待西班牙菲律賓分艦隊回到馬尼拉的時候，僅僅剩下了五艘戰艦，西班牙菲律賓分艦隊這個編製算是完蛋了。
菲律賓總督科奎拉見自己的部下如此狼狽，艦隊正副司令雙雙戰死，四十艘戰艦隻剩下八分之一，大驚，他細細的詢問了分艦隊失敗的原因。
為了掩飾自己的無能，分艦隊的軍人自然把遠洋水師的戰鬥力誇上了天，什麼行動迅捷無比的戰艦，戰艦上犀利的大炮，可以在水裏遊的炮彈，把科奎拉唬得二愣二愣的。
科奎拉現在後悔極了，早知道大明政府的海軍如此犀利，千不該，萬不該，也不該惹大明人啊！
不過現在可不是後悔的時候，因為庫福爾率領著遠洋水師一路尾隨西班牙菲律賓分艦隊的殘餘艦隻來到了馬尼拉灣，科奎拉現在應該考慮如何對付這隻如狼似虎的艦隊。
科奎拉立刻下令，所有軍隊開始進入戰鬥位置，進入港口防禦狀態，嚴防敵人搶灘登陸。
馬尼拉港口炮台上的炮兵開始裝填海防炮，他們時刻準備著，隻要敵艦進入射程，便可以對敵人給予迎頭痛擊。
西班牙人經營馬尼拉多年，馬尼拉的港口遍布炮台和大炮，若是西班牙的海麵力量失敗，他們完全可以退守陸地，依靠馬尼拉港口的炮台，擊敗海上來的敵人。
可憐號稱海上霸主、擁有無敵艦隊的西班牙人，麵對傳統的大陸國家大明，到頭來卻要用岸上的力量來自保，這不得不說是對西班牙人絕佳的諷刺。
此時，遠洋水師正在馬尼拉的外海耀武揚威，但是狡猾的遠洋水師卻沒有進入馬尼拉港口炮台的射程範圍，他們隻是遠遠的觀望，用旗語痛罵西班牙人是膽小鬼，不敢到海上來決戰。
遠洋水師沒有貿然進入馬尼拉港口炮台的射程，完全得益於他們的老大庫福爾，庫福爾曾經在馬尼拉生活過一段時間，深知馬尼拉港口海岸炮的厲害，一水的重型炮，雖然裝填過於緩慢，但是勝在射程遠，威力大，布防密集，隻要戰艦挨上一顆炮彈，保證報廢。
庫福爾知道，馬尼拉港口的炮台都是依山而建，可以居高臨下向海麵上的戰艦發射炮彈，但是海麵上的戰艦卻不可能對馬尼拉的炮台進行仰攻。
為了避免避免不必要的損失，庫福爾並沒有下令攻擊馬尼拉的港口，其實遠洋水師此時攻擊馬尼拉的港口也沒有用，因為庫福爾麾下根本沒有可以進行搶灘登陸的水師步勇，攻打馬尼拉，還得等到後續部隊到來才行。
葉思文給庫福爾的任務是封鎖馬尼拉，掃清西班牙人的艦隊，讓馬尼拉的西班牙人沒有機會，也沒有能力逃跑。
見遠洋水師沒有進攻馬尼拉，科奎拉的心稍稍的安定了一點，看來敵人的戰艦也就在海上強橫罷了，麵對陸地上的戰爭，應該沒有什麼辦法。
科奎拉是這樣猜測，敵人應該是想用封鎖馬尼拉來逼自己就範，以達到不戰而屈人之兵的目的，但是科奎拉的決心卻很大，他決定死守馬尼拉，而且他有信心守住馬尼拉。
給科奎拉帶來信心的一共有兩個條件，第一，呂宋島物產豐富，糧食絕對有保證，第二，西班牙人貪圖方便，曾在馬尼拉修建了一座兵工廠，呂宋的礦場也很豐富，完全可以找到製造彈藥的材料。
能生產糧食，能製造彈藥，馬尼拉完全可以自給自足，就是堅持十年也不是問題，所以敵人封鎖自己的海上補給是沒有用的。
況且，科奎拉已經向國王報告了這裏發生的事情，很快，西班牙本土的軍隊就可以到達馬尼拉，到時候，兩麵夾擊之下，還怕打不退大明的艦隊嗎？
就這樣，庫福爾帶著遠洋水師在馬尼拉灣和西班牙人對峙，庫福爾不能攻進馬尼拉，西班牙人也不敢派艦隊出來和遠洋水師決戰，雙方就這樣耗著，等著對方的耐心被耗盡。
但是事情很快就有了轉機，遠洋水師和西班牙人對峙十天之後，從西方來了一支懸掛西班牙國旗的船隊。
突然出現西班牙人的船隊，可把庫福爾嚇了一跳，他還以為西班牙本土的軍隊趕到了呢！
庫福爾正準備迎戰，卻發現這支西班牙船隊並不是戰艦，盡是一些郵船和運輸船，至於戰艦，一艘也沒有。
這可是送進嘴的肥肉啊！庫福爾若是不吃了豈不是對不起上帝老大哥？
庫福爾當即下令扣留了這支西班牙船隊，麵對如狼似虎的遠洋水師，毫無戰鬥力的西班牙船隊隻能選擇投降。
庫福爾把船隊管事的找來一審問，才知道這支船隊是先前逃離菲律賓的富人，他們本來準備帶著收刮的金銀細軟回國，但是在半路上他們遇上了荷蘭人的艦隊，荷蘭人的艦隊占據了東西方海路的必經之地馬六甲，蠻橫的把這些富人趕回了菲律賓。