林公啟程西行，在路無非曉行夜宿，饑餐渴飲，好容易到了伊犁戍所。這本是準部境地，從乾隆中年始入版圖，辟作新疆省。地麵廣闊，人口稀少，山麓河濱，頗多沃壤，且與蒙古、西藏唇齒相依。全省計分八道、四十九縣、二設治局。清廷早想竭力經營，此次林公謫戍伊犁，道光帝知他是個有用的賢才，今因公罪遣戍，正好命他去開辟新疆，必有成效，所以特地戍往伊犁。林公到了塞外，徑抵迪化省城，見過新疆巡撫，文武二差官呈繳文書，領取回文，回京複命不提。
那林公和鄭氏夫人就在迪化省城居住。隔不多時，接奉朝旨，命公戴罪立功，勘辦開墾事宜。林公辦事素來認真，奉到了這道上諭，馬上向新疆巡撫借用兩個熟悉全省地理的辦事員，命作向導，周曆全省八道，履勘瘠地沃地，何處宜種植，何處宜畜牧植林。先巡視迪化道屬十縣，勘得烏魯木齊水草豐甘，頗多未曾開墾的田地；哈密為玉門西首的要地，以產瓜為名，不過河流甚少，耕地全賴雪水；綏來多金銀礦，藏富於地，未曾開辟，山石中多蘊綠玉。次勘伊犁道、塔城道、焉耆道、阿先蘇道、喀什噶爾道、和闐道、阿山道。林公周曆三萬餘裏，勘得阿克蘇土地廣沃，果穀豐登；和闐肥沃宜農，百穀、棉花、瓜果出產甚多。勘察既畢，回省與中丞商量開墾事宜。林公說道：\"本省土地肥饒，極宜種植，所惜地多沙漠，缺少河流，土性雖然肥沃，隻因無水灌溉，故多棄置，甚覺可惜。兄弟愚見，若欲開墾，當以振興水利為先。\"中丞也深以為然。林公於是規劃河道，招工開浚，每段派一監工員，自己周遊巡視，實事求是，督工雖嚴，但待人和藹，恩威並施，故在事人員個個樂於聽命。等到開河竣工，又召佃耕種，相度地勢，分種五穀，這正所謂因地製宜，故種植之物皆能異常繁榮。當地人民，又多了一種生計，新疆的出品也驟然增加了不少，頌聲載道，民間著實感戴。林公公餘以筆墨消遣，在省文武及紳士求他書聯題詠的，戶限為穿。那時風行率更體，林公所書，完全脫胎於歐陽詢，所以大家都視為珍寶。伊犁一般的箋紙店，莫不利市三倍，不過三四個月，林公的手跡已傳遍冰天雪地中了。
林公在伊犁勘辦開墾，事無大小，都是親身監察，很廣大的沙磧荒地，漸漸地盡成沃壤膏腴。不料內地極繁盛的省份，卻被英兵擾亂得不可收拾。這是中國的第一次失敗，也就是國恥史的開宗明義第一章，就是中國現在之國弱民貧，也起始於此，這是何等痛心的事啊！中國的貧弱，一是媚外屈服，二是鴉片貽害，林公當時早已見到，故有\"鴉片不絕，行之十年之後，文無可用之士，武無可戰之兵\"的話。惜乎不能見用，如其照他的計劃辦理，中國早已富強了。
再說當時自林公謫戍伊犁，首輔王鼎憤而屍諫歸天，權奸穆彰阿遂得肆無忌憚，奏請諭飭各直省裁兵節餉，以為和英國議和通商，養兵也無用處。道光帝偏信讒言，嚴限各直省督撫裁兵節餉。哪知奕山奉派赴粵，被英兵殺得大敗，不得已而與義律議和，償還六百萬兩，議定就廣東一省罷兵，以外各省概不在內，清廷隻道和議已成，全國可以無事。
且說英領事義律同司令伯麥，一麵率兵艦退出虎門，開辟香港英國的商埠，恢複廣東貿易，一麵派漢奸入京，探得裁兵消息。伯麥暗想：\"這是侵掠的好機會，豈肯輕輕放過？\"便和義律商量，乘此戰勝餘威，進兵北征。伯麥就遣使回國，奏明英王，征調印度艦隊來粵，會齊原有兵艦，起碇擬向北洋進發。哪知駛行得不多幾時，還沒有離開粵海，忽遇颶風，沉沒了幾隻兵艦，飄失了幾隻小船，清兵撈得了幾件帆桅，奕山、祁土貢就張皇入奏，輕事重報，說什麼翻船無算，浮屍蔽海。道光帝覽奏，迷信海神有靈，頒賜藏香匾額。那伯麥遇颶風失事後，不得不照實奏明英王。英王就派濮鼎查來華代義律職，又令海軍少將巴爾克代伯麥為司令官。濮鼎查和巴爾克奉派來粵，會同臥烏古，帶領軍艦運送船等共計三十六艘，遊弋閩海，進攻廈門。前任閩督鄧廷楨也因焚毀鴉片，得罪朝廷，與林公同時革職。新任總督顏伯燾也是個熱心拒外的好官，聽得英兵遊弋閩海，連忙遣兵調將防守海口。