明懷宗殉國之次年（乙酉）五月初九日，南都破，宏光出走，禮部尚書錢謙益率群臣降。有周筌者，吳郡人，謙益客也；密受謙益旨，謁大清統軍大帥豫王，具言吳下民風柔軟，飛檄可定，無煩用兵。王大悅，即日拜官；使王家鼒等佐之，安撫吳中。甫出都門，郡邑長吏望風解印綬去；所過輒降。至吳郡，家鼒據察院，傲岸自若；筌獨微服出沒市廛，郡人多為耳目。未幾，明監軍楊文驄率兵突入，捽家鼒等數人戮於市；發取府庫，莫知所之。筌間行歸豫王，王怒，發兵入吳。吳中禍本，實基於此雲。
嘉定五月十三日始聞維揚陷，留都不守。十五日，邑諸生群集縣治，索廩糧並鄉試條編銀，乘勢劫奪，城中鼎沸。邑令錢默盡發公帑置堂，諸生始散；遂密疏諸生數十姓名，重賄吳淞總鎮吳誌葵，求悉抵於法。是月三十日，錢乘間出亡。
六月初一日，誌葵遣兵執諸生十一人去；褫衣就縛，徒跣行烈日中，窘辱備至，乃釋之。
初四日，大清刑部侍郎李延齡、總兵官署督撫事土國寶等率兵入郡。
十四日，安撫筌單騎至邑，搢紳皆出避；百姓結彩於路，出城迎之。旋緘邑篆並縣誌上於郡。
二十四日，大清新授嘉定縣令吳郡張維熙至。是日亭午，誌葵以百人用白布裹頭，伏時光祿墓道旁；晡時，亂入民家索酒食，聲言欲取張令。人定後，各刈蒲葦一束，燃其端，持之以行，其光燭天。城中大震，乃厚集民夫鳴鑼發炮，東向大噪；誌葵兵亦群噪應之。維熙恐，倉卒夜遁，士民狼狽出奔。
二十七日，誌葵發兵來，城內外百姓疑為恢複之師，懸彩執香，較迎周筌時十倍。誌葵用明應天府逃將薄若來為前導若來即嘉定人，市井無賴，以膂力遭逢權貴，官至後軍都督；聞維揚陷，棄職而逃。至是，從誌葵入城，遽趨庫，僅存銅錢數十千，舁之行。過徐家行，大掠，寸縷無遺，貧民哭聲震天；誌葵、若來因重加載海。是時，明淮撫田仰、監軍荊本澈與奄人李國輔等合兵共立義陽王，以舟師駐崇明沙；誌葵率妻子從之，旋舍去。
維熙至吳郡請兵，於閏六月初六日複入縣。
初八日，侍郎李延齡遣裨將李成棟以百餘艘載步騎二千鎮守吳淞，恣百姓聚觀。曰：今與汝為一家人，勿畏我也。觀者見成棟缺一齒，貌複不揚，甚易之，哄笑而散；成棟愕然。黎明，從陸路赴吳淞，至新涇鎮暫駐，恣其淫掠，婦女斃者七人。時大旱水涸，兵船悉泊東關外，部將梁得勝以三百人守之。城外居民與貿易如平時，改稱都督、亦稱相公，嬉嬉然相與嘲笑如舊識。維熙議使人戽水運東關船，得勝大喜，行有日矣。
十四日，誌葵忽遣騎卒俞飛熊齎牌至，雲：初十日郡中民變，殺北兵過半；餘俱避入府庠，已列柵圍之。本鎮即統大軍入縣，仰附近百姓於今晚用白布裹頭，雜插竹枝、柏葉、鵝毛、紅箸為號，出剿東關兵；事成重賞。各路鄉民久為邑諸生支益、國子生須明征等訛言煽動；一聞有牌，持兵蝟集，謬傳誌葵自瀏河來、過外岡矣。俄頃又雲：抵青岡墩矣。未及一瞬，又雲暫憩察院矣。即在城居民，亦謂誌葵已入城。城門遂徹夜不閉，鄉兵集者漸眾；王家兵最稱完整，其首許美戰頗力。時漏下數刻，諸鄉兵謂誌葵已至，膽氣益壯，競舉火擲得勝船。得勝據高岡射鄉兵，皆應弦而倒，許美亦中流矢死，鄉兵大潰；始知誌葵固未嚐至也。天明，數得勝兵首級，共八十四顆。得勝餘眾東奔，狼狽得達。
初，成棟至吳淞，策馬周視四境；駭曰：此絕地也，張令誤我矣！及得勝敗，大驚；選兵四十騎，募吳淞居民朱宏宇、朱香為鄉導，往婁東求救。十六日，至羅店被圍，奮死突出，馳而西；過三官堂，殺一僧。有四騎失隊，鄉兵從背後掣其佩刀；一騎刀落，即取刀連斫之，人馬俱斃。二騎為鄉兵追及，攢槊刺之。惟一騎苦戰，得脫。前隊至時家墳，遇鄉兵，複馳而東；鄉兵追之。近羅店，鄉兵複出，兩路夾攻。香等導成棟兵自間道過蔡家鎮，繞出鎮後。過月浦，複為鄉兵截殺，零落而走；望見吳淞城，猶大呼救我！救我！人馬氣急僅屬。然嘉定城中傳聞不一，憂怖彌甚，望誌葵眼穿。方悟見欺，號哭棄家而走，競呼皇天，吳鎮殺我！是夕月蝕，倏忽食既；時天無纖雲，色暗如漆。占曰：食盡無光，主奸人誤國、百姓死、城邑空；其兆成矣。
十七日，明都察院觀政進士黃淳耀及弟邑諸生淵耀入城，與通政使左通政侯峒曾二子邑諸生元演、元潔倡為城守計。初，淳耀在石崗，丹陽孝廉葛麟挾二力士叩淳耀門。父家柱出迎，見麟貌甚雄武，殊不類文人；且大聲問曰：年翁安在？答以在鄉。攢眉良久曰：我憂之甚！年翁純儒，未識世故，恐不免；思一相見，故紆道來，今不及矣！家柱固止之，為停留飲食。遂與淳耀兄弟訪誌葵於雲間，共論當世事。出，謂淳耀曰：誌葵，庸奴耳。其言誇誕不實，欲誘他人幹事，彼徼幸坐享成功；必誤國事。年翁何故信之？天下事，尚可為。然君，儒也，非其倫；幸勿鹵莽！遂掉臂去，莫知所之。
十八日，成棟悉銳攻羅店。屯兵馬橋，與兵隔水而陣；佯言奉檄：吳淞與羅店無仇，今假道歸，並無侵擾。鄉兵罵曰：汝曹檻羊牢豕，勿作癡想！成棟率兵混戰，陰遣將統卒東渡練祁塘、西渡荻涇，繞出陣後。鄉兵大潰，退屯來龍橋；接戰良久，大敗。時日未出，居人方為市，聞變，亟升屋；成棟步兵亦升，東西馳逐。騎兵乘勢殺人，大呼唐秀才何在？縛出者賞。唐秀才名景耀，字韜生，初與吳淞居民朱宏宇為鄰，甚相昵；及宏宇降成棟，景耀麵數其罪，且曰：歸告李成棟，速棄吳淞去，可免大戮！複大書一白牌，立馬橋南，諭成棟降；語甚峻。至是被縛，磔於市。諸生唐培率鄉兵巷戰被獲，奮躍大罵，被劫未絕，尚呼豈有此理！鎮已破，諸生朱霞尚張小蓋，登屋鳴金，冀集眾複戰。頃之，身被數大創，墮河；呼號竟日，乃死。成棟廉知鎮民朱鯨？為鄉兵首，支家橋一帶房屋焚毀略盡，男婦被殺者一千六百四人。是日，城中百姓殺須明征，毀其室明征，國子生，故尚竇少卿須之彥從子也。南都破，忽冠帶乘軒謁成棟，稱署嘉定營事守備；仍通誌葵，複稱監紀推官。勢劫維熙，取官銀數千兩；招家丁六十名，悉衣錦綺、懸佩刀，招搖街市。每揚言往各鎮請鄉兵，分守要害。時守頗嚴，有夜半叩關者稱明征請大兵入；特啟關納之。問兵安在？漫應曰：城主慳不肯發糧，散去矣。眾共詰問，語極支離；大疑之。十八日，競傅明征家私造都督府牌印並冠帶、盔甲數十副，謀盡殺滿城士民，迎成棟。有頃，西關外擒獲奸細，供為須黨；一時大嘩，真偽莫辨。明征倉卒出亡，追至南關受縛，大呼稱冤；眾益嘩，驅明征至察院街，斬首刳腸，斷四肢分置各門。捕家丁，悉誅之；家室俱糜碎。
十九日，淳耀等相與謀曰：今勢成騎虎，無主又亂。令元演作書趣其父峒曾入城。既至，集眾公議，畫地而守：東門，峒曾為主，邑諸生龔孫玹佐之；西門，淳耀主之；南門，孝廉張錫眉為主，前秀水縣儒學教諭龔用圓佐之；北門，國子上舍朱長祚為主，前雲南按察使僉事唐谘禹佐之；元演、元潔、淵耀為總巡。處分已定，各率眾上城巡邏，嘉人士爭縛褲執刀以從。東、北二門，俱用大石斷街路；惟西門、南門按時啟閉，仍用屋木、亂石橫塞道塗，以遏兵鋒。
二十二日，立挨門出丁法，分上中下三等：上戶出丁若幹，又出銀若幹備各兵糧餉並守城燈燭之費；中戶出丁若幹，下戶各出一丁，分堞而守。城上分四隅，自某地起某地止，分屬各圖，每圖擇一人為長。日入後，當事者親自巡曆，以稽勤惰；大事，專屬峒曾、淳耀處分。是日，二都鄉兵縛奸細至；鞫之，實誌葵送書人，有「吳門之敵斬馘殆盡，杭州之敵貝勒雲亡」之語。因深信之，而不虞其相誑也。
二十四日，誌葵牌至，許遣遊擊蔡喬督兵協剿。當事者議：新令張維熙為大兵所署，難與共守。驅之出城，推原任儒學訓導萬逵攝縣事、巡司俞尚德充捕官。是日，複有健兒四人齎誌葵牌至，與原牌互異；嚴刑鞫之，供為婁東浦橋偽造，冀弛城守、襲取嘉定。得實，文梟四人於市。時聲勢岌岌，人莫不恃侯、黃諸縉紳協力固守；士民攜老而歸，不絕於路。城上揭白旗，大書「嘉定縣恢剿義師」。奈兵餉兩絀，所仗惟城外鄉民；乃設計四布流言：大兵驅百姓薙發訖，即將以白刃逼令自殺其妻孥，籍為兵。鄉民大怖，弱者終日鍵戶，與妻子對泣，強者斬木揭竿，擊金鼓集眾，謀禦大兵。百姓騷然，不遑安處矣。於是，念燒船一事雖誌葵首禍，非支益等煽動其間，不致敗決如此。且益新在閣部史標下，領衣襖銀五千兩；南都破，悉飽私橐，盍取為義兵餉！因爭往攻之，益父子、祖孫共五人悉斷頭，與明征頭並懸城上。頃之，南翔鎮獲明征妻子，殺之。南翔有著姓李氏，自世廟已來，蟬聯不絕。貢土李陟，年少有雋才，知名當世；南都破，就嘉定勸農公署起鵠社，號匡定軍。議於南翔諸富賈均派出餉；眾皆銜之。誅明征之夕，陟方會飲南城；聞變，遽擲杯出走。裏兒怪之，言李氏潛通成棟。有洪濱者，暴起諸生間，為所惡指為奸黨，將縛之。濱恐，逃匿李氏宅；眾遂破李氏門，赤其族。各路聞風，競相盤詰；路人單行，稍涉疑似，即縛去亂槍戮死，棄屍河中。窮鄉僻壤，自相仇殺。是時，橋道扼要處皆設廠，晨夜共守；雖五家之聚，亦揭旗聚眾。鄉兵益多，然無餉；一再至城下，絕跡不來。當事者懼，張榜四門：鄉兵赴義者，集護國、留光、皇慶、集慶四寺中；為首一人，入城領餉。來者漸眾。