猛將真柄直龍陣亡，對長州軍的士氣來說，確實是一個很大的打擊，眼看著戰局的形勢就要逆轉了。但就在危急的時刻, 跟在真柄直龍身後的一隊火槍兵舉槍射擊，勾阪兄弟促不急防，結果雙雙中彈身亡。而其他的幕府軍士兵見了, 也都十分震驚, 並沒有乘機擴大戰果.
隨後小林瑞軒、黑阪中守等長州軍的其他大將立刻代替了真柄直龍，指揮著長州軍繼續進攻，鼓舞著長州軍拚力的戰鬥，終於穩定住了局麵。而隨著戰事繼續進行，倒幕軍越戰越勇，幕府軍也己經開始呈現出了不支的局麵，逐步的後退。
在幕府軍後陣中觀戰的徳川直義見了，也不由大為著急，他也沒有想到，倒幕軍會如此勇猛，竟然以五千兵力敵住了自己的八千人馬，而且還漸漸占據了優勢，隻好又命令部將森可成率領五千士兵，支援到戰場中去。
而見幕府軍又向戰場投入兵力，毛利廣綱在益田元輝的指點下，也立刻命令下令，命自己所部的人吉藩藩主相良賴喬、柳河藩藩主立花鑒虎兩人帶領本部的人馬分別從左右兩翼向幕府軍發動進攻。而徳川直義也分派大將阪井政尚、池田幸輝分別領軍，敵住倒幕軍的進攻。
兩軍再度陷入僵持戰之中，毛利廣綱部出動了二萬五千人馬，而幕府軍卻己出動了三萬二千兵力，倒幕軍的兵力雖然少，但作戰十分勇猛，而幕府軍的士氣低落，這時己經明顯處於了下風，不過現在仍然尚可支持，而且幕府軍的預備兵力還是要比倒幕軍多，因此中路戰局的勝負，尚切難料。
就在雙方的中路發生激戰的時候，倒幕軍的左右兩翼也都分別展開了行動。
由於戰前商毅己經下達了嚴令，而且在中路毛利廣綱部表現，也相當出色，這也激起了鍋島勝茂和有馬忠賴的鬥誌，因此兩人也都指揮著本部的人馬，向幕府軍的左右兩翼，發動了進攻。
幕府軍的左右翼人馬也和箭頭一樣，布下了大量的木柵和拒馬以及鐵炮，做為第一道防線，但倒幕軍的一方也都裝配了一定數量的中國火器，雖然在數量上不及對方，但在威力上卻強了不少，因此幕府軍在左右兩翼布下的木柵拒馬也有很快失守，左右兩翼的主將徳川光圀、阿部正春也隻得下令，命幕府軍出擊迎戰，於是雙方也立刻發生了激戰。
一時間整個關原都己被戰爭籠罩， 兩軍旗幡交錯，刀光劍影，響殺聲震天，打得也十分激烈。
倒幕軍的一方都是養精畜銳多時，而且普遍士氣都很高，因此氣勢很盛，一直都處於進攻的勢頭，基本上都壓製住了幕府軍，但幕府軍到是人數眾多，盡管都一直處於守勢，但在地利上占有一定的優勢，雖然被倒幕軍壓製住了，但仍然還能夠穩得住陣腳，倒幕軍想要取勝，還有一段相當的距離。
不過戰事進行到這一步，己經沒有什麼戰術計劃可說了，拚的就是雙方士兵的經驗、組織、戰鬥力，戰鬥意誌，還有兩邊將領的臨陣指揮能力。不過在這方麵，無論是倒幕軍還是幕府軍都存在相當大的不足，不僅士兵缺乏戰鬥經驗，不少軍隊的組織混亂，而且兩邊將領的臨陣指揮能力也很差，在進與退，移動、配合、變陣、換陣的時候，都出現了相當多的漏洞，隻不過對方的指揮官也同樣都是萊鳥，因此才無法抓住這些漏洞，浪費了不少勝機。
這也讓在笹尾山上觀戰的商毅、亞莉桑徳拉、岡薩雷斯候爵、成進等人看得連連搖頭歎息，心裏都在想著，如果換了自己去指揮，一定能夠抓住這些漏洞，攻擊敵軍，這一場戰鬥現在說不定就贏下來了。
畢竟曰本已經承平太久了，離島原之敵都差不多過去了十五年的時間，軍隊也就不經戰陣，而戰國時代、桃山時代的那些赫赫有名的人物，也都已經後續無人了。也淪落到了現在的樣子。
但雙方打得到是十分起勁，畢竟日本人的本性來說，都是好戰的，因此在憋了十五年之後，終於等到了出戰的機會，既使是幕府軍的士氣不高，但打了一陣之後，士兵們也都頗為興奮起來。結果雙方從早上開戰，一直打到了下午二時左右，雖然雙方都沒有把全部兵力都投入到戰場上，但所有的士兵卻也都輪換上陣過了，但戰局仍然不明朗，雖然幕府軍的箭頭和右翼的第一道防殘都失守了，但仍然退守到第二道防線，繼續防守，倒幕軍依然還是無法將優勢轉為勝勢，擊敗幕府軍。
不過這時雙方都已經損失了不少的士兵，在戰場上也躺滿於許多士兵的屍體，但雙方仍然各不相讓，依就在拚力的撕殺搏鬥著。