艱難的使命自3月中旬起，聯保部隊陸續進駐指定位置，到6月上旬1.4萬餘人全部到位。聯保部隊的主要使命有兩大項：一是軍事使命，包括監督衝突雙方在保護區內撤出部隊或遣散在那裏有駐地的地方部隊並接觸其武裝；排除在保護區內的地雷。二是民事和警事使命，主要包括協助難民遺返家園和在保護區內重建地方警察及維護社會秩序。聯保部從於7月初完成了在保護區內的全部接管工作，並在執行軍事使命方麵取得進展，但在執行民事和警事任務方麵仍因難重重。
南斯拉夫成為聯合國自成立以來第二個派遣部對較多的國家。60年代曾向紮伊爾（當時稱剛果）派出了2.8萬人的部隊。從此，克羅地亞境內的武裝衝突遂告基本平息，保護部對的作用初見成效。
好戰的塞族
在克羅地亞衝突日趨平息的同時，波黑境內的武裝衝突卻愈演愈烈，逐漸成為南斯拉夫內戰的主戰場，國際社會的調停活動也隨之轉到了波黑衝突上。早在1992年2月，歐共體就在海牙和會範圍內開始舉行波黑和會，推動波黑衝突三方達成了多項停火協議，但墨跡未幹，炮聲又起。從1992年3月開始不時發生武裝衝突，4月爆發全麵內戰。1992年4月24日，聯合國安理會決定向波黑共和國派遣100名軍事觀察員，以監督執行4月23日波黑各方達成的停火協議，從而拉開了聯合國在波黑漫長而又艱難的維和行動的帷幕。
波斯尼亞和黑塞哥維納地處南斯拉未的中腹地帶，麵積僅有5.1萬平方公裏，人口480萬，其中穆斯杯占43%，塞族31%（主要信仰東正教），克族17%（主要信仰天主教）。其複雜的民族構成和宗教文化特征，簡直就是一個南斯拉夫的縮影。曆史上這裏就是多種文化的交彙處，不停地有完全不同麵貌的統治者征服這裏，並以自己的麵貌塑造著這裏的形象。自古以來巴爾幹就是歐洲的火藥桶，而這裏就是火藥桶裏的引信。
1992年3月3日，波黑議會在塞族議員抵製的情況下宣布獨立，三族矛盾開始激化。4月6日和7日歐共體和美國相繼承認波黑獨立。波黑塞族立即宣布成立“塞爾維亞波黑共和國”，並脫離波黑而獨立。遭到西方國家的強烈反對。4月7日，波黑內戰全麵爆發。
以塞爾維亞和南斯拉夫人民軍支持的波黑塞族和克羅地亞支持的波黑穆克兩族為兩方，展開了激烈的戰鬥。這是自二戰以來，歐洲發生的最大的局部戰爭。戰爭中出現了駭人聽聞的戰爭暴行。
聯合國緊急介入
聯合國緊急地介人了波黑戰亂的調停活動。4月，安理會召開緊急會議，要求外部勢力停止對波黑的一切幹預，決定立即派遣100名軍事觀察員前往監督波黑三方實施經歐共體調停達成的停火協議。5月15日，安理會通過決議，呼籲南人民軍和克羅地亞地方武裝撤出波黑。聯合國駐紮在薩拉熱窩的保護部隊代表也積極進行斡旋，推動波黑三方達成了多項停火協議，但後來所有協議都變成了一紙空文。鑒於波黑局勢的嚴峻性，聯合國秘書長決定建立一個專門的危機指揮部，並規定每周至少舉行3次會議，以監視南的情勢和協調聯合國在南危機中的作用。5月22日1，加到主持召開了首次會議。
5月30日安理會又通過了第757號決議，決定對南斯拉夫實行廣泛的製裁，包括實施石油禁運、中止一切經濟往來和航空聯係等重大製裁獵施。決議要求為不受阻礙地運送人道主義援助物資提供方便，及在薩拉熱窩機場建立安全區。
安理會於6月8日通過758號決議，決定擴大聯保部隊的使命，即接管薩拉熱窩機場的運營並負責其安全。這樣，聯合國在前南斯拉夫地區的保護區就由4個增至5個。6月29日安理會通過761號決議，決定再派1000名維和部隊，負責接管原南人民軍撤離的薩拉熱窩機場。7月初，一個1000人的加強步兵營、60名軍事觀察員、40名民事警察及有關工程技術人員部暑到位。7月13日安理會通過764號決議，向拉熱窩增派500人的維和部隊（法國、埃及、烏克蘭各一個步兵營組成）以確保機場的安全和人道主義援助物資的送達。
安理會8月7日又通過769號決議，決定擴大聯合國駐克羅地亞保護部隊的編製和權力，以阻止難民湧入克羅地亞聯合國保護區。力此增加800餘人的聯接部隊，其中包括184名警察、276名移民官員、276名海關官員及約80名行政和司法人員。至此，駐前南斯拉夫地區的聯保部隊總數已達1.6萬餘人。
8月13日，安理會通過了770號決議議，授權成員國可以使用“一切要措施”以確保向波黑提供人道主義援助。“一切必要措施”中包括使用武力。
9月14日，聯合國安理會又通過776號決議，授權聯合國秘書長加利向波黑增派6000人的聯合國部隊，以武裝護送緊急援助物資運到波黑各地。在安理會表決776號決議時，中國、津巴布韋和印度投了棄權票。到10月實部署了7100人。
10月9日，安理會又通過了一項禁止在波黑領空進行軍事性飛行的決議，並要求聯保部對負責監督這一禁令的執行。