及後鳴人在自身的查克拉被寧次的點穴術封鎖時，以精神力量召喚出九尾妖狐的強大查克拉，結果反敗為勝，把寧次重擊於地上。
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賽事完結後，雛田的父親日向日足私下尋找寧次，告訴他有關日向日差之死的真相，其後更給寧次看了其父的絕筆。寧次這才恍然大悟，知道父親並不是被宗家迫死，而是自願當犧牲者以保衛日向一族。從此他明白人的生命可自由主宰，而不是受操控的。他把鳴人看成是將他從黑暗之中救出來的人，決意要變得比鳴人更強，和鳴人的關係也大有改變。
佐助營救篇中，他是最後一名加入的小組成員。他本想留下照顧剛手術完畢的李洛克，但李暗示他應該跟隨小組把佐助帶回來，寧次亦明白他的用意。在五人小隊中，他被鹿丸安排在對伍的最後方，利用白眼對四周進行偵察。當被次郎坊的土遁結界圍困時，以白眼觀察出對方在這個結界裏注入查克拉，故土牆被攻擊後會自動恢複，而且對方能透過結界吸取寧次等人的查克拉。但同時他亦從牙的通牙術攻擊中，觀察出結界裏某些地點的查克拉比較弱，在丁次配合下，眾人破土牆而出。
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寧次之後的對手為五音忍中最具分析力、好戰的八足蜘蛛鬼童丸。鬼童丸以蜘蛛束縛術捆著鹿丸、蜘蛛巢開術捕捉鳴人分身及寧次，而牙亦被蜘蛛絲所纏後更用蜘蛛黏金術所成的武器當作飛鏢，擲向鳴人的分身，但當中並沒有真身在內，還差點兒被真正的鳴人從後暗算。與此同時，寧次觀察出鬼童丸所製的蜘蛛絲為查克拉所製，故以柔拳術釋放查克拉並切斷蜘蛛絲，救出了小隊各人。他自願留下拖延鬼童丸，讓鳴人、鹿丸及牙繼續追趕音忍及佐助。
鬼童丸從口中不斷吐出蜘蛛網捕捉寧次，及以黏金術化成的武器對寧次施以攻擊。他以為寧次隻能以手中的查克拉切斷蜘蛛絲。殊不知寧次也能從身上各穴道釋放出查克拉，瞬間便把蜘蛛絲徹底切斷。寧次以柔拳法?八卦六十四掌對鬼童丸施以連擊，把鬼童丸打落樹下。不過，鬼童丸也有從身上各處釋放查克拉的能力，而且他的查克拉更能在接觸空氣時化成金屬鐙甲，故寧次的柔拳術對其無效。寧次亦深明此點。[8]
鬼童丸從戰鬥中了解寧次是擅於近戰的對手，故選擇以遠距離對寧次進行暗殺。他先以假的引爆符欺騙寧次，並射出許多黏金做成的苦無攻擊寧次，但遭到寧次的八卦掌·回天完全防禦，藏匿處更被寧次以白眼看破。
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鬼童丸明白他遇上了一個熟練型的對手，故不得不進入咒印狀態1。鬼童丸再以通靈之術召喚出巨大蜘蛛，並從蜘蛛體內、釋放出許多連接著查克拉蜘蛛絲的小蜘蛛。他的目的就是以蜘蛛絲纏著寧次的回天術，使其轉動減慢，再放出苦無施以暗殺。雖然寧次最終防禦了蜘蛛及苦無，但知道回天術的弱點已被看破，也不能再使用。鬼童丸為了進一步看破寧次白眼的弱點，便放出更多的苦無及小蜘蛛施以襲擊;寧次先後以柔拳·八卦六十四掌及一百二十八掌防禦苦無及蜘蛛，但卻有一支苦無從他的膊頭穿過，使其受傷。鬼童丸立即分析出寧次雖可防禦50米半徑內的遠距離攻擊，及有360度視野，但事實上在其背部胸骨第二節有一處盲點，是其白眼所不能觀察到的。鬼童丸即對這個盲點不斷施以苦無攻擊;及後當寧次以柔拳把下墮的大蜘蛛給打碎後，鬼童丸又乘機放出密集性的苦無攻擊，使寧次重傷倒地。