當天上午木葉高層離開實驗室之後，繩樹便親自指揮調查，支持他的高層也紛紛留下來幫忙，暗部的本部成員全軍出動，在木葉展開了搜索。
根部作為重點調查對相，整個基地都被暗部查了個遍，可是卻沒有發現任何有用的線索！
第二天，繩樹便下令擴大搜索範圍，暗部開始頻繁地出現在木葉的各個角落，不可避免地被木葉村民發覺了異樣。不過由於木葉高層嚴密封鎖了關於刺殺的一切信息，所以暫時沒人往火影的方向想，隻以為暗部是在搜索間諜，倒是沒有引起什麼騷亂。
在搜查過程中有不少敵國間諜在驚慌失措之下露出了馬腳，進而落網，對暗部來說也算是意外的收獲。
可惜經過第二天的全麵搜查之後，暗部仍然沒有發現任何關於刺殺案件的線索！
第三天，也就是約定期限的最後一天，苦搜無果之下，繩樹不得不改變方向，將調查重點鎖定在內部高層身上，開始逐個傳喚木葉各派係的高層，並對所有人進行問話，希望可以找到嫌疑人！
木葉的高層雖然對繩樹的這種強硬行為非常不滿，但是為了避免自己被按上嫌疑，隻能捏著鼻子配合。
這時一直在暗中觀注著繩樹的團藏終於徹底鬆了口氣，在他看來繩樹這是在病急亂投醫，不僅查不出任何線索反而會得罪人，約定期限一到，他所麵對的局麵會更惡劣。
眼看勝利就在眼前，團藏沒有做出任何節外生枝的動作，而是選擇待在根部老巢之中默默地等待最後時刻的降臨。
他知道今夜自己是肯定睡不著了，所以獨自一人坐在陰暗的辦公室內享受著勝利降臨的喜悅。
快了！很快他就可以徹底擺脫地下的黑暗，就像從根部上長出的嫩芽一樣破土而出放肆地享受地麵上的陽光。
可是當夜淩晨十二點，一個不速之客的到來破壞了團藏定份來之不易的安逸心情！
“咚咚咚……”
房門外突然發出的脆響打斷了團藏暢想，在他的心湖中掀起了一圈圈漣漪。
他皺了皺眉頭，強壓下心中被打擾的不快，冷聲說道：“進來！”
“嘎吱！”房門被推開之後，一個沒有帶麵具的根部快速走進辦公室，並單膝跪地低聲說道：“大人，基地外有人求見！”
“這麼晚了，是誰要見我?難道是繩樹那小子不甘心，還要帶著暗部最後搜查一次?”團藏一臉得意地問道。
可惜麵前的根部無法理解他的情緒，一臉麵無表情地用機械的語氣說道：“是大蛇丸一人求見。”
團藏聽到這個回答之後，臉色一變，有些疑惑地說道：“這個家夥居然在這個時候來找我?
不見！讓他快走！”
“是！”根部低頭領命，起身欲走。
團藏看到他這副機器一般的反應，突然又開口阻止道：“等等！他有沒有說自己找我有何事?”
“大蛇丸說：大人存放在他實驗室的一批重要貨物可能有變，需要和大人商議如何處理。”根部又重新跪下，一字不差地重複著大蛇丸交代的說辭。