接著，雲定興又沒花多大工夫，就把欲逃跑的宇文儒童叔侄以及崔德本等謀逆者逮捕了。然後，他押著昔日的同僚們趕往宮中。大獲全勝，論理雲定興應該高興才對，因為他可以借平定叛亂之功向自己主子邀功請賞，加官進爵。然而，不知怎的，一路上他居然心情沉重，一點喜色也沒有。
沒過多久，裴仁基、宇文儒童等人就被押送到王世充跟前。王世充看到這群謀害自己的家夥，不由勃然作色，目露凶光。他高高坐於龍案之前，瞪著那雙凶神惡煞的眼睛，逐一掃視著麵前的逆臣，眼神中透著令人不寒而栗的殺氣。好大一會兒後，他才把眼睛釘在裴仁基臉上，恨恨地質問道：
“裴仁基，朕待你一向不薄，何故要反呀？你好好一個禮部尚書不做，為何要做反賊，哼？”
“裴仁基非反賊，反賊是你王世充！”裴仁基麵無懼色地高聲反駁道，“你廢除隋皇，自稱鄭帝，乃竊國之逆賊，人人可誅殺你！”
“大膽，竟敢罵朕！”王世充重重拍了下龍案，厲聲喝斥道，“謀殺皇上，該當何罪！朕欲念你功績，免你一死，然你口吐狂言，罪不容誅！”
“我等起事，實為剪除你這亂臣賊子，複立隋皇，匡扶隋室。此乃忠臣之所為，何謂逆賊？”裴仁基正義凜然地回擊道，“我等皆無罪，真正罪大惡極的人是你這個纂權奪位竊取神器的逆賊！你才罪該萬死，天下人人欲得而誅之，欲剝你的皮食你的肉！”
“你，你……”王世充氣急敗壞指著一旁的刀斧手，聲嘶力竭地吼道，“快，快給我拖出去斬了！”
刀斧手得令，一個箭步衝上前，將裴仁基死死拽住。裴仁基不反抗，也不掙紮，隻滿懷遺憾地對王世充說句：
“人生固有一死，何足懼哉！隻是未能手刃你這逆賊，拯救社稷，而深感痛心！”
說著，他一扭頭，跨出了金碧輝煌的大殿。
隨即，宇文儒童、宇文溫、崔德本等人也被押往轅門。不到半個時辰，他們就同陳謙、裴行儼一道被刀斧手處斬了，首級懸於轅門之上示眾。
王世充平息了這場叛逆，心情非常舒暢，他重賞了段達、雲定興等平叛有功的大臣，又借此犒勞三軍，穩定政局。盡管宇文儒童、裴仁基等異己勢力已被鏟除，朝中再無敢公然反對和敵視自己的人了，但王世充內心還是憂慮不安，擔心群臣中還會有人出來謀反。因此，他一麵加強自己對朝政的掌控能力，一麵暗中派遣心腹監視底下的動靜，隻要發現有一點異常舉動，就可先斬後奏，格殺勿論。