突發公共衛生事件及大型活動保障全市突發公共衛生事件報告14起，發病215人，死亡1人。與上年相比，報告事件減少22.22％，發病人數下降19.78％，死亡人數下降75％。
完成市科委“甲型流感物資儲備模式研究”及“北京市突發新發傳染病健康傳播策略研究”2項課題；完成全國兩會、武博會、上海世博會等大型活動應急保障工作；完成海地、玉樹地震災區衛生救援的準備工作；組織全市疾控係統做好防範洪澇災害的準備工作；組織全市衛生局、疾控中心、衛生監督所開展突發公共衛生事件處置實景演練，並對參演隊伍進行了考核。
消毒、殺蟲、滅鼠完成全市醫療單位、托幼機構及學校消毒滅菌監測和檢查，監測醫療機構1722家，監測樣品31437件，合格率96.07％，比上年提高2.09％；監測托幼機構830家，監測樣品9925件，合格率92.48％，比上年下降1.62％；監測學校170所，監測樣品417件，合格率96.40％，比上年下降0.10％。完成18個區縣90家社區衛生服務中心消毒滅菌調查，采樣監測920件；完成18個區縣36家托幼機構傳染性腹瀉消毒工作專項調查，開展預防性消毒效果監測710件，感染性腹瀉疫源地消毒調查1次。對全市30起腸道傳染病疫情進行現場消毒處理和消毒效果評價，現場采樣366件，基本建立起疫源地消毒與病家消毒評價體係。對全市13個醫療單位血液透析室工作人員手采樣26件；對18家醫療機構進行牙科手機抽查，共采樣98件。對市信訪辦久敬莊接濟服務中心艾滋病上訪人員集中點進行現場消毒，消毒麵積近1000平方米。在全市18個區縣不同行業和環境共設置病媒生物密度監測點482個，其中鼠類72個、蚊蟲170個、蠅類116個、蟑螂124個。
在日常監測的基礎上，開展了旅遊景點成蚊密度監測、白蚊伊蚊密度專項監測和居民家庭蟑螂危害情況監測。全年開展鼠密度監測12月次，總計布鼠夾16800夾次，捕鼠117隻，平均陽性率0.70％，比上年增加14.75％，不同環境和行業中畜牧場平均陽性率最高。監測蚊密度18旬次，總計捕獲成蚊13399隻，年平均蚊密度為1.18隻／燈·小時，比上年下降7.81％，不同環境和行業中公園綠地成蚊密度最高。監測蠅密度21旬次，總計捕蠅42356隻，年平均蠅密度6.75隻／籠·天，比上年下降3.57％，不同環境和行業中公園綠地成蚊密度最高。監測蟑螂密度12月次，共捕獲蟑螂7822隻，平均密度0.12隻／張·夜，比上年下降29.41％，不同環境和行業中農貿市場蟑螂密度最高。配合市愛衛辦完成2008～2010年“健康北京滅蟑行動”的總結。居民家庭蟑螂侵害率16.84％，比上年下降34.75％。承擔中央首長工作區和生活區的病媒生物控製，完成對中直機關苗圃的蚊密度監測和現場滅蚊工作。
慢性病預防控製規範化管理高血壓及高危人群8524人；在15個區縣的33個社區開展超重肥胖幹預，管理1704人；糖尿病及高危人群隨訪共管理5741人。在14個區縣繼續使用“健康體重健康血壓”管理軟件，13個生活社區和18個功能社區的10302人被納入管理。參與國家疾控中心全國傷害監測項目，完成9718人次醫院傷害病例信息的收集。
在宣武區和門頭溝區試點的基礎上，全市開展“高血壓自我管理”小組，共試點8個小組96名組員的活動，以及18個區縣36名組長的培訓。在全市疾控係統和基層醫療衛生機構開展慢病防控能力調查，獲得市、區縣級疾控中心調查問卷19份，每份問卷910個參數；基層醫療機構調查問卷1773份，每份問卷183個參數。在16個區縣56個篩查點開展社區腦卒中篩查與防控項目，完成20284名調查對象問卷調查、體格檢查和頸動脈篩查，發現腦卒中高危人群15513人，頸動脈狹窄者1882人。在東城區和通州區進行中國成人慢性病及危險因素監測，共完成1219人的問卷調查、體格檢查和血生化檢測。帶領各區縣開展了全民健康生活方式日、全國高血壓日和聯合國糖尿病日宣傳活動。全年印製海報、折頁、分裝藥盒和方便購物袋等宣傳品共26種12萬餘份。創建《慢病工作通訊》，共印發4期，每期150份。
營養與食品衛生完成常規食品理化檢驗27294件項，食品微生物檢驗21846件項；出具北京市食品、食品用產品衛生檢測評價報告（報告書）582份。受市藥監局委托，完成448件保健食品的功效成分、違禁藥物和防腐劑抽檢檢驗；受市衛生局委托，完成餐飲服務食品安全抽檢1040件；受市藥監局、國家藥監局委托，完成291件保健食品的複核檢驗；完成衛生部衛生監督局紫砂食、飲具容器衛生質量監測92件、乳及乳製品中三聚氰胺監測180件，中國疾控中心生鮮乳中β－內酰胺酶本底值調查和液體奶監測150件，市衛生局乳及乳製品中三聚氰胺和蛋白質專項檢測30件。完成16件可疑食源性疾患樣品的檢驗。
承擔國家食品安全風險監測任務，結合本市曆年監測結果和食品安全需求，開展了食品安全風險的監測。首先，將食源性致病菌監測的二級監測站擴大到全市18個區縣疾控中心，監測樣品2269件，其中生食蔬菜192件、中式涼拌菜292件、沙拉176件、生食水產品239件、鮮榨果蔬汁90件、生畜禽肉359件、鮮凍水產品182件、速凍熟製米麵製品101件、熟肉製品270件、即食非發酵豆製品160件、嬰兒配方粉118件、現製散裝冰激淩90件，監測指標為8種食源性致病菌、大腸菌群和3種致病菌定量監測。共檢出各種致病菌165株，對44株沙門氏菌、金黃色葡萄球菌進行了菌株耐藥性監測，對64株沙門菌、副溶血性弧菌進行了ＰＦＧＥ分子分型和溯源分析。其次，繼續在以市疾控為中心、10個區縣疾控二級監測站為依托的監測體係中，開展食品化學汙染物及有害因素監測，包括蔬菜、糧食、乳及乳製品、蛋類、酒類、菌藻類、茶葉等初級農產品和加工食品樣品3000餘件，監測指標為元素（鉛、鎘、汞、甲基汞、鋁、銅、稀土元素）、真菌毒素、農藥殘留、食品添加劑、食品生產過程中產生的有害物質（丙烯酰胺、氨基甲酸乙酯和氯丙醇）、非法添加物（三聚氰胺、工業染料、甲醛）等125項，獲得42996個監測數據。
在西城區、崇文區、海澱區、豐台區開展北京城區居民營養與健康監測，完成社區人群和補充人群問卷調查5156人，血糖、血脂和血紅蛋白檢測3649人。
環境衛生監測市政自來水廠14個28戶次，檢測2072項次，出廠水合格率100％。健康相關產品中涉水產品行政許可檢測129個產品，合格124個，合格率96.12％。其中水質處理器30個，合格率93.33％；電水壺和飲水機5個，合格率100％；輸配水設備65個，合格率98.46％；飲用水消毒設備10個，合格率90％；化學水質處理劑19個，合格率94.74％。水箱維護單位水質衛生監測18戶，合格率88.89％。
監測遊泳場所33個，抽檢遊泳池水80件，合格45件，合格率56.25％。受理居住環境空氣質量委托檢測10戶，檢測78項次，合格率74.36％。公共場所集中空調通風係統衛生檢測，積塵量抽檢339戶3912件，合格率98.72％；積塵中細菌和真菌總數164件，合格率分別是86.60％和90.24％。公共場所軍團菌檢測175戶345件，合格率82.03％。監測大型商場超市室內空氣質量70戶，檢測420項次，樣品合格率分別為一氧化碳95.48％、二氧化碳100％、可吸入顆粒物100％、甲醛90.48％。放射衛生各類放射設備、設施、場所檢測