禮妃離開之後，朱由檢在房內獨坐了一會，才把呂琦等人召喚了進來，他向著呂琦問道：“接下來還有什麼人要見？”
呂琦略略想了一會，便回道：“孫傳庭已經在外麵等了一小會，另外還有禮部的…”
“除了孫傳庭外，其他人都讓他們回去吧，讓他們把奏章留下也就是了。”朱由檢想了想，就對呂琦直接吩咐了下去。
在呂琦前去傳召孫傳庭的時間裏，朱由檢還在思考著錢謙益通過柳如是傳到他麵前的訊息。也許在這個時代的人眼中，這是婦人幹政，是政治混亂的一種表現。
但是對於朱由檢來說，隻要能夠鞏固自己的權力，他並不介意采用一些非常規的手段。既然他限製住了內廷向外朝幹涉的權力，自然需要用另一種方式去幹涉外朝的政治，他可沒打算把自己的手腳自己綁起來，當一個廟堂之上的泥塑神像。
此外，外朝的官員們也需要內廷主動放出來的風聲，從而讓他們選擇一條正確的道路，而不是走到宮中的對立麵去，這也是基於政治現實的各取需要。
不過很顯然，今日從柳如是口中傳回他耳中的消息，讓他頗為不快。眼下看來，錢謙益大約是猜中了他的用意，可是對方的膽子實在是不大，到了這一刻還想要進一步的確認，這無疑有些畫蛇添足了。畢竟他沉默了這麼久，不正是希望讓自己站在一個超然的地方，以應對這件事麼。
當朱由檢在心中暗暗罵著錢謙益的時候，孫傳庭終於跟著呂琦走進了皇帝的書房。原本他並不需要這麼早入宮求見的，隻不過在年前崇禎對他有所吩咐，他覺得這個任務不宜延遲下去，這才趕著今日來彙報了。
收拾好心情的朱由檢，聽完了孫傳庭的彙報，臉色也變得嚴肅了起來，“這麼說來，年前交給你的那些卷宗，你已經全部查證落實了？這些將領、軍隊的確有殺良冒功和劫掠平民的行徑了？”
孫傳庭的臉色也有些不太自然，不過他還是點著頭回道：“的確是如此，但是這些案子不僅僅牽連到守備部隊和民團，野戰部隊同樣也有人牽涉進了案子。若是大張旗鼓的進行處理，臣擔心會引發兵變。”
“哈，哈哈。”朱由檢冷笑了幾聲後說道：“國家一年歲入的七成用以給養軍隊，而卿作為陸軍參謀總長卻告訴朕，要是朝廷下令處置這些殘害民眾的兵痞，就有可能會引發兵變？
孫總長，朕要求你大聲的回答朕，總參謀部究竟有沒有能力控製住軍隊？你作為參謀總長，究竟有沒有控製局勢的能力？”
這還是皇帝第一次在他麵前發怒，孫傳庭額頭上微微沁出了汗珠，他不再猶豫的向皇帝回複道：“臣對於控製地方上的局勢是有信心的，臣對總參謀部對於各隻軍隊的控製能力也是有著信心的。臣隻是擔心，涉案人數不但多且分散於各地，一旦我們開始抓人徹查，這些心懷不軌的兵痞得到消息後會立即逃亡，甚至於裹挾同僚作亂，這樣有可能進一步破壞地方上的秩序，也給我們處理問題帶來不。因此臣才建議，是不是分時間，分地域，分部隊，將這些案子一一進行處理。”
對於孫傳庭的謹慎，崇禎卻不以為然的說道：“卿以為，什麼的敵人最令人頭痛不已？”
孫傳庭還在思考皇帝提出的問題時，崇禎卻已經自問自答的說道：“朕以為，看不見的敵人最令人頭痛。
眼下這些兵痞看似隻是殺良冒功，沒有背叛朝廷。但是他們既然敢於無視朝廷和總參謀部定下的軍規，今天可以殺良冒功，明日自然可以割據地方對抗朝廷了。對於那些違反了規則的人來說，隻要這一次沒有受到懲罰，那麼下一次破壞規則就更加毫無顧忌了。
今日不過是讓他們在國內維持秩序，他們已經把朝廷的命令視若無物，那麼明日若是有敵軍大兵壓境，這些軍隊難道還會聽從朝廷的命令前往前線去抗擊敵軍嗎？
若是不能夠給他們一個狠狠的教訓，這些人就不會畏懼國法軍規，那麼他們很可能因為一次小小的矛盾就走向朝廷的對立麵。想要培養出良馬，就必須不定期的淘汰病弱之駒；想要種植出能夠作為宮殿支柱的巨木，就應該從小修剪旁枝。
總參謀部如果想要讓軍隊令行禁止，就不要害怕對軍隊中的兵痞蛀蟲進行清理。現在都已經是崇禎十四年了，我們整頓軍隊編製實施條例都已經超過了十年，朕還真就不相信了，處理幾個兵痞，還能四處動蕩了。朕相信，我們的軍隊，絕大多數還是可靠的，忠於朝廷的。