他命基地工場製作了40個熱氣球用於特種部隊的訓練，新的特種部隊士兵必須熟練操縱熱氣球，通過熱氣球的升降控製飛行方向。必須掌握從熱氣球上空中索降和傘降的技術。他還專門研製了空中投擲的武器炸藥包，威力遠遠大於集束手榴彈，用於壓製地麵的重兵集團。每個熱氣球標準人員配置是3名，一個操作員負責操縱熱氣球，一個觀察員配備望遠鏡負責指示地麵高價值目標，一個投手負責用炸藥包攻擊地麵目標。
七月，秋高馬肥，正是蒙古人狩獵的季節，成吉思汗和其他蒙軍領袖決定再次兵進中原。此時的石盤口基地，擴編後的特種部隊已經又有60餘人佩戴鷹徽，新增加了6個作戰分隊，任命有經驗有能力的老特種兵為分隊長負責指揮。目前，特種部隊總兵力已經達到了98人，這是一支令任何敵人恐懼的武裝力量。
特種部隊早就屬於怯薛軍建製，時刻隨侍在成吉思汗左右，聽候調遣。蒙古鐵騎沿著第一次入侵中原的老路，破關而入，連克宣德、德興。隨後勢如破竹的進軍懷來、縉山，大敗複出的金國右丞相完顏綱和元帥右督監術虎高琪統帥的金軍。
金軍的戰鬥力和2年前已經不可同日而語，在野戰之中根本就不是蒙軍的對手，成吉思汗率大軍長驅直入，直抵居庸關北口。金將高琪知道蒙軍不善攻城的弱點，他采取龜縮堅守的戰術，意圖扼住蒙軍進軍中都的道路，以持久戰消耗成吉思汗。他用鐵水澆鑄居庸關門，又在北口以北布置了數十裏的鐵蒺藜，以阻止蒙軍大規模的騎兵進攻。在成吉思汗六年，大將哲別曾經以誘敵之計消滅了守關金軍，破關而入，但再讓金軍上當是不可能了。高琪不是傻子，他是絕不會出城交戰的。
蒙軍攻勢頓挫於居庸關下，成吉思汗不由得也犯難，這樣的雄關堅隘，強攻肯定是不行的。他把巴根台招入金頂大帳，命特種兵為大軍開路。巴根台命2個特種分隊，以土工作業的辦法用工兵鏟挖出鐵蒺藜，為大軍開辟了一條通道。兩個分隊輪番作業，晝夜不停，以木樁作為通道的標示。
即使是大軍能夠進駐居庸關下，發起強攻也是沒有攻克把握的，巴根台決定進行一次空中的戰術偵察。他和史天安升起熱氣球，用望遠鏡觀察戰場，發現西麵群山中有一條小路，不知通向哪裏。他們操縱熱氣球一路向西向南，看看這條小路到底是通向哪裏。
偵察結果使巴根台大喜過望，原來這條路竟然是經淶源直到紫荊關，過了紫荊關就是易州、涿州，華北大平原就在望了！果真如此，蒙軍何必在居庸關下苦戰，徒耗兵力。巴根台仔細的觀察這條小路，除了有限的幾個地段，大軍是可能通過的。
巴根台回到軍營，立刻把空中偵察的情況稟報成吉思汗。成吉思汗大喜過望，但是他還是擔心幾個人能過的小路，大軍無法通過。巴根台在羊皮紙上畫了一個圖，詳細的向成吉思汗解釋什麼地方可以實施爆破，炸開堅石，什麼地方特種部隊可以搭建橋梁，什麼地方又可以修造長梯跳板，大軍一定可以通過。
成吉思汗對巴根台的神奇偵察讚不絕口，詳細詢問了熱氣球的情況，巴根台一一作答。成吉思汗大喜：“好哇！有了這個東西，還有什麼樣的堅城能夠擋住我們呢？你是咱們草原的奇才啊，這次又立了大功！”巴根台說道：“為大汗效力，敢不盡心竭力。我願率特種部隊為主力大軍開路，特種部隊有野戰工程訓練科目，他們都是開山搭橋的好手。”
成吉思汗連聲說好，立即傳令諸將進賬聽候命令。他布置克忒和孛察兩千夫長率5個千人隊仍在北口牽製居庸關的高琪部隊，自己親帥主力由巴根台發現的這條小路進軍紫荊關，特種部隊負責開路。攻克紫荊關之後，再由哲別迂回到居庸關南口，和北口的蒙軍南北夾擊居庸關守軍。
為保證大軍在小路上行軍的安全，成吉思汗特意命令巴根台升起兩個熱氣球，監視大軍附近群山之中的情況，一有異動，立即通知大汗斡爾朵。
成吉思汗的謹慎不是多餘的，在蒙軍主力在冀北的群山中艱難行軍的時候，果然金國朝廷知道了情況。驚慌失措之下，立即命令高琪率居庸關部隊阻擊成吉思汗。巴根台的特種兵們在高空的氣球上很快就偵察到西麵來了一支大軍，打著金國大將高琪的旗號。
成吉思汗命木華黎在五回嶺險要之處設伏，一舉擊潰了高琪軍。蒙軍乘勝攻克紫荊關，東進易州、涿州，此時華北平原已經無險可守，金國的中都又一次暴露在蒙古鐵騎之下。