朝廷之由剿變撫，原因很多，主要是為軍事形勢所迫。此時，孫可望、李定國、劉文秀領導的大西軍連克四川、湖南、廣西、廣東大部分州縣，兩個多月前清平南大將軍定南王孔有德在桂林兵敗被圍自殺，定遠大將軍和碩敬謹親王尼堪統領八旗禁旅急赴廣西征剿，局勢吃緊，清廷抽不出更多的兵力對付鄭成功，而鄭成功正利用這一有利時機大舉進攻，連占州縣。兼之，八旗軍尤其是滿洲八旗將士不習水戰，憚於舟行，江海之上頭暈目眩，寸步難行，無法對付棹舟如飛的鄭軍。因此，皇上才決意改剿為撫，且不惜歸罪臣工失誤有過，來勸誘鄭軍停戰歸順，以便集中兵力征剿主要敵人大西軍。
順治帝的這一決策，是符合軍事形勢的，但其判斷還欠精確，對大西軍之軍威估計不足，對鄭軍之實力也有所低視。這在勸降的條件和招降失敗仍要進剿這兩個方麵上，表現得十分清楚。他招勸鄭成功降順時許諾的優遇條件有五：赦罪授官；駐紮原地，不必赴京；責成防剿浙閩粵海寇；管理往來洋船，稽查奸宄，輸納稅課；擒斬海中偽藩逆渠，不吝爵賞。這些優遇條件並非十分優遇，好些招降之許願遠遠比這更為優厚。
順治元年四月攝政王多爾袞勸誘明平西伯、總兵吳三桂歸順時，許諾說：“今伯若率眾來歸，必封以故土，晉為藩王”，且隨即封吳為平西王。同年七月王致南明弘光權利大學士史可法書，勸諭諸臣降順時允諾說：“南州群彥，翩然來儀，則爾公爾侯，列爵分土，有平西之典例在。”《清世祖實錄》第4卷第15頁，第6卷第19頁。皆以王公侯伯爵相引誘，而此次對鄭成功，卻僅“許以赦罪授官”，駐紮原地，既不封爵，又不裂土以賜，即隻可能授以總兵官、副將之流的官職，待遇太差了。至於防剿浙閩粵海寇，管理洋船，這本來就是鄭成功現在所行之事、所擁之權，清朝哪有力量去防剿三省海寇管理海上洋船？這兩條“優遇條件”，實是廢紙。而且敕書還講道，鄭成功若要封爵，得立大功，必須擒斬南明海上大帥大將。敕書規定這樣不高的優遇條件，顯然是對鄭成功的實力估計偏低，僅把他當做中等海盜來勸降，沒有把鄭軍視為安定浙閩粵沿海州縣及三省的主要對手。順治帝的這一失誤，很快就由於戰局的變化，使他更為清醒，而主動予以改正。
順治十年五月初十，世祖降敕，封精奇尼哈番(子爵)鄭芝龍為同安侯，鄭成功為海澄公，鄭鴻逵為奉化伯，鄭芝豹為左都督，並賜以敕諭。敕諭全文如下：
“朝廷報功，必隆其典，臣子效順，各因其時。茲爾鄭芝龍，當大兵南下，未抵閩中，即遣人來順，移檄撤兵，父子兄弟歸心本朝，厥功懋矣。睿王不體朕意，僅從薄敘，猜疑不釋，防範過嚴，在閩眷屬，又不行安撫恩養，以致闔門惶懼，不能自安，雖鄭芝豹音信尚通，而鄭成功、鄭鴻逵恩養遂阻。加以地方鎮道官不能宣揚德意，曲示懷柔，反貪利冒功，妄行啟釁，廈門之事，咎在馬得功，而鴻逵遵依母教，遂爾旋師，足見諸臣身在海隅，不忘忠孝，朕甚嘉之，已將有罪將官提解究擬，即遣人賚敕傳諭開導歸誠。成功、鴻逵果令李德持家書來，並傳口語，芝龍隨即具奏，書詞雖涉矜誕，口語具見本懷。朕念爾等前有功而不能自明，後有心而不能上達，君臣誼隔，父子情疏，爾等不安於衷，亦已久矣。朕親政以來，知百姓瘡痍未起，不欲窮兵，爾等保眾自全，亦非悖逆，今以芝龍首倡歸順，賞未酬功，特封為同安侯，錫之誥命。芝龍子成功為海澄公，芝龍弟鴻逵為奉化伯，芝豹為左軍都督府左都督總兵官，各食俸祿如例，成功、鴻逵另有專敕，芝豹遇缺推補。朕推心置腹，不吝爵賞，嘉興更始，猶慮爾等疑畏徘徊，茲特遣官黃征明往諭。敕諭到日，滿洲大軍即行撤回，閩海地方保障事宜，悉心委托，爾等當會同督撫商酌行事，應奏聞者，不時奏聞。爾等受茲寵命，果能殫心竭力，輯寧地方，實爾等之功，如或仍懷疑慮，不肯實心任事，以致地方不安，非徒誤朕封疆，亦且擾爾桑梓，揆情度理，爾等諒必不然，況爾等父兄在朕左右，子弟盡列公侯，懷君德則為忠臣，體親心則為孝子，順兄誌則為悌弟，此爾等千載一時之遇也，可不勉哉！”《清世祖實錄》第75卷第8、9、10頁。
此敕與七個月前帝賜予浙閩總督劉清泰之敕，在變剿為撫，招勸鄭成功停戰歸順這一根本點上，是相同的，但此敕在五個重要問題上，又與前敕頗有差別。其一，前敕乃帝賜予總督之敕，命其招撫，不是賜予鄭成功，清帝與成功並未直接交涉，現在此敕，雖係賜予鄭芝龍、鄭成功、鄭鴻逵、鄭芝豹四人的，並非僅賜予鄭成功，且就字數而言，講鄭芝龍的事篇幅最多，但論其實質，則顯然是以成功為主要對象，竭力勸其歸順，並專門說明還將賜成功、鴻逵專敕，億民之君的大清皇帝第一次與南明延平郡王鄭成功打交道了。其二，清帝正式敕封諸鄭爵位，鄭芝龍由一等子，跳越伯爵，超晉同安侯，鄭成功封海澄公，位列公侯伯子男五等爵之上爵，鄭鴻逵封奉化伯，較諸當年鄭芝龍奉獻全閩率部十餘萬降清僅得到一個三等子而言，這次是十分優遇了。其三，敕諭到日，“滿洲大軍即行撤回”。五個多月前，負責征剿鄭成功的清平南將軍鑲紅旗漢軍固山額真金礪，以鄭軍奪據海澄，“請增發大兵攻取”，議政王大臣會議後奏準，於江寧、杭州撥滿兵一千，命額黑裏等將統領，前往福建，會同金礪進攻。《清世祖實錄》第70卷第26、27頁。現帝諭撤回停攻，以表示誠心招撫，不事攻戰。其四，斥責馬得功等人貪利冒功，妄行啟釁，襲掠廈門，已將他們提解問罪。在此敕之前兩個多月，順治十年二月二十八日，浙閩總督劉清泰奏稱：“臣遵密諭”，細察廈門之事，係巡撫張學聖、道員黃澍、總兵馬得功，“垂涎金穴”，偷襲廈門，“以致鄭逆賞索修怨，海郡淪陷”，三人罪難寬逭，巡按王應元又失職徇隱不奏。帝降旨批示：“張學聖、馬得功、黃澍、王應元俱革職”，拿解來京，嚴訊具擬。《清世祖實錄》第72卷第17、18頁。世祖於敕中講明此事，顯係示恩討好於鄭成功，以泄其憤。其五，用詞委婉，勸解寬慰，動之以情(父子之情，弟兄之情)，誘之以恩，遠非招降一般將領所能比。五點集中為一點，即順治帝對鄭成功是破格優遇，竭力勸其停戰歸順。