曾經有一對姐妹，從誕生的那一刻就被幸福包裹。她們的母親非常疼愛兩個自己創造出來的孩子，便把自己脖子上的項鏈取下來其中兩片寶石注入了兩個女兒體內。
至此，所有深海的棲姬都要服從這對姐妹，包括過去母親創造的失敗品女兒。無數深海棲姬稱呼這對姐妹花為“深海之女”，無微不至地照顧這對姐妹花。
就這樣時光流轉，也許過去了一百年，也許過去了兩百年，甚至可能是五百年。大海上開始出現了鋼鐵做的人類艦船，而這對姐妹記憶中人類還在使用簡陋的風帆。
直到某一，一批手持能噴射鐵彈珠的人類闖進了姐妹兩人居住的海島。姐妹兩人看到這麼多人類，慌忙中出求救呼喊。周圍海域的深海棲姬全部靠近過來，但那時候的深海棲姬並沒有武器概念，它們使用古老的寶石力量，毫不畏懼地向人類登6艦隊起了攻擊。
“皇國未來在此一戰！掌握了砂之女神的力量，皇國將下無敵。不用害怕黑色的怪物，槍彈能輕易殺死它們！”
人類中像是指揮官的人，高喊著這番話語。最初還害怕不已的士兵，立刻就組織起了密集的火力網，子彈與炮彈打在脫離艦體的深海棲姬身上，將昔日兩姐妹的養育者們成批殺害。
幾千年來沒進行過大規模戰鬥的深海棲姬當然沒見識過熱兵器的殺傷力，還以為對方跟過去擅闖的土著漁民是一個戰鬥力級別。戰鬥變成了一麵倒的屠殺，タルヌリチ五種深海棲姬的屍體堆滿了半座海島，它們沒有畏懼的心理，因為敵人要傷害深海之女，所以依照深海的意誌命令，要不惜一切代價保衛兩姐妹。
“不要讓怪物近身！保持陣型，射擊！”
殺戮持續了整整兩，過一萬個深海棲姬倒在了海島上，黑色的鮮血將整座海島染成了黑色。
“！！!!!”一隻從其他海域趕來的ヲ成了最後能保衛兩姐妹的深海棲姬，它是兩姐妹模仿自己做的新型深海棲姬，能夠在自己的帽子型器官裏孵化出型砂蟲，這也是日本軍人第一次遇到能遠距離攻擊的敵人。
“快把那隻怪物幹掉！”
有幾名身穿白大褂的非軍人混在軍隊裏，對藏身在洞穴裏的砂之女神的寶藏虎視眈眈。
科學家可以瞎指揮，前麵戰鬥的士兵麵對會自爆的危險毒蟲，沒一個敢上前，最後還是靠運來山炮，一頓亂轟把擋路的ヲ幹掉。
“這可是沒見過的深海棲姬，你們怎麼能把它炸成碎片？”科學家還在向下達炮擊的指揮官大呼叫。但很快那群帝國研究院的科學家就安靜了下來，進去搜查的士兵押著兩個女孩走出了洞穴。
“人類？”
年輕的研究院副院長北村教授先上前檢查，兩個女孩看起來像是黃種人，提取到的血液細胞和頭皮細胞都跟人類不同。
更加讓北村教授興奮的是，他前幾分鍾采集血樣在兩個女孩手上劃了一刀，結果現在傷口已經愈合了。
很強的恢複能力。北村教授毫不客氣地拿來一把長刀，一刀捅在其中一個女孩的腹部，將她的腸子截取了一段。然後神奇的事情再次生，腸子自己慢慢連接起來，而腹部的創口也在十五分鍾後徹底愈合。
沒理會兩個女孩嚎啕大哭，北村教授又趕忙看了下取樣的腸子，已經變成了黑灰。
“北村教授，你要做實驗回去再進行吧。”一個七八歲大的孩子走出了人群，站在兩姐妹麵前。孩帶著黑色的頭巾和一個黑鐵麵具，看不清容貌，甚至連聲音都被麵具處理過了。
“那些就是你最在乎的‘砂之寶石’吧？”
另一群士兵從洞穴裏抬出了一袋子黃色寶石，在陽光下閃閃亮。孩清楚地知道那些寶石隻是“深海之女”誕生時候破碎的繭。
“沒錯！就是這種神話中的寶石！”
不隻是北村教授，其他研究院的人也都目光直愣愣盯著那袋寶石，恨不得將其放進自己的口袋。
“‘黑’大人，這次全靠你們海軍出力，我們取得研究進展一定第一時間與海軍合作分享。”
被稱為“黑”的孩，打量著兩個女孩。“我能感覺到這兩個非人類生物蘊含了強大的力量，可別在研究中弄死了，北村教授。”
“是，一切聽從‘黑’大人的命令。”
瑟瑟抖的姐妹倆就這樣被關在鐵籠裏，離開了她們生活的海島，脫離了母親的聯係。
那一年是1895年，正值日本在第一次日中戰爭中大獲全勝，豐厚的戰爭賠償金使得日本海軍得以與西方國家展開軍備競賽。
僅僅五年後，第一位艦娘誕生，傳統士族出身的一名海軍女軍官成為了當時出雲號的契約者，並且主動放棄自己的名字，改名出雲。也是從那時起，艦娘開始6續出現，並且在日俄海戰一舉成名。