在劉裕看來，隻是轄下一些不知好歹的胡人要逃跑罷了，殺了也就殺了這沒有什麼大不了的，但是要知道關中百年來都是胡漢雜居，現在的胡人甚至占了關中大多數的人口，這其中也有匈奴，鮮卑，氐人等失敗的胡族政權後人，劉裕對羌人這種趕盡殺絕的做法也引來了其他胡人的戒懼，也為日後長安百姓驅除朱超石埋下了禍根。
這雜事處理完了，剩下的就是如何分配戰利品，以及獎賞此次北伐成功的晉軍將士，劉裕下令除了把一些後秦重要的禮儀工具比如，皇帝車駕、祭祀用的器具、渾天儀、指南車之類的東西送回建康之外，其餘後秦府庫裏麵的金銀玉石、綾羅綢緞、稀世珍寶一律分發給手下的將士，這樣一來晉軍的士兵每個人都可以說富得流油了，跟著劉大哥混，果然沒錯。
士兵們得了這天大的彩頭肯定是很高興的，但是那些將領們心裏卻未必會滿意，因為第一個攻下長安城的王鎮惡早把府庫裏的財寶都挑過一遍了，劉裕對這些財不是很在意，但是那些將領可不是聖人君子，憑什麼你就要比我們分得多，甚至於你先挑了才有我們的份，這說出去我們都丟份兒。
因此馬上就有人向劉裕上奏，說是王鎮惡貪汙了，貪汙的數目還不小，中國自古以來就是人治社會，劉裕雖然也要求戒除貪汙，但是因為王鎮惡的功勞很大，所以對別人來說抄家滅族的大族，劉裕就輕輕放過了，有人一看說王鎮惡貪汙不起效，立馬就汙告王鎮惡有造反之意，至於理由就是他私藏了姚泓的一輛禦用輦車，意圖自立。劉裕一聽這還得了，這些代表皇家權利的東西他也不敢要，全部送往建康去了，難道王鎮惡真的吃了熊心豹子膽了？
所以劉裕馬上就派人去查，結果卻是虛驚一場，原來王鎮惡是剔取了輦車上的金銀珠飾，然後把輦車拋棄到城牆的外麵，他完全沒有私藏輦車的意圖，但是經過此事，劉裕確實對王鎮惡起了一絲疑心。
本來王鎮惡攻下長安城，大功就不好賞，史書記載的這件事我們一聽就有些不敢相信，王鎮惡既然已經先把後秦的府庫都挑選了一遍，還有必要做得這麼誇張麼？居然把姚泓車駕上的金玉飾品給挖了藏回家中，而且還做得這麼光明正大，實在是有些不符合他的風格。
其實先前王鎮惡大肆貪汙府庫中的財寶，劉裕就明白王鎮惡是想向他表明，自己是一個貪財的人，自己沒有爭權奪利的心思，不會擁兵自立，更不會功高震主，所以他就自動送上了一個把柄交到劉裕的手上，王鎮惡這是學秦國的王翦，他在伐楚的時候大軍沒有行動，反而向秦始皇多要田產，就是為了表明自己是一個貪財的人，以免引起主上的猜疑，劉裕是何等樣的人物，王鎮惡的心思他一瞧就明白了，因此那麼多人都說王鎮惡有罪，他也沒有處理。
隻是這一次，王鎮惡就表演得有些過了頭，反而引起了劉裕的猜疑，畢竟王鎮惡這一次做得太過讓人不敢相信，他三番四次的表明自己沒有野心，反而讓劉裕猜疑他心裏是有野心的。隻不過王鎮惡新立大功，又得關中百姓的支持，也沒有露出明顯的反意，劉裕也就把這件事記在了心裏，日後他自有安排，從而也引出了後來的晉軍內哄。
這大軍攻下長安城後，叛逆也斬殺完了，將士們也都賞賜過了，劉裕做的第一件事就是去往長安城外祭拜漢高祖劉邦的陵墓，劉裕在劉邦的墓前說了些什麼又做了些什麼我們不得而知，但是我們從他接下來的動作就可以猜測一二。
拜祭完劉邦那個名義上的祖宗之後，劉裕就在未央宮大宴北伐大軍的各位將領，未央宮是以前漢朝的政治中心，是皇帝處理政事的重要所在，也是皇城的權利中樞，酒足飯飽之後，劉裕在宴上向各位同僚提出了一個他早就打算好了的計劃，遷都，把晉朝的國都由建康遷到洛陽，這樣做不僅是為了立足中原，為進一步的恢複故土做準備，再一個原因就是建康城經過東晉朝廷的百年經營，劉裕在那裏竄晉自立還是有不小的風險的，可是到了洛陽之後，那些世家大臣也就沒有了根基，揉捏搓圓還是由他劉裕說了算，這一點就跟當年的曹操把大漢都城從洛陽遷往許昌有異曲同工之妙。
可惜，劉裕的這個想法剛提出來，就遭受到了下屬們的反對，其中最有份量的不是別人，正是太原人王仲德。