圍攻絳州的三十六營義軍雖然知道大同薛家軍回來救援，卻沒有想到薛家軍來得這麼快，薛家軍的人馬會如此的多，倉皇之下兵敗如山倒，二十多萬大軍基本上沒有像樣就作鳥獸散了。
紫金梁王自用沒有來得及召集兵馬，哈日珠拉帳下萬夫長阿如罕，率領蒙古鐵騎已經踏破王自用的中軍，猶自要負隅頑抗的王自用，被部將張述聖、姬三兒挾離了中軍，王自用剛剛離開中軍大營，整個營盤就被阿如罕的蒙古大軍占領，不久逃出來的敗兵告訴王自用，大將黃虎已經死在亂軍之中了，王自用知道敗局已定歎了口氣，率領部分人馬投萬榮去會合闖王高迎祥部。
蒙古阿如罕的騎兵後發先至，所部包括薛九、薛十、薛慶益、肖參將、劉國永的四千人馬，會合薛六的大同軍，兩萬多將士六萬多戰馬，那陣勢端的是千軍萬馬，人農民出身的起義軍嚇破了膽，整個起義軍幾乎是不戰自潰。
絳州城軍民得知義軍殺到，在王大軍的率領下出城聚殲殘敵，殺死和俘虜義軍達到五萬多人，其中俘獲的義軍首領就有大名鼎鼎的撞塌天劉國能，隨後阿如罕、薛六轉攻武平關方向的義軍，哪知道見機得快的點燈子趙勝、闖王高迎祥、不沾泥張存孟、八大王張獻忠、、曹*羅汝才不戰而逃，掃地王、邢紅狼，黑煞神、亂世王、張妙手、白九兒、一陣風、七郎、大天王、九條龍、四天王、上天猴、丫頭子，齊天王、映山紅也跟風逃走，阿如罕、薛六不戰解了武平關之圍，雷霸天、溫存陽率領武平關軍民出關還是繳獲了義軍遺失大量帳篷牛羊糧食財物，算是狠狠的發了一筆橫財。
薛六遵照薛雲的既定政策，有選擇的招募了一批農民軍俘虜，人數在五千人上下，然後根據農民軍互相之間的舉報，斬殺了八千帶有血債的義軍頭目和士兵，並把剩餘的兩萬多義軍釋放，發給少量的糧食許他們去投盤踞在萬榮的起義軍。
不過這些去投奔萬榮的義軍俘虜，在途中遭到來自沁水的曹文詔部的攻擊，手無寸鐵的義軍俘虜，被曹文詔、曹變蛟叔侄屠殺過半，這些被薛六釋放的義軍俘虜，隻有五六千人義軍逃到了萬榮，其餘的義軍紛紛四散奔逃，後來很多義軍將士逃到北直隸、河南、山東境內流浪作亂。
紫金梁率領闖將李自成、滿天星、李晉王、黨家、破甲錐、八金剛、混天王、蠍子塊、催山虎、衝天柱、油裏滑、屹烈眼敗至萬榮，十餘萬人馬損失過半，特別是李晉王、黨家、破甲錐、八金剛幾部幾乎全軍覆沒，王自用所部同點燈子趙勝、闖王高迎祥、不沾泥張存孟等部會合，還是有近十七八萬人馬，而薛家軍並沒有乘勝追擊，這使得三十六營的義軍鬆了一口氣，不過這些義軍再不願意跟薛家軍作戰，吵鬧著要殺回陝西去。
自絳州兵敗王自用的威信大降，又得被放回來的義軍報告，薛家軍願意跟義軍井水不犯河水，這使得三十六營的義軍頭領更無戰意，甚至還恨上了李自成、張獻忠兩個積極主張攻打薛家軍的禍包，特別是是張獻忠被爆出跟米脂薛家軍的舊怨，憤怒的三十六營義軍首領差點張獻忠撕成碎片，還好在闖王高迎祥的庇護下，在武平關損失慘重的張獻忠，率先從榮河逃入了陝西境內的韓城。
隨後紫金梁王自用順從眾議，等到自己和點燈子的老營從大寧、石鼓來投，就率領陝西三十六營義軍從韓城返回陝西，到了韓城之後義軍分裂成兩大股，闖王高迎祥、點燈子趙勝、不沾泥張存孟、闖將李自成、八大王張獻忠、曹*羅汝才等留在陝西南部活動，紫金梁王自用率領老回回馬守應、混天王、蠍子塊、催山虎、衝天柱、油裏滑、屹烈眼、上天猴、丫頭子等北上會合綏德州的王子王照希，得知三邊總督洪承疇去了山西，一舉攻下了葭州城，毛知縣趁亂逃走，守備郭景嵩陣亡，接著王自用再陷府穀、神木，占領了陝西整個東北角，兵鋒之盛遠超橫天一字王王嘉胤當年。
王自用的實力還是陝西義軍中的老大，不過久走夜路吃了虧的王自用，對米脂高家軍寨是敬而遠之，甚至在位子王照希控製的綏德州，也沒有加派一兵一卒，更不要說去拿下綏德城了，就是這樣王照希跟王自用還是逐漸陷入了水火不容的境地。
在薛家軍和陝西義軍絳州之戰中，獲利的除了客軍曹文詔部之外，平陽府的官軍有獲利頗豐，薛六考慮到保護杭州至大同的商路，也為了給日後留下合作的空間，薛家軍對平陽府官軍奉送了大量從義軍繳獲的戰利品，足夠平陽府官軍報一個殲滅上萬義軍的大功，而平陽府官軍中，千總趙日滿更是得到了查幹巴日的饋贈，二人私下連續見了幾次麵，從此趙日滿成了薛家軍埋在平陽府官軍裏的內線。