司馬遷在感慨中離開韓信的家鄉，渡淮水，乘烏篷船沿泗水向北行，到了原魯國的都城（今山東曲阜縣）。這裏是至聖先師孔子（公元前551—前479年）出生的地方，周代的重要文化中心。當時漢朝獨尊儒術已有十年了，孔子的誕生地的景象應有所複原。司馬遷可能看見，當年孔子居住、學習的地方這時已建成為廟堂，陳列著孔子的衣、冠等物件。司馬遷寫下自己的觀感：“自古以來，天下的君王賢人也算很多了，活著的時候很榮耀，到他一死就什麼也沒有了。孔子僅是一個平民，普天之下，君王和賢德的人不可勝數，他們在世時榮耀一時，死後默默無聞。孔子隻是一個普通的平民，可他的學說和家世至今已流傳十餘代了，凡是求學問的人，都尊他為宗師……孔子真可說是一位聖明到極點的人了！”
孔子是儒學的創始人，又是大教育家和史學家。他的教育和倫理思想影響中國兩千多年。
據說，孔子的父親名叫叔梁紇，住在魯國昌平鄉陬邑（春秋前期為鄒國的國都，今山東省曲阜東南的鄒城）。母親是顏氏的第三個女兒。叔梁紇原配施氏，生了九個女兒，沒有生兒子。為了生一個兒子，叔梁紇向顏氏求婚，顏氏有三個女兒，三女名叫徵在。徵在的父親問三個女兒：“這個求婚者是陬邑的大夫，他的先人是聖王的後裔，身長十尺，武力絕倫，雖然年紀大點，性格嚴峻，但為人是好的。”大女、二女都不願嫁給年老的叔梁紇，惟有三女徵在願意遵從父命，嫁給叔梁紇。
徵在婚後，為了請求神靈讓自己生一個兒子，在尼丘山（在今鄒城西部）上禱告，徵在上山時，草木的葉子都向上，表示歡迎她；禱告完畢下山時，草木的葉子都下垂，表示歡送她。就在這個夜晚，她夢見玄帝顓頊召喚她，對她說，你將生下一個聖人。醒來後，就懷了孕。
孔子快要出生時，有麒麟吐玉書於闕裏（鄒城西部一地名，孔家所在地）。書上說：“水的精靈的兒子要降生了，將承繼衰落的周朝的王室，而為素王。”他誕生的那天早晨，有兩條神龍環繞他家的房屋飛，還有五個老神仙降臨庭院護衛，以免妖魔入侵。他母親顏氏房中，聞聽到均天之樂。空中有聲音說：“天生聖人。”孔子生有異相。牛唇虎掌，鴛肩龜背。胸膛上隱約現出五個字：“製作定世符。”他父親叔梁紇說：“此兒是掌管尼山的神靈。”因此給他取名叫丘，字仲尼。
孔子三歲的時候，父親叔梁紇就死了，葬在防山（位於今曲阜縣東二十裏，後人稱啟聖林。）
孔子六歲的時候，做遊戲，常擺起各種祭器，學著大人祭祀時的禮儀動作。
孔子十七歲的時候，魯國大夫孟僖子跟隨魯昭公到楚國去，回來後，深感自己不懂外交禮儀而自責。後來，他臨終之際，告誡自己的嗣子孟懿子和次子南宮敬叔說：“孔丘這個人，是聖人商湯的後代，他的先祖弗父何本來可以繼位做宋君，卻讓給了他的弟弟厲公。聖人的後代，不一定都是公侯將相，但一定會有才德顯達的人出現。如今孔丘年少好禮儀，他不就是將要顯達的人嗎？你們一定要師事孔丘。”孟僖子死後，孟懿子和南宮敬叔便去向孔子學禮。