經北京市科委、市衛生局討論後批準，3月25日在北京安貞醫院建立北京市心肺血管疾病研究實驗室。
截止年底，醫院有各種醫療設備1760台，其中10萬元以上設備176台，總價值90543779.84元。
醫療工作門診437292人次，急診48660人次；收治住院病人8731人次，出院病人8731人次，出入院病人分別比上年增長4.51%~4.43%；年平均開放病床624張，病床使用率87.54%。門急診搶救病人1124人次，搶救成功率82.03%，搶救住院病人1498人次，搶救成功率87.7%；孕產婦死亡率0；新生兒死亡率4知，圍產兒死亡率9.0%。
全年住院病人手術3962例，其中心髒手術1803例（心髒體外循環手術1563例，冠狀動脈搭橋361例），手術死亡率47%。
認真執行中華人民共和國獻血法，積極開展自體血液回輸，全麵降低手術用血量，在全年手術增加的情況下，用血量比上年同期大幅度下降，受到有關部門表揚。
全年開展新技術、新項目、新療法75項，其中心髒內科開展的冠狀動脈內旋切技術治療冠狀動脈狹窄、安裝最新型三腔起搏器、治療肥厚梗阻性心肌病的消融治療；心髒外科開展的對升主動脈瘤樣擴張並主動脈返流患者進行新術式說如沈術，主動脈夾層動脈瘤的介入治療及器械配製；呼吸科開展的應用多導生理監測儀及呼吸機診斷治療睡眠障礙；血管科開展的周圍血管的介入性治療；心兒科開展的部分先心病介入性治療和應用大劑量免疫球蛋白靜點衝擊治療擴張性心肌病、重症心肌炎等都取得良好的治療效果。
繼續開展醫療、文化、科技三下鄉活動，全年赴懷柔縣為群眾治病648人次，查體446人次，開展各種手術78例，贈送醫療設和物品價值3萬餘元，受到當地群眾和上級醫療部門好評。
護理工作開展以提高護理質量為重點的規範化服務達標活動，堅持以病人為中心的係統化整體護理，不斷完善三級護理責任製，並采取各種方式和方法，對護理人員分層次進行護理知識更新培訓。使醫院的整體護理水平有一定提高，各項護理考核指標分別為：技術操作合格率95.449%，消毒隔離合格率98.79%表格書寫合格率98.89%，急救物品合格率99.6%，基礎護理合格率49%，病人滿意度調查：服務態度滿意率90.2%，服務質量滿意率90.32%，環境滿意率59%。
人群防治和保健堅持以醫院為中心不斷擴大社區醫療服務的方針，對朝陽區安貞裏、安華裏地區高血壓、心髒病、傳染病進行深入摸底調查，廣泛開展社區健康教育活動。該院將人群防治科與人群防治研究室合並，擴大了醫療服務範圍，在原開展的流行病調查和重點疾病預防的基礎上，加強了對社區醫療服務的管理，設立家庭病床、紅醫站，並逐步開展就近出診，使醫院的社區醫療服務不斷完善。
繼續堅持做好首都“愛心護心”工程，麵向全市開展以預防保健為內容的健康科普知識講座，全年授課43期，聽眾達7500餘人次，此項活動深受社會各界人士的好評，並得到上級衛生行政部門的肯定。
科研工作1999年經初評獲科研成果6項，其中市級3項，局級3項。在研課題71項，其中國家“九五”攻關課題6項，國家自然科學基金、衛生部課題4項，市級科研項目39項，其它課題22項。
加強對重點學科建設，申請建立北京市心肺血管疾病研究室，集中開展對冠心病的病因、診斷治療與預防的研究。
大器官移植成果顯著，心髒移植、肺移植已作為醫療常規手術開展。
全年在各類雜誌發表論文119篇，待發表論文299篇，會議征文124篇。