5月
北京安貞醫院被確定為衛生部首批“衛生部腦卒中篩查及幹預基地”。同時，首屆“腦卒中學術論壇”在該院召開。
5～8月
市衛生局開展了局青年科研項目的申報、評審與立項。對市衛生局直屬的39家單位96人申報的96個項目按照學科分組聘請專家進行會議評審，最後立項47項。
6月
1日
“健康北京人——保護牙齒行動”暨口腔流動科普展廳啟動儀式在奧運村舉行。
3日
市中醫局開展中醫醫院、中西醫結合醫院管理年檢查評估，同時會同市財政局開展績效考核工作。市衛生局召開鼠疫防控工作會，北京出入境檢驗檢疫局、北京鐵路局、華北民航管理局，市衛生局疾控處、應急辦，市疾控中心以及延慶、密雲、懷柔、順義、門頭溝5個鼠疫監測區縣衛生局有關領導和負責人參加。
3～4日
衛生部“萬名醫師支援農村衛生工程”項目督查組一行4人對本市的對口支援情況進行督查。
4日
市衛生局、市中醫局召開北京地區中醫基本現狀調查工作啟動會，18個區縣衛生局、三級以上醫院的領導及調查人員參加了大會。
5～6日
中國醫藥衛生事業發展基金會、市委宣傳部、首都文明辦、市衛生局和北京日報報業集團在地壇公園聯合舉辦“健康北京，健康生活，健康北京人”——全民健康促進10年行動大型公益宣傳谘詢活動。
6日
第十五個全國愛眼日，主題是“關注貧困人口眼健康，百萬工程送光明”。市衛生局聯合市防盲辦公室在房山區北潞河小區開展大型眼健康現場谘詢活動。北京同仁醫院將驗光車和眼病篩查車開到現場，為60歲以上老年人提供免費視力檢查、眼病篩查。
8日
市中醫局召開本市社區中醫藥人才培養“回歸紮根”工程工作會。
市衛生局副局長鄧小虹帶隊赴天津市就婦幼衛生工作進行交流考察。
市衛生局召開北京市結核病防治工作會。
10日
市衛生局副巡視員趙濤帶領應急辦工作人員，到河北省衛生廳進行衛生應急工作的調研和交流。首都醫學發展基金管委會召開會議，對2009年度首都醫學發展基金擬立項項目進行評估論證，其中85項中醫藥類項目通過了專家評審。
市衛生局開發了“北京衛生規劃建設管理信息網——衛生資源規劃工作係統”，並舉辦衛生資源規劃工作係統使用培訓會。18個區縣衛生局負責規劃的專職工作人員30餘人參加。
11日
市中醫局製訂了《首都十大危險疾病科技攻關與管理中醫藥“十病十藥”研發項目工作方案（征求意見稿）》，並致函13個相關委辦局和區政府征求意見。
11～13日
第十六屆世界牙外傷大會在意大利舉行，首都醫科大學附屬北京口腔醫院派出3人參加。這是世界牙外傷大會舉辦以來，第一次有中國醫生參加。由中國康複醫學會主辦，北京老年醫院承辦的中國康複醫學會第六次老年康複學術大會在北京召開。
12～14日
市衛生局組成由鄧小虹任組長的循環督查組，對福建省衛生支農工作進行督查，並將督查情況報告衛生部。
12～27日
本市中醫類別全科醫師崗位培訓有408人報名參加。
13日
市衛生局召開北京市衛生人才工作會。宣布
“215”高層次衛生技術人才隊伍建設工程培養計劃第一批入選者名單，舉行首批入選高層次人才《北京市衛生係統高層次衛生技術人才培養計劃任務書》的簽字儀式。
市衛生監督所獲悉順義區南法信鎮北法信村發生因手足口病死亡兒童，立即趕赴現場，並對順義區疾控中心和南法信衛生院的疫情處理工作進行監督檢查。
由遊偉程教授負責的科技部中德國際合作項目“根除幽門螺杆菌感染預防胃癌大規模人群幹預項目”正式啟動。該項目是北京腫瘤醫院與國際消化道腫瘤聯盟（ＩＤＣＡ）／德國慕尼黑工業大學（ＴＵＭ）共同合作項目。
14日
市衛生局組織開展“醫改一線行”係列集體采訪活動。
第七個世界獻血者日，主題是“向世界提供新鮮血液”。市衛生局團委會同市紅十字血液中心組織開展了“人文北京、科技北京、綠色北京”衛生青年先鋒無償獻血誌願服務活動。
15日
設在西單文化廣場西北角的本市首個街頭固定獻血屋正式啟用。獻血屋可容納7人同時獻血，其中3個采血位還可以采集血小板成分。
16日
市衛生局在順義區南法信鎮舉辦“預防手足口、保護嬰幼兒”大型健康谘詢活動。
17日
召開北京大學係統生物醫學研究所成立大會暨學術報告會。
17～23日
由市衛生局副巡視員趙濤等7人組成考察組，對新疆和田地區的衛生人才培訓對口支援工作進行現場調研考察。
18日
啟動第二批北京市對口支援什邡市衛生人才
培訓。
市中醫研究所承辦了幾內亞醫院管理和醫護人員培訓班。
北京市心理援助熱線（800－810－1117）在北京回龍觀醫院開通。
21日
市衛生局在平穀區醫院舉辦“醫改一線行”平穀行活動，14家新聞媒體參加采訪。
21～22日
市衛生局舉辦建設工程全過程跟蹤審計培訓班，各直屬單位審計部門負責人或專職審計員40餘人參加培訓。
21～27日
市衛生局、醫院協會舉辦局係統新任幹部和後備幹部培訓班，市衛生局機關及直屬單位新任幹部、後備幹部共70餘人參加培訓。
22日
市衛生局召開北京市艾滋病防控工作會。
市衛生局召開手足口病防控重點工作會，針對近期手足口病防控工作重點，對重點部位、重點地區專門進行部署。
22～25日
市衛生局組織9名麻醉及管理專家對申報北京市臨床麻醉質控中心的北京醫院、北京大學人民醫院、北京大學第三醫院、北京天壇醫院、北京友誼醫院、北京朝陽醫院等6家醫院的申報材料進行了審閱，對麻醉科室建設情況進行現場檢查，並聽取擬承擔質控中心主任的綜合陳述。
23日
中央組織部組織二局局務會成員、副巡視員李誌宏，衛生部直屬機關黨委常務副書記姚曉曦等一行7人到本市衛生係統進行創先爭優活動的專題調研。市衛生局召開北京市醫師定期考核啟動工作會。醫師定期考核工作自7月1日起正式啟動。
25日
市中醫局、市科委召開協調會，確定了“十病十藥”研發項目篩選工作的目標、方法和任務。由市中醫局製訂實施方案，申請市科委綠色通道經費用於“十病十藥”的篩選研究項目。
市衛生局在豐台區花鄉新發地農貿市場開展“預防手足口病、送健康知識下鄉”的大型健康宣傳活動。
市衛生局向衛生部報送了《北京市四級婦科內鏡技術準入醫療機構名單（11家）》和11家醫院開展四級腔鏡的醫師名單。推薦北京協和醫院、北京大學第三醫院、北京婦產醫院為衛生部四級婦科內鏡手術培訓基地。
28日
召開北京大學肥胖及代謝病研究中心成立大會暨代謝病基礎研究新進展研討會。
29日
全球艾滋病、結核病和瘧疾基金執行主任米歇爾·卡察契金一行在京就艾滋病、結核病和瘧疾防控工作到地壇醫院進行考察。
市衛生局舉行紀念建黨89周年暨“為群眾健康服務的黨員之星”事跡報告會。