當城外的東野部隊逐步縮小對錦州的包圍時，炮彈已經不斷落到範漢傑的指揮部所在地錦州鐵路局辦公大樓上。10月12日，他隻得將指揮部移到中央銀行的樓下，原因是那裏有堅固的地下室，而且和第六兵團司令部所在地錦州郵局很近，隻有20多米。他後來在回憶錄中說：
解放軍炮火集中最大的火力來射擊，命中錦州指揮所多處。我到哪裏，解放軍的炮火即跟到哪裏，好像完全了解我的位置一樣。錦州城被解放軍包圍得更緊了，城內各據點、交通線，完全被解放軍的炮火控製著。解放軍攻城部隊在炮火掩護下，晝夜不停地構築蜘蛛網似的交通溝接近我守軍陣地，用炸藥來爆炸守軍堅固據點的重機槍堡壘陣地。
也就在10月12日，林彪向各部隊下達了總攻部署，決定在14日上午10時發起總攻。林彪的部署是以二縱、三縱和六縱十七師為北突擊集團，配以炮縱的炮一團、重迫擊炮團，戰車團的坦克營，高炮團的兩個營，由三縱司令員韓先楚統一指揮，從城北和城西北突破；以七縱和九縱為南突擊集團，配以炮縱的炮二團、高炮團的一個連，由七縱司令員鄧華統一指揮，從城南突破；以八縱為東突擊集團，配以一縱的炮兵團，由八縱司令員段蘇權指揮，從城東突破。各部隊突入城中之後，在高等法院到白雲公署一帶會師。整個攻城戰役爭取三天之內全部解決。另外，以一縱為總預備隊，放在高橋附近，或攻錦州，或援塔山。
東北野戰軍為攻克錦州而投入的總兵力是25萬人，這還不包括阻擊敵人援軍的四縱、十一縱等部隊在內。
為了順利解決攻堅的難題，除了大挖交通溝逼近敵人之外，林彪為攻堅調集了強大的火力。東野炮縱的重炮和各縱隊的重炮一共300多門全部調了上來，特種兵戰車團的15輛坦克也從北滿調了上來，各部隊的小口徑炮還有600多門。配備如此強大的重型武器向一個不是太大的城市進攻，這在人民解放軍的戰史上，是第一次。
考慮到這是我軍在東北第一次攻打較大的城市，總攻之前，東野的羅榮桓政委和譚政主任還專門將各縱隊的政委和政治部主任召集起來開會，除了進行政治動員之外，特地向部隊交代打下錦州之後應當嚴格遵守的城市政策和入城紀律。羅榮桓指著院子裏深秋時節結滿果實的蘋果樹作比喻說：
要教育部隊保證不吃老百姓一個蘋果，無論掛在樹上的，收獲在家裏的，掉在地上的，都不要吃，這一條紀律要堅決做到。
從此以後，“不吃老百姓一個蘋果”就成了東北野戰軍執行紀律、搞好軍民關係的一個象征。