國民黨在新疆的人員，分為兩派，大部分反對盛世才，但也有個別人與盛世才等拉攏關係，想方設法躋身其中。省黨部委員林伯雅，就認為盛世才在新疆可以長治久安；為了在新疆謀求長久的利祿，他首先通過“邱家”門路與邱毓熊過從甚密，沆瀣一氣，並經常到“明園”探望邱宗浚，拜邱宗浚為“幹爹”，與邱毓熊拜幹兄弟。4月4日兒童節，林伯雅在《新疆日報》發表《告小朋友》一文，其中寫道：“你們要擁護盛督辦建設新新疆，把盛督辦當做你們的父親，把邱院長當做你們的母親。”“末署”你們的大兄弟大朋友林伯雅。
林伯雅與邱毓熊的來往也為邱毓熊所樂意接受，因為邱正好可以從林伯雅這一來往，使林受到國民黨人普遍的諷刺挖苦、引為笑柄，尤其遭到張誌智的攻擊，使其內部矛盾日趨激烈。但這種攻擊，反而更增加林伯雅與邱毓熊之間的往還。在林伯雅看來，隻要得寵於盛世才，就可以在新疆紮下腳跟；別人叫囂，在盛世才的嚴密控製之下，都將無濟於事。可是，盛世才一切以維護個人統治權益為前提，勾結，拉攏，倚重，都不過是適用於某種形勢下的權術而已。當他逮捕和嚴刑逼問國民黨人時，林伯雅也沒有免遭皮肉之苦。
“程東白案”發生後，黃如今等更感到新疆局勢日益嚴重，憂心忡忡，但是，誰都沒有想到，盛世才早已布置好圈套，要把他們一網打盡。
1944年夏，蘇德戰場上，蘇軍反攻勝利。斯大林格勒不但沒有失陷，而且紅軍將德軍驅至東歐。在中國戰場上，日軍跨過湘桂，直搗貴州，國民黨軍隊不戰而退。“由國際局勢之發展而中國局勢之發展而新疆局勢之發展”，這是盛世才觀察時局的三段連環邏輯；他認為蘇聯又將強大，國民黨又將削弱，於是反複無常的本性又和盤暴露。
盛世才本想借國民黨的勢力維護其封建割據統治，但自國民黨入新後，人數逐漸增多，勢力日漸強大，與其部下的矛盾日益尖銳。他知道，國民黨對他是表麵籠絡，暗中排斥，最後是取而代之；因而當國民黨直接威脅到他的政權時，就又拿出製造陰謀暴動案以排斥異己的故伎，把國民黨人撥入“陰謀暴動”的大排擋而要施行手術。他首先製造“程東白案”，利用嚴刑逼供，迫使這些人承認與黃如今勾結，推翻新疆政權，在口供齊備以後，接著製造了“黃、林陰謀暴動案”，開始了對國民黨人的大逮捕。
1944年8月11日。盛世才指使警務處長李英奇，出動黑色汽車至省黨部委員宿舍，以“督辦請你們召開緊急會議”為名，將黃如今、張誌智、童世荃“請”到監獄，同時又逮捕了林繼庸、林伯雅、周明。汽車到外交特派員公署“請”蘇聯科科長丁慰慈時，丁感到可能是逮捕他，於是對特務說：“我打電話問問督辦，是不是真找我去開會！”盛世才這時正坐在新大樓裏等待李英奇的彙報，當即答複說：“你來吧！”
8月12日，黑色汽車繼續出動，忙前忙後，滿城飛奔。迪化縣黨部書記長邱明誠，攜帶毛巾牙刷準備就捕，四處亂跑，旋亦入獄。
盛世才還準備逮捕預七師師長李禹祥，以打擊國民黨在新疆的武裝。他打電話邀約李禹祥前去談話，李禹祥早已有了準備，答複“有病”，避而不見，並且在老滿城加強了戒備。
中訓分團指導員餘航，看到同夥紛紛被捕，一時氣憤，直接打電話給盛世才，嚴詞責問為什麼將這些人逮捕，並說：“要抓也把我抓去。”盛世才不予答複，旋即駛來一輛小汽車，將餘航逮捕。
國民黨人共計被捕100餘人，幾乎被一網打盡。其他國民黨人員，有的逃往老滿城預七師師部，有的藏於監察使署。
督辦公署參謀長汪鴻藻攜帶盛世才的親筆信，前往監察使署，會見監察使羅家倫。羅以為是來逮捕他，嚇得驚慌失色。汪鴻藻出示盛世才的信劄，告以一批國民黨人中的共產黨分子企圖陰謀暴動，推翻新疆政權，已予逮捕，並出示名單，稱：此事有關監察部門，因此必須向監察使說明備案。
國民黨人根據汽車出動的跡象，知道情勢嚴重，紛紛以電話聯絡，問：“某人在否？”對方回答：“不在”，就知道已經被捕。國民黨人自知盛世才控製嚴密，插翅難飛，人人自危，各自焚毀來往信件，整理行裝，隨身攜帶獄中用品，準備隨時入獄。未被逮捕的國民黨人和已被逮捕者的家屬，群龍無首，惶恐終日，紛紛前往監察使署探聽消息。羅家倫自己也毫無主張，徘徊左右，張皇失措，似乎大難臨頭，唯有坐以待斃。迪化全市，人心惶惶，風聲鶴唳。一般人士看到盛世才連這些國民黨中央派來的要員都敢逮捕，預示著盛世才將會與國民黨決裂，新疆的前途未卜，也可能發生一場戰爭，傳說紛紛，莫衷一是。