法薩羅一戰龐培雖然被擊敗，但龐培的船艦未曾受到損害，仍然活躍在海上。
愷撒一麵命令部下清理戰場，一麵收編龐培的殘部。愷撒對這些人也沒有絲毫的歧視，仍然授予他們原有的官階和待遇，使他們感恩戴德，短短的幾天內，前來歸順的人多達兩三萬人。從這件事看來，愷撒並不是一個有勇無謀的人，他的成功絕非偶然。
愷撒事先已經打聽到龐培逃往埃及的消息，十月初，他乘船追到了埃及。他本以為可以在埃及和這位政敵相遇，卻沒有想到，當他抵達亞曆山大港時，龐培已經遭到埃及人的毒手了。
當伯狄諾斯向他呈獻龐培的首級時，他轉過頭去，不忍心看。雖然龐培是他的敵人，但是一位蓋世英雄竟然落得如此下場，愷撒心裏的滋味很不好受。
愷撒立即命人將龐培的首級厚葬，至於流亡埃及的龐培的親友、眷屬全部釋放。
當時的埃及是由托勒密十三世和他的姐姐克裏奧佩特拉（公元前69年—前30年）共同執政。不過，他們姐弟之間常起爭執，那些奸佞之輩便乘機進讒弄權。由於托勒密年僅17歲，少不更事，當然容易聽信讒言。姐姐克裏奧佩特拉比他大一歲，生得非常美麗，而且頗具才幹，遇事果斷，能辨忠奸，使得那些權臣們惴惴不安，於是千方百計地想將她去之而後快。最後，她終於被廢，被逐出宮外去了。
克裏奧佩特拉不但美麗動人、風度嫻雅，而且深諳曆史、文學和哲學，她會說希臘語、埃及語、敘利亞等多種語言，據說也曾經寫過幾篇著作，一篇是討論埃及的度量製度和錢幣等有關問題，另一篇是談論化妝術。
她確實是一位頗具才幹的統治者，而且也深深了解埃及是無法脫離羅馬而獨立的，因此，有心拉攏這位炙手可熱的羅馬將軍愷撒。不料，她的理想還未能實現，反被逐出宮門。
愷撒對這位傾國傾城的埃及女王仰慕已久，當他覲見埃及國王托勒密十三世時，她已被逐出宮外。因為沒有見到心儀已久的埃及女王，愷撒感到非常失望。當他聽說女王是被權臣所陷而被廢時，不免生起一股同情心，並由同情而產生憤慨。愷撒擔任羅馬執政官時，曾批準一筆貸款，借給埃及政府，他準備乘此機會，向埃及索回舊債。
托勒密左右的權臣們當然了解愷撒的真正意圖，因此，力勸國王拖延搪塞，以致雙方弄得很不愉快。他們甚至故意散播流言、製造仇恨，極盡毀謗、挑撥之能事，想迫使愷撒自動離開。
愷撒帶在身邊的士兵並不很多，他除了派人回去通知將領們作好準備，以便隨時進軍亞曆山大港外，自己也小心翼翼，時時提防。
當時埃及有一個意大利籍商人，因為久居埃及，他的生活習慣、衣著乃至語言，幾乎和埃及人沒有差別。他交遊極廣，上自王公大臣，下至販夫走卒，他都能一視同仁，由於他生性慷慨，人人都願意和他交往。
有一天，他來拜訪愷撒，訴說鄉情以後，他悄悄地向愷撒獻計說，他有辦法可以使愷撒跟克裏奧佩特拉女王見麵。愷撒一聽，欣喜莫名，立即吩咐他去安排一切。
這位神通廣大的意大利籍商人當然知道女王被幽禁在什麼地方，他也經常帶些稀奇的東西賣給女王。這一次，他背了一個大袋子到女王那兒去，先和守衛的士兵們稱兄道弟地客套一番，然後就進到裏邊去。
女王見到他以後，問他說：“今天帶了些什麼東西來？快拿給我看看。”
他神秘地一笑，眼看四下無人，就湊上前去，悄悄地告訴她說：“恭喜女王，您的機會來了。羅馬的大將愷撒，現在來到埃及，住在亞曆山大港，他同情您的處境，有意要助您複位，我可以帶您去見他。”
“去見他？這裏門禁森嚴，你可有辦法帶我離開此地？”
“這個您放心，您看我今天帶來的是什麼東西？”
“一個大袋子。”
“不錯，就請您暫時委屈一下，躲到毛毯裏我再把你放到袋子裏，背您出去。門口的衛兵跟我熟得很，決不會盤查的，隻要一出這個大門，就萬事大吉了。”
別看這位商人身材魁梧，但是他心思縝密，考慮得很周全，女王立刻同意了他的建議。她把侍女們支開，然後蜷縮在毛毯裏，讓商人把自己塞進那個大布袋中，在袋口露出一個小小的洞，以免窒息。這種想法確實很周到。
當他走近門口的衛兵時，故意笑著說：“我大老遠帶了這麼多東西來，誰知道女王閣下一樣也沒看上，唉，我隻能再背回去了。”
衛兵們譏笑他說：“你摸不清楚女王的喜好，空跑一趟，怨得了誰？”
“是啊！徒勞往返，我今天真是倒黴透了！弟兄們，再見了。”說著，商人就背著袋子揚長而去。
看到這位商人背著一個大布袋走了進來，愷撒覺得很奇怪。商人放下口袋，喘著粗氣，同時把目光移向布袋。愷撒順著他的目光看去，但見布袋微微地蠕動，聰明的愷撒已經明白是怎麼一回事了。