西班牙菲律賓總督科奎拉，在得知台灣島北部的西班牙軍隊遭到明朝軍隊，攻擊時，這個瘋狂的侵略者暴跳如雷，覺得是執行入侵明朝計劃的時候了，科奎拉製定了於征服明朝先占領台灣的計劃，立即在占領地呂宋、蘇祿國招收仆傭軍參戰。
到八月初菲律賓總督科奎拉征召仆傭軍五千人，由五百西班牙軍人率領其中的三千仆傭軍，眼台灣島東麵繞行抵達北麵的雞籠港，與在哪裏跟明朝軍隊作戰的西班牙軍隊會合，這下子西班牙上校佛郎西斯科牛了起來。
佛郎西斯科上校在台灣北部一個有三千多武裝力量，主要盤踞在雞籠的聖多明各城，以聖多明各城向南發展，還收編了一批台灣土籍部落，不久之後台灣南方大員發生了明朝官軍跟尼德蘭（荷蘭）人之間的戰鬥。
荷蘭人的強大佛郎西斯科上校是心知肚明，他準備等明朝跟荷蘭人兩敗俱傷，那時候西班牙軍隊才出來坐收漁人之利，因此佛郎西斯科上校嚴令自己的軍隊不得南下，以免刺激明朝和荷蘭人雙方，破壞了自己的如意算盤。
哪知道僅僅半年荷蘭人就敗走了，這時佛郎西斯科上校才如夢初醒，知道收漁人之利是沒有了，這荷蘭人怎麼這樣慫包，早知道就應該跟荷蘭人聯合打敗了明朝軍隊，現在讓佛郎西斯科上校麵對強大明朝還是心裏發慌。
不過荷蘭人敗出台灣大員後，就有源源不斷的消息傳給佛郎西斯科上校，說明占領台灣島的明軍，隻是明朝一個總兵的私軍，而且關於這個明朝私軍“薛家軍”的情報也遠遠傳來，佛郎西斯科知道是明朝海匪十八芝傳來的，佛郎西斯科上校暗暗嘲笑這些明朝人就是喜歡窩裏鬥。
佛郎西斯科上校本來對東方古國明朝就看不起，不過大明朝爛船也有三斤釘，海上強國葡萄牙幾次進攻明朝都折戟而返，所以西班牙菲律賓總督科奎拉海上非常顧忌這個龐大的古帝國，現在台灣島僅僅是一支明朝地方軍閥的私軍，沒有了明朝這個古帝國支持，佛郎西斯科上校對打敗薛家軍占領台灣島充滿了信心。
於是佛郎西斯科上校一邊向菲律賓總督科奎拉彙報台灣島的情況，一邊開始加緊了對台灣南麵的占領，終於在今年的六月同南邊的薛家軍發生了武裝衝突，持續的戰鬥讓佛郎西斯科上校的部隊死傷了上千人，明朝薛家軍的戰鬥力讓佛郎西斯科上校刮目相看，如果不是菲律賓總督科奎拉同意了他的計劃，並排來了一千八百名士兵（西班牙士兵六百、菲律賓地區仆傭軍一千二百人），佛郎西斯科上校可能準備求和了。
得到了援軍的佛郎西斯科上校，就跟薛家軍在新竹、宜蘭一線打起了持久戰，親自上陣的佛郎西斯科上校見識了薛家軍的手雷、炸藥包和前膛槍，才知道這支明朝的薛家軍熱兵器並不輸於自己，西班牙王國的火槍隻是在射程和命中率上有一定優勢。
這時的佛郎西斯科上校才知道碰上了硬茬，一麵繼續向上司菲律賓總督科奎拉求援，一麵向台灣北部的平埔番、高山番結盟示好，遊說平埔番、高山番的部落協助西班牙軍打敗明朝薛家軍利益共享。
佛郎西斯科上校的努力沒有白費，八月底到來了菲律賓方麵援軍三千五百人，還有二十艘中等戰艦，菲律賓總督科奎拉約佛郎西斯科上校九月上旬共擊薛家軍，南線西班牙軍出動二十五艘戰艦，西班牙正規軍一千人，仆傭軍兩千人，另有一千海軍火槍隊。
佛郎西斯科上校認為上司菲律賓總督科奎拉的計劃太偉大了，於是佛郎西斯科上校組織了自己的兩千嫡係和一千多部落武裝，共計六千八百多人，平推著至新竹、宜蘭一線待命，在九月初六日對薛家軍發起了總攻，
薛家軍經過短暫戰鬥後撤退，佛郎西斯科上校認為勝了，下令全軍追擊薛家軍，在九月初七日伴晚，佛郎西斯科上校率領的西班牙聯軍，被三萬薛家軍和台灣部落民軍包圍在台中地區，接下來就是一場殘酷的攻防戰。
好在有台灣科學技術院的技術支持，陸伯擴大的火藥廠得到京城王恭廠師傅的火藥新配方，在炸藥包的威力和火統的射擊距離都大有進步，這次被薛破虜帶到了台中，特別是高爆炸藥包成了炸垮西班牙軍隊的利器。
薛家軍對西班牙軍隊四麵圍攻，不斷啃掉西班牙的小股隊伍，這時薛破虜得到西班牙海陸軍在高雄登陸的消息，台灣島上薛家軍麵臨南北夾擊，薛破虜一麵命令紀天恩所部在占領高雄、屏東一線嚴防死守，一麵命令連熊偉所部抽調隊伍支援。
薛破虜對西班牙鬼子恨得牙癢癢的，為了盡快結束北線戰鬥，擺脫西班牙人的兩麵夾擊薛破虜重賞之下出死士破襲西班牙軍陣地，成百上千的勇士抱著炸藥包衝了上去，硬是一個一個壕溝，一個一個堡壘的炸開，用螞蟻搬家的手法把西班牙軍隊吃掉。