影響月經的藥物有很多，凡能影響卵巢功能和子宮內膜的藥物，都會影響月經。影響月經的藥物主要包括激素類和抗癌藥兩大類。
（1）激素類藥：性激素的影響最大，常用的有雌激素、孕激素及雄激素。用藥期間月經都有變化，甚至停藥之後，其影響還能持續一段時間。例如，避孕藥含有雌激素及孕激素，或隻是孕激素，服藥期間可以人為地控製月經來潮的時間，但有時會發生閉經或停藥後閉藥。因此，當服用這些藥物期間，或停藥不久出現了“月經不調”時，不必急於檢查，隨著時間的推移，藥物的作用逐漸消失，月經可以自行恢複。如果停藥後3個月月經尚未恢複，再進行檢查。
糖皮質激素也會影響月經，一般發生在較長時間用藥之後。由於此類藥用於治療全身性疾病，即使對月經有些影響，也不能因此停止治療。隨著全身性疾病的好轉康複，停藥之後，其影響可逐漸消退，月經會逐漸恢複正常。
甲狀腺素過量時也會影響月經，但為了補充身體的不足，服用後可以調整原來不正常的月經。
（2）抗癌藥：此類藥在殺滅或抑製腫瘤細胞生長的同時，對正常細胞也有殺傷作用。因此，在用藥期間或用藥後不久，身體內的各種功能都受抑製，最明顯的是血液和性腺係統，女性表現為月經不調或閉經，停止用藥後可以自行恢複正常。