第一分艦隊帶著第一旅的全體官兵出發以後，直接駛向琉球島而去。
這時第三分艦隊在擊毀了日本軍隊的船隻之後，也和駐琉球的西班牙雇傭軍彙合，艦隊就停泊在軍營的碼頭邊。而此刻的曰本軍隊隻能躲在首裏城裏，根本就不敢出來。而在軍營裏躲蔽的中國商人都平安無事，在曰本一開始進攻的時侯，還有些緊張，但發現日軍的進攻根本就對軍營城造不成什麼危脅之後，也就什麼都不怕了，當第三分艦隊到來之後，則都完全放心了。
而日本軍隊這時也開始緊張起來，因為都是先頭部隊，薩摩和彥根二藩都沒有攜帶多少糧食，現在船隻被毀，也不知道會在琉球停留多久，雖然島津光久是對幕府大軍的戰鬥力不抱希望，但也不甘心在首裏城裏坐以待斃。而且盡管德川幕府一直忌殫薩摩藩，但井伊直孝的身份卻不同。
井伊家可是徳川家德還是三河藩藩主時的舊臣，井伊直孝的父親井伊直政，當時與酒井忠次，本多忠勝，神原康政，並稱為徳川家德手下的四天王，屬於德川幕府可以絕對信任的大名，因此於情於理，徳川家光都不能放任彥根藩軍滅亡不管。於是也派人四下裏搜找糧食，盡可能在琉球堅持得久一點。
首裏城是琉球朝廷的都城，府庫裏還有一些存備的糧食，另外在首裏城裏，還有二三萬琉球百姓，各家也都有不少餘糧，因此日本軍隊退回首裏城之後，也大肆搜刮糧食，當然順便搶一點銀錢，包括婦女，也是可以理解的。最後搶來的糧食也足夠吃二三個月了，這還不算城外的村莊，暫時到是不用為糧食但心，現在隻是一心等著救兵趕到。至於那些被搶了糧食的琉球百姓怎麼辦，當然就被島津光久和井伊直孝給無視掉了。
但日本的援軍還沒有趕到，商家軍的第一分艦隊就首先到達了琉球，第一旅在軍營登陸，向首裏城發動了進攻。這時首裏城的曰本剛把城內搜搶一空，又出城到附近的村莊裏搶劫，結果被商家軍一陣暴打，都逃進了首裏城裏。
島津光久主張就在首裏城裏駐守，而井伊直孝還不知道商家軍的厲害，覺得商家軍的兵力並不多，而且又是出城挑戰，似乎有機可趁，因此決定率軍出擊，和商家軍大戰一場。
結果井伊直孝帶領五千彥根藩的士兵出擊，和商家軍的一個團對陣。商家軍隻出動了二個營，排成三段連射陣形，橫向展開五六百米，士兵們輪番開槍射擊，連綿不絕，打得彥根軍成排成排的倒地身亡。
井伊直孝對火槍射擊到並不陌生，當年長篠之戰中，織田信長和德川家康聯軍，就是使用火槍，在日本叫鐵炮，擊敗了武田家的騎軍，也使織田信長勢力大漲，稱雄日本。也是徳川家康嶄露頭角的一戰，因此也倍受德川幕府的重視。
但在長篠之戰中織田、德川聯軍紮下了無數的防馬柵欄，來阻擋武田軍的進攻，才使火槍有從容射擊的機會，而現在的商家軍根本就沒用什麼柵欄，就是遠遠站成三排，輪番開火射擊，雙方之間的陣地是一馬平川，任甴彥根軍拚命進攻，但卻無法靠近，隻能不斷的倒下。
井伊直孝也曾派出人馬，想從左右迂回到商家軍的側後方，進行前後夾擊，但商家軍剩於的兩個營就是防著日軍左右迂回，結果日軍連派出兩隊人馬，從左右繞道，但全都遭到了商家軍的阻擊，無法成功。
戰鬥進行了大半個時辰，日軍的傷亡超過了兩千人，井伊直孝見戰事實在太不利了，也趕忙下令收兵，退回首裏城裏，這回再也不呈什麼能了，一心一意的在城裏駐守。
而就在這時，曰本的大隊戰艦也終於逼近了琉球島。成鋼也下令，第一旅留在琉球島上，看住首裏城裏的曰本，第一、三艦隊以及西班牙雇傭軍艦隊出戰，迎擊日軍的船隊。西班牙雇傭軍的隊長莫倫特和安徳烈也都隨艦隊一起出戰。莫倫特付責指揮西班牙艦隊，而安德烈則登上嶽飛號，出任自己的新職務，司令官副官。
這支日本船隊來自屬於毛利氏長州藩。
長州藩在曰本，是與薩摩藩齊名的大藩，第一任藩主就日本戰國時的名將毛利輝元，也是豐臣秀吉時代的五大老之一，同時還有長府、徳山、岩國三個支藩，也是日本的強藩之一，在關原合戰中，毛利輝元就是出任西軍（即豐臣軍）的主將。因此在徳川幕府建立之後，長州藩也是徳川幕府重點防範的大藩，僅次於薩摩藩。不過也正因為如此，長州藩也一直視幕府為本藩的大敵，據說每年的新年團拜，長州藩士、支藩藩士都會以“主公，可以（倒幕）了嗎？” 為新年賀詞。