這幾項處理決定公布之後，山東軍政兩方麵的官員們也都沒有異議，隨後周世奇也開始了自己的工作，在濟南、兗州、東昌三府建立完善的行政機構.
而商毅的重點工作是檢閱軍隊，以及山東軍區的各項備戰工作。在隨後的幾天時間裏，商毅毎天在各個軍營裏巡視，檢閱軍隊的軍容、軍貌、武器、後勤保障等等事務。同時也觀看了士兵的日常訓練，演練，各項軍事技能的練習，比試等。
其實在取得了山東戰役的勝利之後，山東軍區就己經開始進行下一步的備戰工作，一方麵是補充山東戰役中的傷亡人員，擴充預備士兵，現在山東軍區的四個軍的人員編製己經全部補充完畢，同時還編製了二個民兵師，擴充了二個預備師，三個預備旅的部隊。使總預備部隊達到七萬三千餘人。
另一方麵是加緊製造各種武器、彈藥，保障戰爭的需要，並積累各種軍用物資，牲畜、車輛，征調民役等等，到這個時侯，己經征集了馬牛驢騾等牲畜二萬三千餘匹，各種車輛一萬七千餘輛，其中四輪車有三千餘輛，獨輪有六千餘輛，民役也達到二十餘萬。由於以前山東地區的戰事並不多，各項物資儲備都十分豐富，而且征調民役也都給予十分合理的報酙，因此對民間的影響並不算太大。要不是發生這次的事件，山東軍區己經處於隨時可以出戰的狀態，並且可以供應遠距離的作戰。
商毅對山東軍區的備戰工作也是相當的滿意，另外雖然在中華軍裏，混入了一些清廷的細作人員，商毅也並不太擔心，因為這在兩個敵對的勢力之間，都是在所難免的。而且從現在掌握的情況來看，清廷對中華軍的滲透極為有限，在十幾萬大軍中混入幾百個清廷細作，實在並不足為慮。而且中華軍的軍紀和晉升製度都十分嚴格，清廷細作想晉升到中高級軍官並不容易，因此也難以及時獲得軍事情報，更不用說在軍隊中鬧事什麼的，像這一次雖然煽動了幾百名士兵，但其實並沒有鬧出多少事情來，絕大多數士兵都是被迫拉來的。
而且從另一方麵來說，兩國相爭，情報、間諜係統畢竟隻是輔助部份，比拚的還是整體的國力、軍力，在這兩方麵南京政府對清廷己經取得了相當大的優勢，縱觀古今中外，還沒有出現那一個弱勢的國家，依靠間諜活動，擊敗強勢國家的例了。因此一但南京政府在戰場取得決定性的勝利，那清廷的這些細作人員要麼自動消失，要麼老老實實成為南京政府的一員，和清廷徹底斷絕關係。
因此商毅也鼓勵山東軍區司令部的成員，不要受這一次事件的影響，努力備戰，隨時準備出擊，以戰功來挽回山東戰區的榮譽。
商毅在濟南一共停留了五天的時間，在此其間，也收到南京方麵發送來的有關清廷的動向，在這段時間裏，清廷一直在從其他地方調兵遣將，一場大戰也迫在眉睫，因此商毅也要盡快返南京，指揮這場戰事。
在最後一天，按照商毅的行程，應該是由周少桓在府裏設宴招待商毅。在中國古代，君主到臣下的府中做客，是極大的榮譽，也表示對臣下的絕對信任。
不過發生了青州的襲擊事件之後，李鬆晨也向商毅建議，取消這一項計劃，這到不是還懷疑周少桓，而是萬一周少桓的府裏混入了清廷的細作，又趁機行刺商毅怎麼辦，比如周元輝不是就被清廷策反了嗎？誰敢說沒有第二個周元輝。盡管刺殺成功的可能性並不大，但依然存在著危險性，而且又會把周少桓給卷進來。
但商毅則考慮到如果仍然到周少桓府裏作客，對於徹底安定山東地區的軍心、民從，包括周家在內，都有極大的作用。可以讓周少桓和周世奇知道，商毅對他們依然保持著信任。
致於擔心周少桓府裏有清廷細作，商毅認為這種可能性並不大，如果周少桓府裏那麼好混進來，清廷也就不用費這麼多周折，而且就算是有，也不用怕，隻要加強預備也就行了，假如真的發生了行刺事件，還可以將計就計，假說是商毅和周少桓設下的一個圈套，誘出清廷的細作人員。因此商毅仍然堅持依照製定好的行程進行。
而周少桓得知商毅依然要架臨自己的府邸之後，也十分感動，另外雖然現在己經正實，自己並沒有反叛的意圖，但發生這樣的事情，對周家的聲譽，也是不小的打擊，因此他和周世奇也需要商毅的這種表示依然信任的態度，那怕商毅隻是到自己府裏打個轉就走，像征意義也十分重大，就能夠向人們表示，周家依然還是受商毅的信任。