目前保健酒的生產方法主要為兩類：一是采用食藥兩用的中藥材，以傳統白酒或食用酒精為溶劑，使用浸漬、滲濾的方法獲取浸出液，再與白酒等勾調而成；二是將具有某種功效的活性因子與白酒等勾調而製得。而加功效活性因子的方法，在保持原傳統白酒風味的同時，營養保健功效明顯，易被消費者接受或青睞。
一、保健酒的功效因子選擇
莊名揚研究認為，保健酒所選擇的功效因子，應注意兩個原則：一是功效明顯而安全，二是可完全與酒體互溶。現介紹幾類主要物質供參考。
1.真菌多糖
大多數活性多糖可提高人體的免疫調節作用，它是發揮生理和藥理作用的基礎，經水解或酶解成短鏈小分子多糖，具有同樣的生理活性，且可溶解於白酒。活性多糖有純多糖和雜多糖之分，純多糖一般由10個以上單糖通過糖苷鍵連接起來的純多糖鏈，可分支，也可不分支。雜多糖除含多糖鏈外往往還含有肽鏈、脂類成分。如雲芝多糖是一種含蛋白質25％～30％的蛋白多糖。分布較廣且活性顯著的多糖，大部分是真菌多糖，真菌多糖在調節生理功能和抗病治病方麵得到了廣泛的應用，其生理功能如下：
(1)免疫調節功能，增強宿主細胞免疫作用它具有刺激網狀內皮係統的吞噬功能；刺激或恢複T淋巴細胞和B淋巴細胞，增強淋巴細胞的轉化作用；增強K細胞、NK細胞和LA細胞活性。
(2)增強宿主體液免疫作用真菌多糖可作為幹擾素等許多細胞因子的促誘導劑。
(3)抗腫瘤作用真菌多糖可作為一類免疫增強劑。它的抗腫瘤作用，源於其免疫功能的增強。因而預防腫瘤的發生，同時也可殺傷已產生的腫瘤細胞。
綜上所述，提高免疫功能的原材料，應選用真菌多糖。
2.人參皂苷
人參的主要成分為人參皂苷、人參倍半萜烯、人參酸等，人參能提高細胞壽命。國外報道，在含有適當濃度人參提取物的培養介質中，人胚肺成纖維細胞密度顯著高於對照組；國內有人用40代齡人胚肺二倍體細胞為實驗模型，觀察人參皂苷對其群體倍增水平、增殖天數及衰老後細胞群體死亡天數的影響。結果表明，以上三項指標加藥組均優於對照組。提示適量的人參皂苷可延長壽命。其主要是增加了細胞群體倍增的能力，以維持衰老後細胞的生存能力。人參還可以促進人血淋巴細胞體外的有絲分裂，延長人羊膜細胞生存期。人參含有的麥芽醇具有抗氧化活性，它可以和機體內自由基相結合，從而減少脂褐素在體內的沉積。
3.多不飽和脂肪酸
天然存在的不飽和和多不飽和脂肪酸種類繁多，特別重要的是亞油酸、亞麻酸和花生四烯酸。因為它們不能在人體內自行合成而必須從食物中攝取，因此這三種被稱為“必需脂肪酸”。嚴格地說，隻有亞油酸在人體內不能自行合成，而其他兩種都可在體內由亞油酸部分轉化而成。亞油酸在人體內可被轉化為γ-亞麻酸、DH-γ-亞麻酸和花生四烯酸。
亞油酸的主要生理功能：作為某些生理調節物質(前列腺素)的前體物，如缺乏亞油酸，則可引起腎功能衰退，生殖功能喪失；它可使膽固醇酯化，從而降低血清和肝髒中的膽固醇水平；亞油酸對維持肌體細胞膜功能也起著重要作用。
亞麻酸有α-亞麻酸和γ-亞麻酸兩個同分異構體，為全順6，9，12-十八碳三烯酸，它們與花生四烯酸構成了前列腺素PG-I、PG-Ⅱ、PG-Ⅲ的前體物，可直接降低血管張力，對高血壓病人的收縮壓和舒張壓有明顯的降低作用。對嗜酒者，γ-亞麻酸可促進被酒精損傷的肝功能的恢複。γ-亞麻酸是細胞膜的基本成分和多種活性物質的前體，對多種疾病有療效，如過敏性濕疹、經前期綜合征、糖尿病、皮膚瘙癢和心血管疾病等。
4.自由基清除劑
自由基具有高度的化學活性，是人體生命活動中多種生化反應的中間產物，人的生命離不開自由基，在正常情況下，人體內的自由基處於不斷產生與清除的動態平衡之中。自由基是機體的防禦係統，如果不能維持一定水平的自由基，則會對機體的生命活動帶來不利影響。自由基對人體有益的作用主要體現在：增強白細胞的吞噬功能；提高殺菌效果；促進前列腺素的合成；參與脂肪加氧酶產物的生成及膠原蛋白的合成；參與肝髒的解毒作用。但自由基產生過多或清除過慢，通過攻擊生命大分子物質及各種細胞器，會造成機體在分子水平、細胞水平及組織器官水平的種種損傷，加速各種機體的衰老進程並誘發各種疾病。自由基清除劑能夠清除機體代謝過程中產生的過多自由基，因此是一種可增進人體健康的重要活性物質，也是一類重要的功能食品的功效因子。
自由基清除劑分酶類清除劑(抗氧化酶)和非酶類清除劑(抗氧化劑)兩大類。酶類清除主要有超氧化物歧化酶(SOD)、過氧化氫酶(CAT)和穀胱甘肽過氧化物酶(CSH-Px)等。非酶類清除劑主要有維生素E、維生素C、β-胡蘿卜素和還原型穀胱甘肽、硒、鋅、銅、生物類黃酮、銀杏萜內酯、茶多酚、泛醌(輔酶Q)、植酸、丹參酮、五味子素、黃芪苷及銅鋅絡合物等，都是好的天然抗氧化劑，即自由基清除劑。作為保健酒中的功效因子，酶類清除劑要慎用，因為此類化合物不易溶於乙醇。
5.條件性必需氨基酸
氨基酸是人體重要的營養物質，有些氨基酸具有極其重要的生理功能，如牛磺酸，牛磺酸被發現存在於牛的膽汁中而得名，其化學名稱為α-氨基乙磺酸(H2N—CH2—CH2—SO3H)。它廣泛分布於體內，尤其腦組織中濃度最高，主要以遊離氨基酸形式存在，不參與蛋白質組成。
牛磺酸的生理功能：保護視網膜；促進中樞神經係統發育；抗氧化作用；調節滲透壓；促進脂肪消化吸收。
牛磺酸以海產品中含量高，如牡蠣、蛤蜊，淡菜中牛磺酸可達400mg/100g以上。日常的各種食物，包括穀物、水果和蔬菜等都不含牛磺酸。
6.活性肽與活性蛋白質
活性肽與活性蛋白質是指那些有特殊生物活性的肽與蛋白質，主要有穀胱甘肽、降血壓肽、促進鈣吸收肽及抑製膽固醇合成的活性蛋白質等。它們的特殊功能在於清除自由基、降低血壓和提高機體的免疫功能等。眾多活性肽及活性蛋白質，不易溶於乙醇，故不進行介紹。現隻通過穀胱甘肽的生理活性的介紹，來說明二肽、三肽的重要性。穀胱甘肽是由穀氨酸、半胱氨酸和甘氨酸縮合而成的三肽化合物，穀胱甘肽分子中含有一個活潑的巰基—SH，使之具有諸多方麵的生理活性：解毒，可用於丙腈、氟化物、CO、重金屬及有機溶劑等解毒；可作自由基清除劑；對放射線、放射性藥物所引起的白細胞減少，能起到保護作用；對缺氧血症、惡心及肝髒疾病引起的不適具有緩解作用；改善性功能等。
具有降血壓作用的短肽，甲巰基丙脯酸也是重要的活性肽。
7.黃酮類化合物