托馬斯神父隨著施琅走到了中軍大帳前十多步的地方，施琅瞟了他一眼：“你等著，我進去通報一下！”過了好一會兒，施琅才從營帳裏出來，他身上帶著酒氣：“你在這兒等一會兒。”
營帳裏的鄭芝龍卻和手下幾個心腹將領在喝酒，由於一點顧忌也沒有，因此不時有聲音傳出帳外，托馬斯聽到了就問施琅，“鄭將軍是不是在裏麵？”
施琅說道：“那是都督在和眾將軍們商議軍務！你站遠點，免得被你聽了去。”說著施琅連推帶拉地把托馬斯拖出了十多步。
托馬斯和一幹荷蘭士兵一直在台灣冬天的豔陽下站了有一個多時辰，終於，吃飽喝足了的鄭芝龍命令接見荷蘭使者。
托馬斯連忙要進營帳，可通往大帳的路上站了兩排手持大刀的明軍士兵，發著幽幽寒光的鬼頭大刀再次讓托馬斯神甫緊張起來。
進了大帳，托馬斯神甫一手撫胸，衝著端坐在中央的鄭芝龍：“弗雷德裏克總督的使者托馬斯見過鄭將軍閣下。”
“哦？你來有什麼事情嗎？”鄭芝龍打著酒嗝。
“我們弗雷德裏克總督大人認為與將軍發生了一點誤會，我們想與將軍談談停火事宜，這裏是我們總督大人給將軍的一點小小的意思！”說完，他把禮單遞了上去。
鄭芝龍接過禮單看了看，大笑道：“嗬！還真大方，白銀十萬兩，黃金三千兩，還有一箱珠寶玉石。”鄭芝龍哈哈大笑：“哎呀，總督大人實在是太客氣了！”
托馬斯一看，有效！也跟著嗬嗬的笑了起來，說道：“希望這能消解我們之間的誤會！”
但是鄭芝龍的話鋒卻是一轉：“東西我收下了，但是要議和，首先要滿足我們的兩個條件，缺了一個那就免談！”
“請將軍閣下請說！”托馬斯說道。
“第一，你們必須把抓去的大明百姓都給我放回來，黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍三人必須交給我們。第二，你們無條件投降，本將軍保證你們安全離開台灣！我給你們一個時辰的考慮時間。一個時辰後，沒有答複的話，我軍立即攻城！”。
台灣城裏，弗雷德裏克總督和手下的軍官們正在坐臥不寧的等托馬斯神甫的消息，他們把希望全都寄托在托馬斯神甫的身上了。
突然，城頭上的哨兵飛快的來報告：“托馬斯神甫他們回來了！”
聽完托馬斯神甫的彙報，弗雷德裏克總督騰的站了起來：“我們不能屈服於這幫野蠻的土著，為了軍人的榮譽，為了尼德蘭，我願意血戰到底！”
“總督閣下，這是不明智的。”托馬斯神甫連忙阻止他，“我觀察了土著人的武器，他們的大炮不比我們少，火槍也不比我們少，更重要的是，他們的援軍源源不斷。這些東方土著與我們見到的其他土著不同，他們是有組織的職業軍隊。我們不是他們的對手，別忘了，城堡裏還有許多的我國的平民那！”
其他的軍官大都支持托馬斯神甫的意見，主張暫時妥協，盡量拖延時間，等到巴達維亞的援軍到來。最後，荷蘭人終於達成一致，把抓來的中國土著都放回去，黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍交給中國軍隊。交接儀式在城外的原野裏進行，飽受折磨的中國人向來迎接他們的親人們哭喊著奔去，而早嚇癱了的叛徒黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍則被架著他的荷蘭士兵交給了明軍，負責交接的明軍士兵看都沒看一眼，就把黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍拖回了明軍的營地。明軍營地裏，一片悲喜交集的氣氛，飽經磨難的中國人與親人抱頭痛哭。每個人都把仇恨的目光投向了黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍，尤其是長美村受害的百姓和郭懷一。
“我以閩浙粵三省總督和安國公賜予的便宜行事之權，判決黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍三人淩遲處死！諸位可有異議？”鄭芝龍大聲對黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍三個漢奸進行了宣判。
“沒有~~殺得好~~”
“殺得好~~”
鄭芝龍以前的結拜兄弟之一劉香就曾幫著荷蘭人打自己，所以鄭芝龍對投靠紅毛鬼的黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍也十分痛恨。最後，鄭芝龍決定，黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍三人淩遲處死。
在百姓的叫好聲和黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍受刑的慘叫中，鄭芝龍又宣布對英勇不屈而被殺死的百姓每人發放一百兩撫恤金（從沒收黎燈灰、岑嘴蝙、尤蟋棍三人的財產中出了），其他受難的每人五十兩補償，同時，給全軍將士每人發十兩銀子的獎金。
頓時，台灣城外的明軍營地人，人人高喊大明萬歲，歡呼聲雷動。台灣城城頭的荷蘭人看了，心中五味雜陳。
第二天，雙方開始談判，荷蘭方麵派出了以托馬斯神甫為首的談判隊伍，而明軍方麵則是以原荷蘭通事何斌為首，成員都是一些中下級軍官。荷蘭方麵一開始就要求明軍解除對赤嵌的包圍，重新向赤嵌城供水，為此，荷蘭願花巨款買水。但是被明軍斷然拒絕，明軍提出的條件也是底線，就是：荷蘭軍隊必須無條件投降，所有財物一律由明軍沒收，立刻離開台灣。投降的荷蘭平民可以釋放，但是士兵、軍官、傳教士必須由漢政府和荷蘭的聯合東印度公司談判來決定他們的命運。明軍的強硬立場和苛刻的條件使談判不歡而散。