四、建立根據地
為了適應新的形勢，根據中央關於“迅速在西滿、東滿、北滿劃分軍區和軍分區，將軍隊劃分為野戰軍和地方軍”的指示，為了便於“分散安家”，也為了對各部隊進關以來編製、番號較為混亂的局麵加以整編，東北局首先將部隊做了重新編製。
1946年1月4日，經中央軍委批準，東北人民自治軍改稱為東北民主聯軍。總司令林彪，副總司令呂正操、周保中、蕭勁光，第一政委彭真，第二政委羅榮桓，第一參謀長蕭勁光（兼），第二參謀長伍修權，政治部主任陳正人，總後勤部部長葉季壯、政委楊至誠。這時候，東北民主聯軍的總兵力已有27萬人。為了作戰的需要，東北民主聯軍總部又分設前方總部（簡稱前總）和後方總部（簡稱後總），這時後總設於本溪，前總則隨林彪赴遼西前線。
在東北民主聯軍總部之下，成立四大軍區：
北滿軍區（也稱吉黑軍區）司令員高崗，政委陳雲，參謀長李天佑。北滿軍區之下又設五個軍區，即合江、牡丹江、鬆江、嫩江、龍江軍區。軍區直屬部隊是第七師（由山東來的第七、八兩師和冀熱遼來的第十九旅合編），師長楊國夫，政委劉其人。
西滿軍區（也稱遼熱軍區）司令員呂正操，政委李富春、黃克誠（不久改任司令員）。西滿軍區之下又設兩個軍區，即遼西、嫩南軍區。軍區直屬部隊是第三師（原新四軍第三師），師長兼政委黃克誠（兼），副師長劉震、洪學智。
南滿軍區（也稱遼東軍區）司令程世才，政委蕭華、江華，副司令員羅舜初、曾克林，副政委莫文驊、唐凱，參謀長羅舜初（兼）。南滿軍區之下又設安東軍區。軍區直屬部隊是三縱和四縱，三縱（以山東來的第三師和另外三個旅組成）司令員程世才（兼），政委羅舜初（兼）；四縱（由山東來的第六師和第五師組成，初期稱為二縱和三縱，不久合編為四縱）司令員吳克華，政委彭嘉應，副司令員胡奇才、韓先楚。
東滿軍區（也稱吉遼軍區）司令員周保中、政委林楓，副司令員陳光，副政委張啟龍，參謀長陳光（兼）。東滿軍區之下又設三個軍區，即通化、吉東、遼北軍區。軍區直屬部隊是七縱和吉黑縱隊，七縱（由山東來的東北挺進縱隊改編）司令員萬毅，政委周赤萍；吉黑縱隊司令員曹裏懷，政委郭峰。
東北民主聯軍總部直屬部隊是由山東過來的梁興初任司令員、梁必業任政委的第一師，是林彪很熟悉的當年八路軍一一五師的老部隊。此外總部之下還有賈陶任旅長的炮兵旅、三個軍事學校（軍政大學、航空學校、炮兵學校）。
各部隊在東北局各分局和各軍區的安排下，都避開了與敵人的正麵作戰，分散到鄉村去發動群眾，消滅土匪，懲辦漢奸，開展清算鬥爭（清算漢奸和偽軍的罪行，收回被他們霸占的土地和糧食，分給貧苦農民），減租減息，建立政權，組織遊擊隊和民兵。
在清算鬥爭的基礎上，各地逐步開始分配開拓地和滿拓地（即日本拓務省和偽滿拓政司組織的各種開拓團所奪占的土地，這在東北農村數量不少，很多縣都在三分之一以上，最高的在80％左右）給農民。1946年3月20日，東北局發出《關於處理日偽土地的指示》，決定“所有東北境內一切日偽地產、開拓地、滿拓地，以及日本人和大漢奸所有地產，應立即無代價地分配給無地和少地的農民、貧民所有”。於是東北全境開展了分田運動。1946年5月，中共中央下達《關於清算減租及土地問題的指示》。不久，東北局“七七決議”傳達到整個東北，凡是我黨控製的地區都掀起了大規模的土地改革運動，截至1947年2月，東北地區（南滿除外）共有400萬農民分得土地3160萬畝，平均每個農民分得8畝左右。