在崇禎拿出了太祖高皇帝的話語搪塞了他之後，孫承宗也無法再勸說下去了。
他遲疑了片刻之後，才對著崇禎說道：“所以，陛下便是為了今天這軍製改革的事宜，才不願意讓袁自如接替臣的職位嗎？”
朱由檢抬頭看著他說道：“先生你也知道，軍製改革之後，總參謀部將會變得多麼重要。朕實在不能把參謀總長的位置交給，一個有可能破壞了朝中政治平衡的人。
而在今日的朝堂上，除了先生以外，朕還能相信誰呢？難道先生真的認為，我們這位袁自如先生擔任了總長之後，會像先生您這樣，保持對朝堂政治的中立態度嗎？”
孫承宗頓時沉默了下去，他之所以一直推薦袁崇煥接任自己的位置，完全是因為他覺得，以袁崇煥的膽略和才能方可以抵擋得住遼東興起的建奴。
相比起朝堂中那些雖然口上誇誇其談，但是連戰場都不敢去的官員來說，袁崇煥已經算是大明文官中少有的知兵人物了。
茅元儀雖然同樣才能出眾，但是一來他不是科舉出身，無法得到朝中文官集團的認同；二來他的文人個性過於強烈，根本無法得到軍中大將的認同。
因此能夠同時獲得朝廷和軍隊認可的，孫承宗以為隻有袁崇煥最為合適。他更希望茅元儀能夠作為袁崇煥的副手，幫助袁崇煥解決在軍事謀略上的缺陷。
但是孫承宗此前的考慮，總參謀部隻是取代五軍都督府，戰時統帥軍隊出征的這麼一個平時將領安置所。
他之前並沒有想過，崇禎會把總參謀部的位置抬的這麼高，現下兵部除了最後的軍費審核同軍官任命外，隻剩下了對於後勤和軍械的監管工作。
總參謀部卻已經從剛設立時的軍令機構，延伸到了軍政管理的工作上去了。可以說，從前是兵部侵占了五軍都督府的大部分權力，但是現在總參謀部卻大有架空兵部的勢態。
按照今天的軍製改革方案實施下去，他這個參謀總長的權力還要在兵部尚書之上，唯一欠缺的一點便是，代表軍隊在朝堂上發言的，還是兵部尚書而不是參謀總長而已。
孫承宗能夠保證，他在這個位置上對朝中的政治鬥爭能保持中立。但是他卻無法保證，他的弟子袁崇煥是否也能如此，畢竟這位弟子的功名之心，從來都沒有在人前隱藏過。
孫承宗思前想後了許久，便打了退堂鼓對著崇禎說道：“老臣且為陛下再撐上兩年，看看這袁自如究竟能不能擔當大任。
不過如果他這兩年內行事不出差錯，陛下是否能夠重新考慮，讓他接任臣的職位。縱觀現在的總參謀部成員和朝堂上的官員，能夠勝任參謀總長的人員，實在是寥寥無幾啊。”
朱由檢抿著嘴仔細的想了想，才謹慎的回道：“如果袁自如是眾望所歸，就算是朕也阻攔不得，孫先生又何必多慮。
倒是孫先生可在這總長的位置上下一下功夫，看看如何訂出製度限製住參謀總長權力過大的問題，則朕就不必為參謀總長的人選日日擔憂了。”
孫承宗略略沉默了片刻，便想要起身向崇禎告辭，但是朱由檢卻再次叫住了他說道：“其實朕還有二事，想要同先生私下商議。”
孫承宗對著崇禎欠了欠身，便再次坐了下來，等候皇帝的吩咐。
“一件事是，現在我們已經建了北京、南京、成都三所陸軍軍官學校。以這三所軍校畢業的學員為基礎，當地方都督府成立之後，便可將附近幾省內的軍隊重新整訓一遍，加強朝廷對於地方軍隊的控製力。
但是兩廣雲南之地位置偏遠，且和其他地區的自然條件相差較大，若是以這三所軍校去整訓這些地方的軍官，恐怕往來不便，也會出現水土不服的狀況。
所以朕希望，從北京、成都兩地抽調教官和畢業學員作為老師，在兩廣之地建立一所新的軍校，專門用以整訓這一地區的軍隊，並測繪該地區的地圖和研究該地區的作戰方式。不知先生以為可否？”
孫承宗隻是低頭沉思了片刻，便回道：“陛下思慮的極是，兩廣、雲南之地向來被人視為瘴癘之地，特別是廣西和雲南的防禦，都是以當地的土兵為主。
雖說廣西狼兵、雲南土司一向恭順於朝廷，但是西南奢安之亂前，奢家和安家同樣是對朝廷忠心耿耿的土司人家。
凡事預則立，不預則廢。對兩廣雲南之地的官軍進行整頓編訓，現在也是勢在必行了。臣以為，在兩廣設立一所軍校是應該的。不知陛下屬意何處建立這所軍校？”