北京防癆協會
組織機構建設本會注冊會員總數達440餘人，理事單位13個，理事長19人，定期召開理事會、常務理事會，及時解決學會工作中的各種問題，保障學會在健康的軌道上運行。充分調動理事單位的積極性，借助多方力量，搞好工作，並加強對理事單位的服務。同時完善了工作管理製度，建立了職責範圍，規範了學會運行。
積極發展新會員，吸納中、青年防癆工作者入會。1999年接納新會員38人。
學術活動1999年共開展活動6次，內容包括最新世界上結核病控製工作情況介紹、全國結核病流行情況、肺結核病影像學的診斷與鑒別、結核病控製、基礎理論、結核菌分子生物學、結核病的外科手術適應症、臨床病例討論會等，共有千餘人次參加，人數逐年上升。有50餘名會員參加中國防協會舉辦的各種學術交流或全國結核病知識新進展學習班。
11月2—5日，在昆明市召開中國防協會全國學術會議，本會有60餘人參加了會議，在大小會上交流論文16篇。
10月，本會根據市科協評選青年優秀論文的通知，組織各理事單位投稿參加評選，經協會專家評審，評出二等獎2篇，三等獎1篇，並上報市科協參加評審。國際交流為加強與國際防癆界的聯係，及時了解國際上的學術動態和信息，10月，本會與掛靠單位共同舉辦了為期10天的“國際肺部健康研究方法”學習班，來自全國各省、市的防癆人員和國外（有美國、尼伯爾、蒙古、越南、柬埔寨和我國台灣省）的防病同道共25人參加，由國際肺病聯合會及英國和澳大利亞醫學院等著名專家授課，介紹國際上先進的做法和新的知識。組織7人赴香港參加第20屆國際防癆和肺病聯合會東區國際學術會議。
科技谘詢本著科技周活動原則和主題“促進科技進步，提高全社會人民的科技素質”組織協會會員參加了活動。為了宣傳和普及結核病傳染的預防方麵的基本知識，本協會與掛靠單位編印了簡單易懂的宣傳畫冊二種，在科技周谘詢活動中發放宣傳畫冊約300餘份，谘詢人數約150餘人次。科技周活動中組織報告會1次，約100餘人參加。
科技周期間組織了科技下鄉活動，5月14日，理事長帶隊與知名專家到門頭溝區，幫助基層中、小學校醫務室的醫務人員提高現代控製結核病的理論知識，並做了技術指導，此次參加人數約150餘人。
3月25日，本會與掛靠單位共同舉行了“3.24世界結核病防治日”專家座談會，主要是學習和貫徹李嵐清副總理對結核病防治工作的重要講話。副市長劉敬民、市衛生局副局長、中國防協會和北京防癆協會及衛生部結核病控製中心主任等專家以及新聞界記者共40餘人出席，會上本會理事長屠德華報告了北京市結核病控製工作情況，劉敬民副市長作了重要講話，專家們就控製結核病的熱點問題進行了座談。
本會製作的宣傳折頁在11月昆明舉行的中國防協會全國科普宣教會上獲一等獎。
北京性病艾滋病防治協會
12月1日，本會在衛生部、廣電部、教育部召開的預防與控製性病艾滋病總結表彰大會上，被評為全國預防與控製性病艾滋病先進集體。
開通24小時電話語音免費服務熱線7月22日，開通了24小時電話語錄服務熱線。這條熱線是在總結第一條專家谘詢熱線的基礎上，為適應性病艾滋病防治工作的需要建立的，是國內（香港地區除外）第一條性病艾滋病24小時電話語音服務熱線。共有123個艾滋病性病基本知識供群眾按鍵查詢。開通的當天，市衛生局和協會聯合舉行了開通儀式。衛生部和市衛生局的領導、各區縣衛生局和各醫療單位的負責人，以及協會全體理事出席。全國人大常委會何魯麗副委員長親自撥通了第一個谘詢電話。全國協會副會長戴誌澄教授、聯合國艾滋病規劃署駐京辦事處顧問傅愛民博士到會講話。截止到年底，已收到電話20001個。原62238683人工熱線仍繼續運轉。
健康教育圍繞1999年“關注青少年，預防艾滋病傾聽、學習、尊重”世界艾滋病防治宣傳活動主題，在世界衛生組織的支持下，麵向高校做了較多的工作。