時餘方訪君寓，對坐榻上，有所擘畫，而抄捕南海館之報忽至，旋聞垂簾之諭，君從容語餘曰：“昔欲救皇上，既無可救；今欲救先生，亦無可救，吾已無事可辦，惟待死期耳！
雖然，天下事知其不可而為之，足下試入日本使館謁伊藤氏，請致電上海領事而救先生焉。”餘是夕宿於日本使館。君竟日不出門以待捕者，捕者既不至，則於其明日入日本使館，與餘相見，勸東遊，且攜所著書及詩文辭稿本數冊，家書一篋托焉。曰：不有行者，無以圖將來；不有死者，無以酬聖主。
今南海之生死未可卜，程嬰杵臼，月照西鄉，吾與足下分任之。”遂相與一抱而別。初七八九三日，君複與俠士謀救皇上，事卒不成。初十日遂被逮。被逮之前一日，日本誌士數輩苦勸君東遊，君不聽，再四強之，君曰：“各國變法，無不從流血而成，今中國未聞有因變法而流血者，此國之所以不昌也。有之，請自嗣同始。”卒不去，故及於難。君既係獄，題一詩於獄壁曰：“望門投宿思張儉，忍死須臾待杜根，我自橫刀向天笑，去留肝膽兩昆倉。”蓋念南海也。以八月十三日斬於市，春秋三十有三。
就義之日，觀者萬人，君慷慨神氣不少變。時軍機大臣剛毅監斬，君呼剛前曰：“吾有一言。”剛去不聽，乃從容就戮。嗚呼烈矣！
君資性絕特，於學無所不窺，而以日新為宗旨，故無所沾滯；善能舍己從人，故其學日進。每十日不相見，則議論學識必有增長。少年曾為考據、箋注、金石刻鏤、詩古文辭之學，亦好談中國古兵法；三十歲以後，悉棄去，究心泰西天算、格致、政治、曆史之學，皆有心得，又究心宗教。當君之與餘初相見也，極推崇耶氏兼愛之教，而不知有佛，不知有孔子；既而聞南海先生所發明《易》《春秋》之義，窮大同太平之條理，體乾元統天之精意，則大服；又聞華嚴性海之說，而悟世界無量，現身無量，無人無我，無去無住，無垢無淨，舍救人外，無他事之理；聞相宗識浪之說，而悟眾生根器無量，故說法無量，種種差別，與圓性無礙之理，則益大服。自是豁然貫通，能彙萬法為一，能衍一法為萬，無所罣礙，而任事之勇猛亦益加。作官金陵之一年，日夜冥搜孔佛之書，金陵有居士楊文會者，博覽教乘，熟於佛故，以流通經典為己任。君時時與之遊，因得遍窺三藏，所得日益精深。其學術宗旨，大端見於《仁學》一書，又散見於與友人論學書中。所著書《仁學》之外，尚有《寥天一閣文》二卷，《莽蒼蒼齋詩》二卷，《遠遺堂集外文》一卷，《興算學議》一卷，已刻《思緯吉凶台短書》一卷，《壯飛樓治事》十篇，《秋雨年華館叢脞書》四卷，《劍經衍葛》一卷，《印錄》一卷，並《仁學》皆藏於餘處。又政論數十篇見於《湘報》者，反與師友論學論事書數十篇。餘將與君之石交等共搜輯之，為《瀏陽遺集》若幹卷，其《仁學》一書，先擇其稍平易者，附印《清議報》中，公諸世焉。君平主一無嗜好，持躬嚴整，麵有秋肅之氣。無子女，妻李閏，為中國女學會倡辦董事。
論曰：複生之行誼磊落，轟天撼地，人人共知，是以不論，論其所學。自唐宋以後，呫畢小儒，徇其一孔之論，以謗佛毀法，固不足道，而震旦末法流行，數百年來，宗門之人，耽樂小乘，墮斷常見，龍象之才，罕有聞者。以為佛法皆清淨而已，寂滅而已，豈知大乘之法，悲智雙修，與孔子必仁且智之義，如兩爪之相印。惟智也，故知即世間即出世間，無所謂淨土，即人即我，無所謂眾生，世界之外無淨土，眾生之外無我，故惟有舍身以救眾生。佛說：“我不入地獄，誰入地獄？”孔子曰：“吾非斯人之徒與而誰與？天下有道，丘不與易。”故即智即仁焉。既思救眾生矣，則必有救之之條理。故孔子治《春秋》，為大同小康之製，千條萬緒，皆為世界也，為眾生也，舍此一大事，無他事也。《華嚴》之菩薩行也，所謂誓不成佛也。《春秋》三世之義，救過去之眾生與救現在之眾生救現在之眾生。與救將來之眾生，其法異而不異；救此土之眾生與救彼土之眾生，其法異而不異；救全世界之眾生與救一國之眾生、救一人之眾生，其法異而不異：此相宗之唯識也。因眾生根器各個不同，故說法不同，而實法無不同也。既無淨土矣，既無我矣，則無所希戀，無所罣礙，無所恐怖，夫淨土與我且不愛矣，複何有利害毀譽稱譏苦樂之可以動其心乎？故孔子言不憂不惑不懼，佛言大無畏，蓋即仁即智即勇焉。通乎此者，則遊行自在，可以出生，可以入死，可以仁，可以救眾生。