五天後以“泰山號”三桅戰艦和陶要富、文老二的遼東十餘艘海軍艦船護航的第二批去台灣的船隊出發了，隨行的楚翊、薛十一、薛克己、武伯以及饒國英的騎兵部隊，火藥廠、造船廠大部工人，還有三千人的遼民家庭包括一批物資。
薛雲同燕三娘經過仔細商量決定，由陸要金負責長塗島的全麵防務，左明主力鎮守大長塗島，王平駐守小長塗島，喬國梁，劉滿囤、宋奎負責江南移民工作，牛三、馬濤因為所部多是南方士卒，由牛三、馬濤擇其可靠手下，配合喬國梁，劉滿囤、宋奎的工作組，鼓勵江南甚至更遠的貧民前去台灣開荒謀生。
喬國梁，劉滿囤、宋奎的工作組是以自願的原則，鼓動那些貧窮無生計的百姓去台灣，台灣方麵提供每人五十畝田土作為私產，一處青瓦房，一年口糧和種子，三年免征賦稅，不過工作組私下有個杠杠就是家裏必須有輕壯，哪怕是閨女也可以，畢竟如今的台灣是男多女少，將來有多少年輕男子要安家立業，女人也是非常稀缺的。
第二批去台灣的船隊出發後的第三天，杭州知府徐元朗通知長塗島敲定了杭州商船隊去朝鮮的規模，可能是考慮到朝鮮依附了建虜，還有薛家軍遼東軍在海上傷亡貽盡的因素，這次組才是船隊去朝鮮貿易的船是二十七艘，基本上是第一次獲利的那些商人，新進入的海商寥寥無幾，出發的時間定在吉日五月初九。
薛雲已經決定五月五日離開長塗島，先遣的王二娃一千精銳已經開始秘密前往杭州郊外燕莊集結，還有就是死皮賴臉要跟著去的閻老幺，薛雲被纏得沒有辦法，隻好同意閻老幺跟著去，考慮到閻老幺手下良莠不齊，薛雲隻允許閻老幺帶一百手下跟隨。
五月四日這天，薛雲跟燕三娘進行了一次長談，崔愛在一旁做記錄，燕三娘確定的第三批去台灣的船隊，包括所有的遼民和北直隸過來的民眾，朝鮮廢君光海君李琿及其跟隨者和大批精鐵、硫磺等物資。
薛雲最終拍板讓“泰山號”三桅戰艦回到長塗島之後，正式加入陶要富、文老二的遼東海軍，薛家軍內部更名為薛家軍北海艦隊，巡視範圍包括朝鮮，琉球、日本，從而使薛家軍遼東海軍上升一個大大的台階，可是從一偶之地走向了大洋。
薛雲給燕三娘提出了幾處需要重點關注的地方，第一，去年天啟皇帝朱由校宮中西苑乘船遊玩時被一陣狂風刮翻了小船，不小心跌入水中，差點被淹死。雖被人救起，經過這次驚嚇，卻落下了病根，多方醫治無效，身體每況愈下，薛雲認為皇帝可能易主，信王朱由檢可能繼位，要燕三娘加快對京城薛家一般人員的轉移，強化留守人員的安全，其行動和撤離都應該有多種預案準備。
第二，關注福建、廣東海盜動向，特別是鄭芝龍的十八芝；注意收集西洋的科技書籍和人才，金錢上要使其來大明淘金的西洋人感到有足夠的誘惑難以抗拒，加大對歐洲、南洋一般性的情報收集，所有的人才、資料、情報轉送台灣。
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第三，薛雲認為遼東有大戰，要燕三娘密切關注遼東、朝鮮、東江鎮的情況，特別是薛綜率領的“薛家軍”，在必要的時候可以命令薛家軍北海艦隊隔海支援，薛雲鎖定的救援首要目標是薛九、薛十、薛慶益，如果台灣方麵海上平靜，可以暫時讓第二艦隊繼續留在長塗島待命。
第四，就是重點監控陝西方麵的民亂，加大同大同方麵的經濟、軍事、情報合作，在必要的時候可以給民亂義軍提供物資幫助，或者派人加入民亂義軍，對民亂義軍進行控製，條件成熟的通過整編變成我薛家軍的外圍組織。
燕三娘聽薛雲交代完了之後說道：“弟弟，陝西方麵長塗島、大同都離得太遠，恐怕隻有遙控，不過大同軍方麵馬鳴千總部正在米脂縣，不如讓高妹妹和馬鳴千總具體*辦吧。”
薛雲疑惑地問道：“馬鳴那小子我倒知道，姐姐說的高妹妹是何人。”
燕三娘瞪了薛雲一眼說道：“不是你在外麵養的女人嗎，怎麼一兩年就忘得幹幹淨淨了，人家還癡心的等著你呢，真是癡心女子負心漢。”
薛雲有些稀裏糊塗隻好問道：“姐姐，弟弟真的不明白是怎麼一回事情。”
燕三娘也開始覺得奇怪就說：“就是去年李小勇給米脂縣高桂英送的汗血寶馬惹禍，高桂英隻好聚相鄰拉杆來大同城投奔你，在陝西神木兵敗，又敗於府穀，逃到葭州境內，還是李小勇、陽震雷帶兵去救的，打敗了葭州、榆林的兵馬，這才讓高桂英和他弟弟在米脂縣接受招安，做了一個副千總當起朝廷的官員來了。”