地球上的科學家們經過長期的不懈努力使人類的科技達到了很高的水平，人類也因此順利地進入了大宇航時代。漸漸的，人類以地球為中心掌握了一定宇宙範圍內的諸多資源。
擁有了豐富資源的人類準備在地球上建造一個擁有世界上最大的鏈式核反應堆的核電廠，而這個核電廠可以供給全球的電能需求。原本以人類現有的科技水平，想要建造一個這樣核電廠並不是什麼難事，而且經過多年的實踐，核電廠的安全方麵也不會出現任何問題。可就在人類信心滿滿地建造這個世界上最大的核電廠的時候，用最新理論設計出的核反應堆保護係統卻出現了一個細小卻足以致命的問題。令人遺憾的是，這個細小卻足以致命的問題竟然被大家理所當然地忽略掉了，甚至在工程竣工驗收和試運行的時候，這個問題都沒能及時被發現。
隨著這個世界上最大的核電廠正式投入使用，世界各地都充斥著各種歡呼聲，卻沒有人意識到毀滅性的災難正在一步一步地向人類逼近。
幾年後的一天，這個世界上最大的核電廠的核反應堆突然在運行中變得極為不穩定，而核反應堆的保護係統卻因為當初那個細小卻足以致命的問題突然罷工了。再加上核電廠的工作人員在慌亂之下的誤操作，更是給極為不穩定的核反應堆帶來了雪上加霜的效果。最後，核反應堆終於因為承受不住巨大的負荷而發生了大爆炸。隨著一朵巨大的蘑菇雲不斷地向外綻放，周圍地表的一切生物和建築設施都開始緩緩地消失不見。地球上的人類也由發達的科技時代一下子回到了原始時代。
這次核電廠的大爆炸波及了整個地球，讓地球上的生態環境遭到了毀滅性的破壞，大地和海洋都受到了嚴重的汙染。大地變得寸草不生，水源也變得無法再飲用，人類已經無法在地球上正常的居住和生活了。這讓之前僥幸逃過一劫的人類幸存者們還沒有從災難的傷痛中恢複過來，就要麵臨食物和水源的問題，還好月球基地及時派出了搜救人員對地球上的這些幸存者們進行了搜救。而除了月球基地外，大宇航時代的人類還有一艘名為“發現號”的星際母艦正在宇宙的“玄雀星係”中執行著探索任務，沒有被卷入到這場災難中。而這艘星際母艦的存在，卻成了人類保留文明火種、沒有徹底走向滅亡的關鍵所在。
發現號星際母艦實際上是人類開發出的一種專門為那些長期進行宇宙探索的人而建造的星際移動城市。目前這種星際母艦級別的星際艦船，也隻有發現號這一艘而已。發現號星際母艦上不但擁有齊全的基礎設施，還可以儲備大量的飲用水，食物也能自給自足。除此之外，發現號星際母艦上還居住著人類各個種族的優秀人才，甚至許多世界級的頂尖科學家也長居於此。而在這些科學家當中，又以生物學領域的科學家居多，他們長居於此的目的很簡單，就是為了能夠在第一時間獲得各種珍貴的生物資源進行研究。
此時，這艘被後世王者大陸上新人類稱之為“方舟”的發現號星際母艦，正在返回地球的路上。而後世王者大陸上的史學家們通過各種手段能夠追溯到的最早的文明起源，也是從這裏開始的……。