大部分的能量去往異空間修煉並逐漸恢複自己的傷勢，就在這是以我老者走了過來，他為了感謝創世神的拯救了這片美好而又純淨的土地告訴他，在前麵不遠處有一座泉水名叫隱湖之泉，對治療傷勢和淨化心靈有幫助。
阿爾·宙斯聽了老者的話休息片刻便出發了，他來的了這個叫隱湖之泉的地方，慢慢地走進了湖水中央，果然，他發現這泉水對治療傷勢有很大的幫助，並且把自己身上存在的暗黑力量也排出了體內，漸漸地這股黑色的團子由於這個泉水給了生命變成了一直寶可夢騎拉帝納，也就是冥王龍，可以說是阿爾·宙斯身體的一部分，這力量也理所當然的強大，不過冥王龍一直想要製造一個和現實世界相反的影子世界，可是阿爾·宙斯並不允許任何人破壞這個世界的秩序，由於騎拉帝納這一殘暴的行為，於是他們倆最終發生了衝突，阿爾·宙斯與騎拉帝納最終展開了一場較量，雖然阿爾·宙斯的力量還沒有完全恢複，但還是可以戰鬥的，不過就有些吃力了，經過了兩天兩夜的戰鬥，終於阿爾·宙斯戰勝了騎拉帝納，這個世界也經過了漫長的兩天黑夜終於變成了白天，阿爾·宙斯為了不再讓冥王龍繼續擾亂世界的秩序，用盡了最後的力量，同時十八塊不同的石板又在身邊圍繞著散發著強烈的光芒，他用著這最後的力量將冥王龍封印在了另一個次元之中，也許他是想讓冥王龍好好地反省一下自己的所作所為。最後，阿爾宙斯創造了金剛玉魂、白玉魂和白金玉魂，並在初始之間陷入了長眠。同時這十八塊不同的石板也散落在世界的各個角落，就這樣世界的秩序被繼續守護著。