仙台戰役勝利結束之後，沈新聯係林遠，說道：“林帥，我們已經把進攻東京的戰略計劃部署好了，我們下一步是不是集中七個師的兵力進攻東京？”
林遠說道：“暫時先不要進攻東京。”
沈新問道：“林帥，是不是覺得七個師的兵力太少？我們可以再從海參崴一帶征集兵力。”
林遠說道：“東京是日本的首都，關係到日本帝國的臉麵，所以日本在東京層層設防，我們要是進攻的話就會打成攻堅戰、消耗戰，可是天皇並不在東京。”
沈新問道：“天皇不在東京會在哪裏？”
林遠說道：“按照我的情報，天皇一般都在天皇指揮所裏，天皇指揮所在仙台、廣島和京都，現在廣島和仙台都沒有發現日本天皇的蹤跡，日本天皇應該是在京都。”
沈新說道：“京都是日本的曆史名城，也是極其重要的城市，我知道天皇在明治維新之前都在那裏，所以天皇留守京都也很正常，可是仙台距離京都七百多公裏，我們的部隊過不去啊。”
林遠說道：“我正在籌劃京都會戰，你們做好準備，我決定把你們從海路運過來。”
沈新答應下來，林遠隨即命令：第1師、第17師進攻京都東北部的若狹灣，第18師、第36師進攻京都東南側的伊勢灣，以四個師的兵力包抄京都東側；駐守在四國島上的第24師、第23師等六個師渡過紀伊水道，攻占日本和歌山縣，從南側包圍京都。
第2師、第3師等五個師和獨立一旅等兩個旅的部隊進攻京都西側的兵庫縣，重點攻擊神戶、大阪等與京都唇齒相依的城市，從西側和北側包圍京都，第三十三兩棲作戰師則從海麵登陸，配合主力部隊進攻；第三十二空中騎兵師則作為戰略預備隊，在最關鍵的時刻投入戰場。
經過了林遠的部署，京都東側將集中四個師，南側將集中六個師，西側和北側將集中五個師和兩個獨立旅，總共十五個師和兩個獨立旅，再加上直屬於中部方麵軍的炮兵、通訊兵部隊，總兵力高達六十餘萬，這也是林遠部隊自成立以來投入規模最大的作戰。
林遠把命令下達給肖英武和沈新，並通知他們：在保留中部方麵軍指揮部和北部方麵軍指揮部的同時，成立京都會戰前敵指揮部，自己親自擔任總司令，可是林遠轉念一想，自己的事情太多，很難全心全意指揮戰鬥，於是就讓肖英武擔任總司令。
林遠把京都會戰的事情安排完畢，這時侍從進來說道：“林帥，法國大使求見。”
林遠想都沒想便說道：“法國大使肯定是代表日本來和談的，有什麼好談的！我的條件已經很明確了，日本天皇不可能答應。”
侍從試探著問道：“那林帥的意思是：不見他？”
林遠輕歎了一口氣，說道：“不見還是不好的，見見吧。”林遠離開辦公室，走到會客室，法國大使見到林遠前來笑道：“林遠先生實在抱歉，打擾您了。”
林遠爽朗地一笑，說道：“我們中國和貴國是老朋友了，您有什麼事情不妨直說。”林遠說完這話心中暗想：“說‘老朋友’也不過是場麵話，中國和法國在二十多年前才剛剛在越南打了一仗。”