劉仁軌的大軍在推進到發羅郡的時候，終於遇到了像樣的抵抗。發羅郡中有約五千左右的駐軍，而且整個百濟南部的百姓以及富商，大多都逃進了這裏以及東北部的武珍郡。在城內的軍民看來，他們沒有退路可言，左右也逃不過一個死，還不如轟轟烈烈的戰死在這裏。所以，當劉仁軌的兩萬多大軍開到這裏的時候，遭受到了守城官民的殊死抵抗。即便是在遭遇大唐猛烈地炮火襲擊之後，城內的軍民仍舊堅守在城牆之上。
連日來都沒有遭遇到百濟方麵的像樣抵抗，劉仁軌和他麾下的部隊都難免有些鬆懈，以為這裏也會像之前遇到的城池那樣，隻要經過一番炮擊，城內的百姓便會四散而逃。於是，在進行完例行的炮擊之後，便率領著隊伍向城池靠近。結果在進入到守城器械的射程之後，突然間遭受到了百濟方麵強有力的反擊。猝不及防之下，大唐的士卒在頃刻之間便損失了近千人。這還是劉仁軌自新羅登陸以來，頭一次遭受到如此重大的傷亡。
當大唐軍隊倉皇的逃出百濟方麵的攻擊範圍之後，這才重新整理好隊伍。惱羞成怒的劉仁軌在盛怒之下，下達了全部炮火對發羅郡進行無差別的炮擊。一百餘門神威大炮，足足對著發羅郡城內進行了半個多時辰的炮擊，直到整座城池都陷入到衝天的火海之中，劉仁軌這才下令停止炮擊。再看發羅郡的城牆，此刻早已經千瘡百孔，破爛不堪，根本就無法再站人。
這一次，大唐的軍隊又變得有些過分的小心，並沒有著急攻城（城中到處都在起火，也無法進入其中），而是把城池的四門給包圍了起來。他們現在的舉動似乎是有些小心的過分了，發羅郡的城牆周長也不過十餘裏的模樣，剛才的無差別炮擊，早已經將四麵的城門樓炸毀，這無異於斷送了城中百姓外逃的可能。
城內的大火整整的持續了一天也要還有餘，一直到了第二天夜間城內的大火這才漸漸的平息。
到了第三天中午，劉仁軌指揮大唐軍隊清理出一座被堵的城門，進入其中的時候才發現，城池之內到處可見被燒焦的屍體，城內的慘狀令那些久經沙場的大唐士卒都不忍目睹。
劉仁軌也沒有想到，自己情急之下的舉動，會造成如此嚴重的後果，一時之間也不知道該如何處理。這時一名上了年歲的將領提醒他，趕緊尋找城內的幸存者。隻要能夠發現一定數量的幸存者，便不算是徹底的屠城。到時候不但對上麵有個交代，就算是對百濟方麵，也可以說是由於守城方殊死抵抗，迫不得已才大開殺戒的。而且這些人都是死於攻城之時，大軍入城後並未屠殺城內的居民。
盡管知道這麼做實在是有些自欺欺人的意味，但是為了讓自己的內心能夠好受一些，劉仁軌還是接受了這名老將軍的提議，迅速傳下令去，全力施救城中的百姓，除非遇到圖謀不軌者，否則嚴禁屠殺城中幸存的百姓。