月經病的發病原因複雜多樣，中西醫有著不同的認識。中醫學認為，主要是因氣血虛弱、肝鬱氣滯、瘀血阻滯、血熱妄行及腎氣虧虛所致；西醫學則認為，與內分泌功能失調、卵巢功能、器質性病變或藥物等的影響有關。
（1）中醫病因
①氣血虛弱。素體虧虛，過度勞倦，損傷脾氣，氣血生化之源不足；或大病、久病、大出血或長期慢性出血，都可使氣血不足而發生月經病。如脾氣統攝無權，可致月經先期量多，或崩中漏下；若衝任血少，胞脈空虛，可致月經後期、量少或閉經、痛經。
②肝鬱氣滯。平素性情急躁，肝氣抑鬱，血行不暢，衝任阻滯，可致月經後期、量少、痛經、閉經；如疏泄失職，氣血蓄溢失常，則可引起月經先後不定期；若肝鬱脾虛，土受木抑，還可導致經行泄瀉。
③瘀血阻滯。氣為血帥，氣滯日久，則瘀血停留，或因感受寒冷，血為寒凝，胞脈阻閉，即可發為月經後期、量少、痛經或閉經；若證情曆久，瘀血不去，新血不得歸經，又可導致崩漏。
④血熱妄行。素體陽盛，過食辛辣，內蘊邪熱，或肝鬱化火，熱迫血行，則能引起月經先期、量多，或崩漏下血；若氣火炎上，載血上行，還可引起經行吐衄。
⑤腎氣虧虛。先天不足，體質虛弱，或早婚多產，損傷腎氣，衝任虧虛，則可致月經量少或閉經；如腎失閉藏，衝任不固，又可引起崩漏下血；婦女隨著年齡的增長腎虛逐漸顯現，若腎虛陰陽不得維係，可引起絕經前後諸證。
（2）西醫病因
①內分泌功能失調。主要是下丘腦垂體卵巢軸的功能不穩定或有缺陷，內分泌功能失調，即出現月經病。
②卵巢功能。育齡期女性月經不調一般都是因為卵巢黃體功能不強，常表現為有周期，但周期縮短，或者月經量比較多。
③器質性病變或藥物。包括生殖器官局部的炎症、腫瘤及發育異常、營養不良、顱內疾病；其他內分泌功能失調，如甲狀腺、腎上腺皮質功能異常，糖尿病、席漢病等，肝髒疾病及血液疾病等。使用治療精神病的藥物，內分泌製劑或采取宮內節育器避孕者均可能發生月經不調。某些職業，如長跑運動員容易出現閉經。此外，某些妊娠期異常出血也往往被誤認為是月經不調。