（1）根據月經不調、痛經、閉經、崩漏、月經前後諸證、絕經前後諸證等月經病患者病情和體質的不同，選擇合適的穴位和艾灸方法，嚴防有艾灸禁忌證的患者進行艾灸治療。艾灸療法常用於虛證患者，對中醫辨證屬實證者，應謹慎用之。施灸時取穴要準確，灸穴不宜過多，火力要均勻，切忌亂灸、暴灸。同時要注意嚴格消毒，防止感染發生。
（2）施灸的順序，一般是從上至下，先背部、後腹部，先頭部、後四肢，先灸陽經、後灸陰經，在特殊情況下則可靈活運用，不必拘泥。對皮膚感覺遲鈍的患者，施治過程中要不時用手指置於施灸部位，以測知患者局部皮膚的受熱程度，便於隨時調節施灸的距離，避免燙傷。
（3）施灸過程中要嚴防艾火滾落燒傷皮膚或燒壞衣服、被褥等，施灸完畢必須把艾條、艾炷之火熄滅，以防複燃發生火災。施灸後還要做好灸後處理，如果因施灸時間過長局部出現小水皰者，注意不要擦破，可任其自然吸收；如果水皰較大，可局部消毒後用毫針刺破水皰放出皰液，或用注射器抽出皰液，再塗以甲紫，並用紗布包敷，以避免感染等不良反應發生。
（4）艾灸療法治療月經病的作用有限，臨床中應注意與藥物治療、飲食調養、情誌調節、針刺療法、起居調攝等其他治療調養方法配合應用，以發揮綜合治療的優勢，提高臨床療效。