8日
市衛生局黨組“三講”教育總結大會召開，局黨組“三講”教育結束。
8—26日
市中醫管理局組織1999年度中醫藥科技成果鑒定會，29項成果通過鑒定。其中，市科技進步一等獎2項，二等獎8項，三等獎8項，局級獎11項。
12日
市衛生局召開北京市整頓中藥飲片市場暨中藥飲片精品店發布會。
15日
金衛網“健康促進”谘詢網站開通，同時開通健康谘詢熱線電話，為市民提供健康促進知識谘詢。
16日
聯合國秘書長安南夫人參觀北京佑安醫院“愛心家園”，朱宗涵局長陪同。
19日
市衛生局召開全市藥品購銷不正之風治理大會，市衛生局局長朱宗涵、市監察局局長秦剛及市糾風辦、市工商局、市醫藥總公司、市勞動局、市經委、市審計局領導出席大會。
20—21日
全國醫師資格考試。北京市共有6250名考生，分別參加臨床、口腔、公衛、中醫四個類別的醫師、助理醫師資格考試。衛生部部長張文康、副部長朱慶生分別在市衛生局局長朱宗涵、副局長金大鵬的陪同下到考點視察。
24日
朱宗涵局長向市人大常委會文衛體委員會彙報1999年工作情況和2000年工作計劃。文衛體委員會主任藍天柱、副主任江鏡波聽取了彙報。
12月
1日
市中醫管理局於11月底至12月初實施“健康使者工程”。該項活動是國家中醫藥管理局開展的一項支持農村中醫藥工作，在農村鄉村設立10萬個鄉村活動醫藥圖書室。市中醫管理局在順義、通州、門頭溝3個區建立了20個鄉村醫藥圖書室，對其給予一定的經濟支持，成為本市首批“健康使者工程”單位。
3日
北京市開展適齡兒童脊灰疫苗強化免疫活動。國務院副總理李崗清到西城區潔如保育院參加活動。國務院辦公廳副秘書長徐榮凱、衛生部副部長王隴德、殷大奎、北京市副市長劉敬民陪同。本次活動全市設立接種點3000餘個，接種對象近20萬人次。
9日
11月23日開始，市中醫管理局開展“創建北京市綜合醫院示範中醫科”工作，組織專家對天壇醫院、宣武醫院、朝陽醫院、兒童醫院、友誼醫院、北京市回民醫院6所綜合醫院評審，6家單位均被批準為北京市綜合醫院示範中醫科創建單位，創建周期3年。
10日
市衛生局黨組召開“三講”教育總結大會。按照市委“三講”教育領導小組《關於認真做好處級領導幹部“三講”教育工作》的通知精神，市衛生局於9月24日至12月10日開展了機關處級以上領導幹部“三講”教育工作。除局黨組成員外，機關71名副處級以上幹部中，70名參加了“三講”教育（1名出國）經過思想發動學習提高、自我剖析聽取意見、交流思想開展批評、認真整改鞏固成果4個階段的學習，從思想上加深了對馬克思主義、毛澤東思想和鄧小平理論及黨的方針政策的理解，堅定了理想信念，政策水平和思想素質有了新的提高，增強了與黨中央保持高度一致的自覺性。
18日
市衛生局舉辦老幹部迎澳門回歸書畫展。
23—24日
市中醫管理局受國家中醫管理局委托，組織山西、天津、北京專家對順義區進行創建“全國農村中醫工作先進縣”驗收，同意該區為“全國農村中醫工作先進縣”並上報國家中醫管理局審批。
市衛生局科技處組織召開申報2000年市科委新星計劃人選答辯會。48位申請人進行了綜合答辯。郭積勇副局長參加了答辯會。
27日
市衛生局召開弘揚首都婦幼衛生工作精神表彰婦幼衛生工作者暨先進事逐報告會。全國人大常務副委員長彭珮雲、衛生部副部長彭玉、全國婦聯副主席劉海榮、市人大常委會副主任陶西平、副市長劉敬民及市委宣傳部、市婦聯、市計生委等領導出席了大會。市衛生局黨組書記、局長朱宗涵宣讀了中共北京市衛生局黨組關於《弘揚首都婦幼衛生工作精神，向林傳家、胡亞美、黃醒華、王硯英同誌學習的決定》。會上，對首都地區從事婦幼衛生工作50年的37位醫務人員和從事婦幼保健工作30年的250餘名醫務人員進行了表彰，市衛生局給包括胡亞美、張金哲、宋鴻昭3名院士在內的290餘名婦幼先進工作者頒發了榮譽證書。
31日
首都各界迎接新千年慶祝活動的衛生防病和醫療保障任務圓滿完成。