第二十五師駐迪化，師長劉振世、政治委員賀振新、第一副師長楊廷英、第二副師長陳海州、參謀長李雪穀、政治部主任劉一村。
第二十六師駐綏來，師長羅汝正、政治委員王季龍、第一副師長高戎光、第二副師長周茂、參謀長熊略、政治部主任魚正東。
第二十七師駐焉耆，師長陳俊、政治委員龍炳初、第一副師長文升喬、第二副師長韓際隆、參謀長李存中、政治部主任傅誌華。
騎兵第七師駐奇台，師長韓有文、政治委員於春山、第一副師長韓榮福、第二副師長郭全梁、第三副師長馬全吉、參謀長李綱、政治部主任楊貫之。
騎兵第八師駐莎車，師長馬平林、政治委員張獻奎、第一副師長李朝弼、第二副師長劉掄元、參謀長祝源開、政治部主任楊烈光。
到此，解放軍對國民黨的起義部隊已經整編完畢，使解放軍真正意義上完全統一了新疆，而解放軍寬厚的政策，也是國民黨接受整編的一個重要原因。對起義部隊的整編和改造最直接的一個影響就是鞏固了和平起義的成果。
部隊整編後駐守新疆各地，擔負了維護地方穩定的任務，通過改造確立了黨對起義部隊的領導權，轉變了舊軍隊官兵的落後思想，使得二十二兵團的廣大官兵成為真正的人民解放軍，這無疑鞏固了和平起義的成果。
12月17日彭德懷主持召開新疆省人民政府第一次全體委員會議，宣布人民政府正式成立。同日，新疆軍區宣告正式成立。
中央人民政府革命軍事委員會任命彭德懷為新疆軍區司令員兼政委，王震為第一副司令員，陶峙嶽為第二副司令員，賽福鼎·艾則孜為第三副司令員。張希欽為參謀長，曾震五為第一副參謀長，沙哈諾夫為第二副參謀長。
同日，迪化舉行人民解放軍、“三區”民族軍、新疆和平起義部隊聯合入城式。人民解放軍由東門入城，“三區”民族軍由西門入城，起義部隊由北門入城。
一野司令員兼政治委員彭德懷及王震、張治中、包爾漢、陶峙嶽、賽福鼎、徐立清等檢閱了部隊。
12月28日，彭德懷離迪化赴北京參加中央人民政府第五次會議並向黨中央、毛主席彙報新疆情況。
彭德懷在報告中說，新疆軍事政治大勢已開始穩定。但對民族和宗教問題，今後尚應特別注意。新疆目前最嚴重的問題，是財政經濟問題。彭德懷還報告了新疆軍隊生產情況和擬采取的措施，請示中央研究新疆與蘇聯恢複通商等問題，以開發新疆礦藏，繁榮新疆經濟。