按照“精簡、統一、效能”的原則和“小機構、大服務”的要求，組建開發區決策機構和日常管理機構。
（一）組建榆林經濟開發區管理委員會，作為榆林地區行署的派出機構，負責開發區內基礎設施建設、規劃實施和管理工作
開發區享受省級經濟開發區的有關優惠政策，開發區管委會享有地市一級經濟管理權，領導開發區的日常工作。管委會的主要職責是：
1.根據國家法律、法規和省地政府的授權，製定並組織實施開發區的經濟和社會發展規劃；
2.負責編製開發區總體發展規劃及基本建設、項目建設計劃，並負責管理和組織實施；
3.負責編製開發區產業發展規劃及項目引進、審批和管理；
4.負責製定開發區開發建設、招商引資、人才引進有關政策規定，經開發區建設領導小組批準後組織實施；
5.負責製定開發區管委會各類規章製度和管理辦法；
6.負責開發區涉外事務，包括開展國際合作，引進智力、引進外資、對外經貿和對開發區內“三資”企業開展服務與管理；
7.依法管理開發區財政、國有資產、稅收、勞動人事、工商行政、土地、規劃、建設、房地產、環保、綠化、技術監督等工作；
8.協調和管理有關部門在開發區內設立的派出機構或分支機構；
9.負責開發區統計、檔案工作；
10.完成地委、行署和建設領導小組交辦的其他工作。
開發區管委會暫設在榆林能源重化工基地建設辦公室，同時掛“榆林經濟開發區管委會”的牌子，縣級建製。管委會內設機構和人員編製依業務的開展逐步到位。目前，具體業務可由基地辦各科室承擔。管委會日常經費由地區財政解決。管委會可根據建設需要組建開發區建設公司。
（二）為進一步加強開發區建設工作的領導，建議成立榆林經濟開發區建設領導小組，為開發區的決策機構
領導小組組長由行署主要領導擔任，行署分管計劃、城建的領導和能源重化工基地辦公室主要負責人任副組長，地區有關部門，榆林市、橫山縣政府主要負責人為成員。領導小組辦公室設在開發區管委會，管委會主要領導兼任辦公室主任。領導小組的主要職責是：審定開發區經濟和社會發展規劃、總體規劃和控製性詳細規劃，研究審定開發區的有關政策和規定；協調開發區管委會與地區各部門的關係，研究解決開發區發展中的重大問題，為開發區建設營造良好環境。