健康貓咪的耳朵在沒有異常的情況下（如耳疥蟲感染、耳炎等），不會出現太多耳垢。如果耳朵沒有耳垢或臭味，不需要每天滴耳液去清理；有時候過度清理，反而容易造成耳朵發炎，因此一個月清潔1～2次就可以了。
當耳朵過度潮濕或通風不良時，容易滋生黴菌和細菌，造成耳朵發炎，如外耳炎。不過貓種和個體上的差異也會影響耳朵的健康狀況，例如折耳貓和卷耳貓。折耳貓因為基因突變的關係，耳朵較小且向前垂下，所以容易造成通風不良；而卷耳貓的耳朵雖然是立著的，耳末端向後卷曲，但因為耳殼硬且窄，也容易造成清理上的困難，因此這些貓種必須更用心地照顧清潔耳朵。
耳道清理
step1 清潔耳朵所需要的用品，包括棉花和清耳液。
step2 右手拿清耳液，左手拇指及食指輕捏貓咪的外耳殼，並將耳殼外翻。這個動作除了可以讓你看清楚耳道位置外，也可以控製貓咪的頭，清理耳朵時，便不至於讓貓咪把清耳液甩得到處都是。
step3 確定貓咪的外耳道位置（箭頭標示處為耳道，是靠近臉頰，而不是靠近耳殼）。
step4 將1～2滴清耳液倒入耳朵內。
step5 左手扶著貓咪的頭，右手輕輕按摩耳根部，讓清耳液充分地溶解耳垢。接著，放開手，讓貓咪將耳道內多餘的清耳液和耳垢甩出來。
step6 取幹淨的棉花或衛生紙，將耳殼上的清耳液及耳垢擦拭幹淨。
日常清理
有些貓咪雖然耳朵沒有發炎，卻也很容易產生耳垢。貓奴們希望能讓貓咪的耳朵保持幹淨，但天天使用清耳液清洗，貓咪也會很排斥，因此建議可以換一種方式清理，又不會讓貓咪感覺討厭。
step1 先將小塊棉花用清耳液沾濕。貓咪的耳垢大部分是油性的，用一般的生理鹽水較難清理幹淨，因此可以用清耳液來清潔耳朵。
step2 以左手的手指將貓咪的耳殼稍微外翻，右手拿著清耳液沾濕的棉花，並固定貓咪頭部。
step3 擦拭眼睛看得到的外耳部分。耳朵裏麵不用刻意用棉簽清理，否則容易造成貓咪耳朵受傷，耳垢也會被棉簽往更裏麵推，且耳道內的耳垢會因貓咪搖頭而甩出來。