第一部分 魔族入侵神州大地
被邪神元靈選為載體的程馳，從盤古大陸，穿越到了神州大地。
恰巧介入了人族和魔族，十年一次的比試。無意中救下了神州武者伊世狂，並且更加無意中殺死了魔族武者加耶羅。
程馳還沒接受自己進入神州的事實，就和伊世狂，被因為加耶羅血液吸引過來的金頂蜈蚣吞食。在金頂蜈蚣體內，程馳無意中用戰魂刃，擊中了金頂蜈蚣的元丹，而將它的修為和能力全部吸收，化為己用。並因此而得救。得救後，伊世狂開始對程馳的身份感到懷疑，經過簡單的試探，決定將程馳留在身邊觀察。程馳也從伊世狂那裏，了解到了，神州大地以及人族與魔族的一些事情。
伊世狂帶著程馳決定離開枯骨大漠，怎料遭遇了獨角龍蜥的襲擊，無奈，伊世狂隻能打破，被程馳發現的那個石壁上的小洞，和程馳逃了進去。進入深洞的二人，因詭異的簫聲昏迷，醒來後，找到了一處密室——神魔絕域。而密室上的文字，竟是漢字。
程馳、伊世狂進入密室，陷入幻術之中。伊世狂及時驚醒，卻被簫聲再次震暈。程馳則沉浸在幻術中，被躲藏在那裏的天醫族叛逆，莫行善侵入意識海。侵入程馳意識海的莫行善，得知了程馳意識元靈中，邪神的存在。在邪神的威逼利誘下，莫行善決定幫助程馳提升實力。在幫助程馳鍛造命脈的時候，莫行善被程馳的資質所吸引，決定收他為徒，繼承自己的天醫傳承。
學習了莫行善所傳的“造化三針”後，程馳為伊世狂療傷，並助其突破為先天武者。伊世狂因要鞏固修為，暫時不能離開神魔絕域。委托程馳去諍世宮報信。作為報酬，將“淩空虛渡”和“佛像乾坤”傳授給程馳。程馳離開神魔絕域，遇到了一隻偷吃烤肉的小獸，為他取名為辛巴。再與小獸爭鬥時，發現了重傷的劍飛燕。
劍飛燕看出了程馳所使用的“佛像乾坤”劍招，表明了自己的身份。程馳決定和劍飛燕一起前往諍世宮。還沒等離開大漠，就遇到了前來大漠，營救加耶羅的加耀海。程馳利用枯骨大漠的特殊空間，激怒加耀海，成功將他引致獨角龍蜥的居住地。利用獨角龍蜥成功逃脫，但是辛巴為了救他，而陷入昏迷。
程馳帶著劍飛燕來到涼關城，煉製避息丹，消除二人氣息。在即將離開時，行蹤被淩江王家的人發現，遭遇王家王滄海截殺。麵對強大的王滄海，程馳斷後，讓劍飛燕去逐鹿都罰刑殿求援。程馳用計，打敗王滄海。卻被他一同拖入了深淵。在崖壁上，程馳發現了一處奇特的山洞，本想進入山洞，為王滄海療傷，誰知，山洞中有一頭飛翃，帶走王滄海。
程馳因避息丹緣故，躲過一劫。原本準備離開的程馳，卻被天庸城三人堵回，並得知，山洞中有一座古跡和道骨。為得到道骨，程馳在莫行善的指導下，利用飛翃與他們的爭鬥，從兩名先天武者手中奪食。就在快要成功逃脫時，異變突生，程馳被吸附在了一扇石門上。從而進入了百花境。
在百花境中，程馳答應了百花天君的要求，幫他找到武器“風流”，並解封它。為了保證程馳乖乖聽話，百花天君給他下了風流印，限期三個月。在百花天君留下的神識的幫助下，程馳與莫行善成功逃脫。
他們乘坐水雕，來到逐鹿都。程馳在為王滄海療傷時，發現他原來是女子。王滄海醒後，徑自離開。程馳前往罰刑殿，找尋劍飛燕。不料，因程馳修為進階，導致避息丹失效。在罰刑殿，遭遇加耀海襲擊。
程馳被加耀海控製的獨角龍蜥吞掉，救出劍狼（劍狼重生，更名劍無痕）和神農司的百穀長老，劍狼因此獲悉自己是戰魂刃劍靈的事情，認程馳為主，開啟戰魂逆境。最終，罰刑殿被毀，眾人倉皇逃竄。罰刑殿主南宮無忌，前往掌天殿求援，劍飛燕則和程馳前往諍世宮報信。（辛巴醒來，因吸收了獨角龍蜥的元靈力量。）
前往九霄山的路上，遭遇伊紹齊的阻擊，在魔族財心魔者的幫助下，擒獲劍飛燕。要挾程馳刺殺趙雲姬。程馳與趙雲姬定計，引出伊紹齊，粉碎了他竄奪諍世宮宮主的陰謀。伊世狂的老爹伊浩然引咎自殺。
離開諍世宮後，程馳決定前往血魂沼澤（路上，移植道骨。需要幾大條件。），幫百花天君找到武器。並且提升自己的實力。當自己趕到血魂沼澤時，早就聚集了大批的人馬，說是發現了一處秘境。程馳猜想，應該是百花天君放置武器的地方。為了方便進入秘境尋寶。程馳加入了當地的一個一流門派——神農司（掌門霸丹青，女兒東方雪茹，神農司男隨父姓，女隨母姓。）。
成功獲得宗主器重，並獲得了進入秘境的資格。各方人馬進入迷境，程馳結識一位好友，魏辛嘯，並發現，魔族人也跟隨進入，後程馳通過財心魔者荷思君，得知魔族此次行動，是受詔魔族巫祝（魔族巫祝，曾經為那個勢力占卜過，知道百花天君與幽羅殿的恩怨。）的語言，前往這裏尋找一件古書。