羅本神父、布汶神父、韓鵬等人都讓楊夢龍吼得莫名其妙，不知道他又在發什麼瘋，但是楊夢龍卻知道，這回明朝的麻煩大了。
在明亡清興五十年中，崇禎四年是一個重要的轉折點，在這一年，發生了兩起影響極為深遠的事件，徹底斷送了明朝戰略反擊的能力。其中之一，當然是慘烈之極的大淩河戰役，明朝和後金舉國精兵圍繞著這座小城鏖戰數月之久，直殺得血流成河，最終，長山一戰定乾坤，增援大淩河的明軍死傷近六萬，再也無力支援了，祖大壽在吃光了城中的民夫、班軍之後，率軍開城投降，前前後後明朝共計損失精兵強將超過十萬，元氣大傷，從此再也無力作出反擊，京畿、宣大等重地成了後金的獵場，他們愛來就來，愛走就走，明軍隻有被動挨打的份。另一起極其重要的事件則是登萊叛亂，這起叛亂的影響，甚至遠遠超過了大淩河戰役！
崇禎四年十月，前東江軍悍將孔有德、李九成奉命率三千遼兵前往遼西，增援大淩河城。遼兵跟建奴激戰多年，深知建奴的厲害，再加上沿途官員蔑視遼兵，不肯提供給養，使得遼兵一路上饑腸轆轆，苦不堪言。磨磨蹭蹭的行至吳橋，遇到大雨雪，無法再前行，加上給養耗盡，饑寒交迫，遼兵怨氣衝天。一名遼兵挨不住餓，從一戶王姓大戶人家處偷了一隻雞，王家家奴找上門來，逼迫孔有德將那名士兵插箭遊營，還要遼兵將領向他們下跪認錯，遼兵終於爆發了，斬殺了那些不知死活的家奴，舉兵叛亂，一路攻城掠地，殺掠無算。而天真的孫元化直到此時也沒有放棄招撫的念頭，在官兵圍剿叛軍稍稍得勝的時候又阻止官兵繼續攻擊，力主招降，這種愚蠢到極點的做法給他帶來了殺身之禍，崇禎五年元月，孔有德攻陷登州，將包括孫元化在內的一眾登萊高官俘獲。好在孔有德還算念舊情，沒有為難孫元化，把他給送到了天津。但是崇禎並不念舊情，狂怒之下一腳將這個書呆子踹進了詔獄，不久，便押到菜市口開刀問斬了。
孫元化為他的天真付出了可怕的代價，但是這並不能阻止明朝犯二。攻陷登州之後，山東遼兵群起響應，甚至在皮島的東江軍也紛紛渡海而來，加入了叛軍的行列，叛軍的隊伍滾雪球般壯大，一發不可收入，於崇禎五年二月包圍了萊州。而此時，明朝中樞居然和孫元化一樣，力主招撫————孫元化死得真冤，大家都力主招撫，大家都把局勢敗壞得不可收拾，憑啥我人頭落地，而你們屁事都沒有？在周延儒等大佬運籌帷幄之下，上萬明軍明明離萊州僅四十裏，卻被他們死死的按住，不得往前一步，這就形成了非常搞笑的局麵：叛軍團團包圍萊州城，晝夜攻城，而明軍則駐紮在萊州戰場外圍，不動如山，不像是要剿殺叛軍，倒像是在保護叛軍的側翼，萊州軍民幾乎吐血！直到明朝中樞對叛軍的反複無常失去了耐心，調集數萬大軍發起猛攻，才算是解了萊州之圍，又經過長達數月的苦戰，最終收複登州，但是孔有德卻在城破前率一萬二千餘人分乘百餘艘戰船出海，逃到了遼東，最終投降了後金，他們帶去的那些精良的火槍火炮乃至工匠，也盡為後金所得。這場叛亂持續了兩年之久，不僅將遼東戰場的大後方登萊打了個稀巴爛，百姓被屠戮無算，更給後金送去了大批他們最為緊缺的兵員和工匠。皇太極笑納了這份大禮，一點都沒有浪費，孔有德所部被編入漢軍旗，那些工匠也受到重用，專門負責為後金製造槍炮，明軍失去了最後一點優勢。待到滿清入關時，清軍的火槍火炮不管是質量還是數量，都對明軍形成了壓倒性優勢，幾乎不費吹灰之力便擊敗了李自成所率領的農民軍，掃掉了苟延殘喘的南明小政權，最終統一了中國。