五是要特別重視招撫少數民族人員。他於順治十五年三月初五，特諭平西王、羅托、濟席哈、趙布泰、李國翰等將帥說：“朕夙以奉天討罪救民水火為心，是以特命爾等率師南征，剿撫機宜，俱載前諭。今念貴州等處，民苗雜處，當先加意撫綏，安輯民心，爾等率領大軍，經過府州縣及土司蠻峒等處地方，當嚴行約束官兵，凡良民苗蠻財物，及一草一木，勿得擅取，惟務宣布仁恩，使彼樂於歸附。倘官民人等不遵紀律，仍行搶掠者，即加處治，以示懲戒。爾等所領漢兵，一並嚴行禁飭。其未辟地方，須多發告示，遍行曉諭。爾等受茲敕旨，當恪遵奉行，勿致擾害地方，以副朕除暴安民至意。”《清世祖實錄》第115卷第14、15頁。
帝之此諭，顯然是采納了經略洪承疇的建議，洪於順治十五年正月十八日奏稱：“進取大事，首以收拾人心為本，欲收拾人心，先以約束官兵秋毫無擾為本”，“必先得土司苗蠻之心，而後可認為一勞永逸之計也。”這也可見留用洪承疇是十分明智的。《明清史料》甲編第6本，《經略洪承疇揭帖》(順治十五年正月十八日)。後當打下貴州欲進雲南之時，帝又於順治十五年十二月二十七日，敕諭信郡王多尼、平西王吳三桂、征南將軍趙布泰三路大軍主帥說：“朕以南服未定，特命王等率大軍進討。湖南、四川、貴州、雲南等處地方，所有土司等官及所統軍民人等，皆朕遠徼臣庶，自寇亂以來，久罹湯火，殊可憫念。今大兵所至，有歸順者，俱加意安撫，令其得所，秋毫無有所犯，仍嚴兵丁，勿令掠奪。其中有能效力建功者，不靳高爵厚祿，以示鼓勵。王等即刊刻榜文，遍行曉諭，使土司等眾，知朕軫恤遐陬臣民至意。”《清世祖實錄》第122卷第15、16頁。這就減少了阻力，不少土司和土著人員擁護清軍進滇，“運交米糧”，向導引路，極有利於清軍的前進。
以上順治帝采取厚待孫可望、留用洪承疇、任用得力將帥和乘機及時出兵安民撫“夷”的四項帶有方針性政策性的重要決定，實踐證明是十分正確的，起了很大作用，為大軍迅速、順利攻取雲貴，奠定了堅實的基礎。
在順治帝的正確指導下，三軍將士奮勇廝殺，軍事進展很快。戰爭的第一階段是取黔定川。順治十五年二月，經略洪承疇與寧南靖寇大將軍羅托會師於湖南常德，抵辰州，收複沅陵、瀘溪、麻陽、黔陽、漵浦諸縣，進軍沅州，敵將馬進忠退走，又檄偏沅巡撫袁廓宇招降靖州，並苗兵赴鎮遠二十裏山口堵禦，敵將馮雙禮所遣之總兵馮天裕、關廷桂等先後自平越降，“沿途擒斬收降甚眾”，四月抵貴陽城中，敵方“文武官俱先遁”。洪承疇奏報捷訊說：“自常德、辰、沅至鎮遠、貴陽，重關高嶺，石徑尖斜，大雨將及半月，泥濘三尺，滿洲兵謂從來出征，未有如此之難，馬匹疲斃未有如此之甚，然皆不顧艱險，奮勇當先。漢軍、綠旗兵緊隨而進。不五十日剿逆撫順，貴州全省底定，皆皇上德威遐暢之所致也。”《清史列傳》第3卷，《洛托傳》；第78卷，《洪承疇傳》。羅托亦奏稱：克複湖南沅、靖等處，進取貴州省城及平越鎮遠等府，“共招降偽官兵丁四千九百九十餘人、男婦九千八百餘名口，獲馬一千四百餘匹、象十二隻”。由廣西進取的征南將軍趙布泰，亦奏報大兵已抵貴陽，“所過南丹州、那地州、撫寧司各土司兵民，及獨山州官民，俱來就撫”。《清世祖實錄》第117卷第23頁。
比較麻煩一點的是川軍。平西王吳三桂、一等侯墨爾根侍衛李國翰於十五年三月統軍從陝西漢中出發攻蜀，由南郡、西充至合州，擊敗敵軍都督杜子香，攻下重慶，再進兵銅梓，敵將興寧伯王興、總兵王友臣迎降，還有侯、將軍等帶家口七千餘降，以及水西安慰使安坤等具啟投誠。大軍進克遵義，敗敵將劉鎮國，獲糧三萬石，降兵五千，五月又破楊武於開州，進招水西、藺州各土司。這時南明永曆帝之大學士文安之，複督大順軍餘部“川東十三家營”及“偽侯譚弘、譚誼、譚文等，以舟師進襲重慶”，吳三桂還兵解救，炮擊敵船，“傷死甚多，賊眾逃遁”，“譚弘、譚誼殺譚文以降，諸部解散”，四川基本平定，七月吳三桂複屯遵義。第一階段戰事至此結束。《清世祖實錄》第116卷第6頁，第120卷第7頁，第123卷第1頁；《清史列傳》第4卷，《李國翰傳》；第80卷，《吳三桂傳》。