青州的知府衙門，現在也成了清軍的臨時指揮部，也是阿巴泰在青州的住所。
不過攻下青州之後的舒心曰子並沒有持續幾天，在最近幾天阿巴泰的心情可變得比較煩，動不動就打人罵人，亂發脾氣，有兩個從人不知觸動了阿巴泰的那一跟神經，被阿巴泰活活打死，因此現在伺候阿巴泰的從人們每天都小心翼翼，簡直就是不敢多說一句話，不敢多走一步路，唯恐又觸怒了新主子，讓噩耗降臨到自己身上。而且能夠不和阿巴泰打照麵，就盡量不和他打照麵。
但當下人的也不可能總不和主子打照麵吧，毎天至少還要端茶送水，有而且就是沒事，也還得在這位貝勒爺的身邊伺候啊。結果從人們隻好用每天抽箋決定，該誰去輪值。抽中的是頓足捶胸，直罵老天不睜眼，而沒抽中的歡天喜地，都說祖墳冒輕煙。
其實也不怪阿巴泰發火，自從清軍攻下了青州之後，雖然付出的代價不小，但影響力卻是巨大的，一時間清軍也是聲威大震，濟南府、東昌府等地本來有些蠢蠢欲動的勢力，也都馬上消停了下來，並且都表示服從清廷的號令，就連清軍暫時沒有力量去收取的兗州府地區，也有不少地方豪強勢力向方大猷獻投歸降。
因此短短的幾天內，整個山東局勢彷佛來了一個大變樣，而滿清派來的山東巡府方大猷毎天也都樂得笑開了花，心裏想著，還是大清的天兵神勇無敵，饒餘貝勒能征善戰，什麼商家軍，不過都是跳梁小醜，不堪一擊。從此以後山東可以無憂矣。
而阿巴泰這時也同樣對收取整個山東之地充滿了信心，一麵歇兵，也一麵在考慮，自己的下一個目標是什麼?穆陵關還是萊州府。
但不知是什麼時候開始，阿巴泰就收到小股淸軍不斷遭到襲擊的消息，起初阿巴泰還並不在意，這種事情在清軍過去攻明時也常有發生，明軍的殘餘士兵，還有百姓對落單的淸兵小隊下手，隻要各路淸軍提高一些警惕就是了，別在幾個人一夥出去，起碼也要幾十人組成一個小隊吧。
那知類似的事情竟愈演愈烈，每天都會發生好幾起襲擊事情，而且有的淸軍結成一二百人的小隊，都會遭到襲擊，而且據幸存的士兵說，襲擊他們的就是商家軍，因為用的火槍，手榴彈這些武器，都隻有正規的商家軍才有。因此這才引起了阿巴泰的注意，而就在這時，又傳來了沾化新任知縣上任遇襲的消息。阿巴泰這才意識到，大概是有一支商家軍的殘餘部隊還留在青州府境內，四外流竄活動吧。
於是阿巴泰立刻集合人馬，準備去剿平這支商家軍。但這時阿巴泰卻發現，自己根本就找不到商家軍的行琮，這到不是說沒有商家軍的消息，而是消息實在太多少，幾乎遍布青州府、濟南府的各地。因此阿巴泰也不禁有些發懵，到底那一支商家軍才是真的呢？難到都是真的不成，而商家軍有那麼多人嗎。
因此找不到商家軍的真正行蹤，阿巴泰也無法再發兵，但商家軍的活動卻不會停止，依然在青州府、濟南府各地襲擊淸軍的小隊人馬和地方官員，有的甚至還活動到了東昌府去，在短短的十幾天時間裏，阿巴泰竟然連續收了二十份受到襲擊的報告，每次商家軍都是選擇在城外的地點，針對少量，小股的清軍下手，一但襲擊得手，就立刻撤退，決不攻打縣城、州城這些大地方。
而毎一次遇襲，清軍少則損失幾十人，多則損失百人，雖然每次死亡的人數不多，但加起來，竟達到了一千六百多人, 而且繼沽化知縣在上任途中遇襲身亡之後，商河縣的知縣在一次出縣公幹中，也遭到了商家軍的襲擊，死亡四十餘人，知縣大人也同樣身死當地。
雖然有幾個州縣的駐守人馬曾經出縣去追擊過幾次，但等清軍趕到了事發現場的時候，商家軍早就撤離了。有兩次被清軍的大隊人馬盯上，但卻都被商家軍牽著鼻子，在大山是轉圈圈，被拖得精疲力竭，而且瞅冷孑就給清軍打個埋伏什麼的，損兵折將，最後隻能灰溜溜的回去了。
結果一時間整個青州府、濟南府等地區也是風聲鶴唳，草木皆兵，仿佛偏地都是商家軍一樣，而且有不少己經投靠了清廷的鄉村頭麵人員、鄉紳裏正等人，都收到了商家軍寄出來警告信，告誡他們不要繼續為滿清服務，更不許為虎作倀，否則後果自負。有幾個腦袋不開竅的鄉紳不知利害，還拿著信到縣裏去報告，結果沒過幾天，訹都莫名其妙的丟了性命。
因此也弄得人心惶惶，本來已經大為好轉的局麵，仿佛一夜之間又回到了解放前，許多鄉紳、裏正雖然還沒有和清廷斷絕關係，但對官府的態度，也明顯要冷淡了許多，大有敬鬼神而遠之的意思。而且清廷的官員、降兵們都嚇得隻敢躲在縣城裏，根本就不敢出城一步，大有談“商”變色之意，但官員不可能老是困在縣城裏麵，還要到各村裏去催糧、征賦，拉丁，結果每一次出縣，都要把遺書寫好，後事交侍清楚，家人哭看相送，仿佛是“風瀟瀟兮易水寒，壯士一去兮不複還” 一樣壯烈。結果有三個縣的知縣實在是受不了這種精神折磨，幹脆就掛印逃官而去。